ERGIC2 - ERGIC2
Белок 2 промежуточного компартмента эндоплазматического ретикулума-Гольджи (ERGIC2) [5] это ген, расположенный у человека хромосома 12p 11. Кодирует белок из 377 аминокислотных остатков. Белок ERGIC2 также известен как PTX1, CDA14 или Erv41.
Биологическая функция белка ERGIC2 неизвестна, хотя первоначально он был идентифицирован как кандидат в супрессор опухоли рака простаты.[6] и было показано, что он вызывает остановку роста и старение клеток, подавляет образование колоний в мягком агаре и снижает инвазивный потенциал клеточной линии рака простаты человека (клетки PC-3).[7] В настоящее время считается, что это молекула-шаперон, участвующая в белковом торговля людьми между промежуточным компартментом эндоплазматической сети и Гольджи (ERGIC) и Гольджи. Белок содержит два гидрофобных трансмембранных домена, которые помогают закрепить молекулу на мембране ER, так что его большой люминальный домен ориентирован внутри просвета ER, а N- и C-концы обращены к цитозоль. ERGIC2 образует комплекс с двумя другими белками, ERGIC3 и ERGIC32, приводя к челноку для транспортировки белков между ER и Golgi.[8] Было показано, что он взаимодействует с рядом белков, таких как бета-амилоид,[9] фактор элонгации белка 1альфа,[10] и отоферлин.[11] Следовательно, он может играть важную роль в клеточных функциях, помимо того, что он является компонентом челнока для транспортировки белков. Недавно было сообщено о вариантном транскрипте ERGIC2.[12] Он имеет делецию четырех оснований на стыке экзонов 8 и 9, что приводит к мутации со сдвигом рамки считывания после кодона № 189. Вариант транскрипта кодирует усеченный белок из 215 остатков, который теряет 45% люминального домена и трансмембранного домена около С-конца. Это эффективно отменяет его функцию переносчика белка. Похожий вариант встречается и у броненосцев. Так что это не случайная мутация. Функция этого усеченного белка неизвестна.
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000087502 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030304 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Энтрез Джин: ERGIC2 ERGIC и Гольджи 2».
- ^ Квок SC, Лю X, Даскал I (2001). «Молекулярное клонирование, экспрессия, локализация и организация гена PTX1, ядерного белка человека, который подавляется при раке простаты». ДНК клетки биол. 20 (6): 349–57. Дои:10.1089/10445490152122460. PMID 11445006.
- ^ Лю X, Даскал I, Квок СК (2003). «Влияние экспрессии PTX1 на рост и онкогенность линии клеток рака предстательной железы PC-3». ДНК клетки биол. 22 (7): 469–74. Дои:10.1089/104454903322247343. PMID 12932305.
- ^ Бреуза Л., Хальбайзен Р., Йено П. и др. (2004). «Протеомика мембран эндоплазматического ретикулума-промежуточного компартмента Гольджи (ERGIC) из клеток HepG2, обработанных брефельдином А, позволяет идентифицировать ERGIC-32, новый циклический белок, который взаимодействует с Erv46 человека». J. Biol. Chem. 279 (45): 47242–53. Дои:10.1074 / jbc.M406644200. PMID 15308636.
- ^ Нельсон Т.Дж., Алкон Д.Л. (2007). «Защита от апоптоза, вызванного бета-амилоидом, с помощью пептидов, взаимодействующих с бета-амилоидом». J Biol Chem. 282 (43): 31238–49. Дои:10.1074 / jbc.M705558200. PMID 17761669.
- ^ Ян Ю.Ф., Чжоу М.Ю., Фан Ц.И., Чен С.Ф., Лю ПК, Лю С.К., Цзэн Т.Л. (2008). «Возможное взаимодействие CDA14 и фактора элонгации белка 1альфа». Biochim Biophys Acta. 1784 (2): 312–8. Дои:10.1016 / j.bbapap.2007.10.006. PMID 17980171.
- ^ Зак М., Брес А., Брандт Н., Франц С., Рут П., Пфистер М., Книппер М., Блин Н. (2012). «Ergic2, мозговой специфический взаимодействующий партнер отоферлина». Cell Physiol Biochem. 29 (5–6): 941–8. Дои:10.1159/000188338. PMID 22613993.
- ^ Квок СК, Кумар С., Дай Г. (2014). «Характеристика варианта транскрипта ERGIC2». ДНК клетки биол. 33 (2): 73–78. Дои:10.1089 / dna.2013.2225. PMID 24303950.
дальнейшее чтение
- Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID 8889548.
- Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
- Kwok SC, Лю X, Mangel P, Daskal I (2006). «Слитый белок PTX1 (ERGIC2) -VP22 активирует бета-интерферон в клеточной линии PC-3 рака простаты». ДНК клетки биол. 25 (9): 523–9. Дои:10.1089 / dna.2006.25.523. PMID 16989575.
 | Эта статья о ген на хромосома человека 12 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |