FNBP1 - FNBP1

FNBP1
Белок FNBP1 PDB 2efl.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыFNBP1, FBP17, формин-связывающий белок 1
Внешние идентификаторыOMIM: 606191 MGI: 109606 ГомолоГен: 100983 Генные карты: FNBP1
Расположение гена (человек)
Хромосома 9 (человек)
Chr.Хромосома 9 (человек)[1]
Хромосома 9 (человек)
Геномное расположение FNBP1
Геномное расположение FNBP1
Группа9q34.11Начните129,887,187 бп[1]
Конец130,043,194 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE FNBP1 213940 s в формате fs.png

PBB GE FNBP1 212288 в fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_015033
NM_001363755

RefSeq (белок)

NP_055848
NP_001350684

Расположение (UCSC)Chr 9: 129,89 - 130,04 МбChr 2: 31.03 - 31.14 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Формин-связывающий белок 1 это белок что у людей кодируется FNBP1 ген.[5][6][7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства формин-связывающих белков. Белок содержит домен гомологии (FCH) с N-концевым Fer / Cdc42-взаимодействующим белком 4 (CIP4), за которым следует домен спиральной спирали, мотив, богатый пролином, второй домен спиральной спирали, домен, связывающий белок семейства Rho. (RBD) и C-концевой SH3 домен. Этот белок связывает сортирующий нексин 2 (SNX2), танкиразу (TNKS) и динамин; взаимодействие между этим белком и формином еще не было продемонстрировано у человека.[7]

Взаимодействия

FNBP1 был показан взаимодействовать с участием:

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000187239 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000075415 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Нагасе Т., Исикава К., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О. (август 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (1): 31–9. Дои:10.1093 / днарес / 5.1.31. PMID  9628581.
  6. ^ а б Fuchs U, Rehkamp G, Haas OA, Slany R, Kōnig M, Bojesen S, Bohle RM, Damm-Welk C, Ludwig WD, Harbott J, Borkhardt A (июль 2001 г.). «Человеческий формин-связывающий белок 17 (FBP17) взаимодействует с сортирующим нексином, SNX2, и является партнером слияния MLL при остром миелогенном лейкозе». Proc Natl Acad Sci U S A. 98 (15): 8756–61. Дои:10.1073 / pnas.121433898. ЧВК  37508. PMID  11438682.
  7. ^ а б «Ген Entrez: FNBP1 формин-связывающий белок 1».
  8. ^ Ларокка М.С., Шанкс Р.А., Тиан Л., Нельсон Д.Л., Стюарт Д.М., Голденринг-младший (июнь 2004 г.). «Взаимодействие AKAP350 с cdc42 взаимодействующим белком 4 в аппарате Гольджи». Мол. Биол. Ячейка. 15 (6): 2771–81. Дои:10.1091 / mbc.E03-10-0757. ЧВК  420101. PMID  15047863.
  9. ^ Камиока Ю., Фукухара С., Сава Х, Нагашима К., Масуда М., Мацуда М., Мотидзуки Н. (сентябрь 2004 г.). «Новая связывающая динамин молекула, формин-связывающий белок 17, вызывает инвагинации канальцевых мембран и участвует в эндоцитозе». J. Biol. Chem. 279 (38): 40091–9. Дои:10.1074 / jbc.M404899200. PMID  15252009.
  10. ^ Гадими М.П., ​​Санзенбахер Р., Тиде Б., Венцель Дж., Цзин К., Пломанн М., Боркхардт А., Кабелиц Д., Янссен О. (май 2002 г.). «Идентификация партнеров взаимодействия цитозольной полипролиновой области лиганда CD95 (CD178)». FEBS Lett. 519 (1–3): 50–8. Дои:10.1016 / s0014-5793 (02) 02709-6. PMID  12023017. S2CID  26765451.
  11. ^ а б Fuchs U, Rehkamp GF, Slany R, Follo M, Borkhardt A (ноябрь 2003 г.). «Формин-связывающий белок 17, FBP17, связывается через мотив связывания TNKS с танкиразой, белком, участвующим в поддержании теломер». FEBS Lett. 554 (1–2): 10–6. Дои:10.1016 / s0014-5793 (03) 01063-9. PMID  14596906. S2CID  19552309.

дальнейшее чтение