FUSIP1 - FUSIP1

SRSF10
Идентификаторы
ПсевдонимыSRSF10, FUSIP1, FUSIP2, NSSR, PPP1R149, SFRS13, SFRS13A, SRp38, SRrp40, TASR, TASR1, TASR2, фактор сплайсинга, богатый серином / аргинином 10, фактор сплайсинга, богатый серином и аргинином 10
Внешние идентификаторыOMIM: 605221 MGI: 1333805 ГомолоГен: 134051 Генные карты: SRSF10
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение SRSF10
Геномное расположение SRSF10
Группа1п36.11Начните23,964,347 бп[1]
Конец23,980,927 бп[1]
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001080387
NM_001284195
NM_001284196
NM_010178

RefSeq (белок)

NP_001073856
NP_001271124
NP_001271125
NP_034308

Расположение (UCSC)Chr 1: 23.96 - 23.98 МбChr 4: 135,86 - 135,87 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

FUS-взаимодействующий протеин 1, богатый серином и аргинином это белок что у людей кодируется SFRS13A ген.[5][6][7]

Функция

Этот генный продукт входит в группу серин-аргинин (SR ) семейство белков, которое участвует в конститутивном и регулируемом сплайсинге РНК. Члены этого семейства характеризуются N-концевыми мотивами RNP1 и RNP2, которые необходимы для связывания с РНК, и множественными С-концевыми повторами SR / RS, которые важны для опосредования ассоциации с другими клеточными белками. Этот белок может влиять на выбор сайта сплайсинга пре-мРНК аденовируса E1A. Он взаимодействует с TLS онкобелка и устраняет влияние TLS на сплайсинг пре-мРНК E1A. Альтернативная сварка этого гена приводит как минимум к двум вариантам транскрипта, кодирующим разные изоформы. Кроме того, существуют варианты транскриптов, использующие альтернативные сайты полиА.[7]

Взаимодействия

FUSIP1 был показан взаимодействовать с участием FUS.[8]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000188529 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028676 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Ян Л., Эмбри Л. Дж., Цай С., Хикштейн Д. Д. (ноябрь 1998 г.). «Онкопротеин TLS взаимодействует с серин-аргининовыми белками, участвующими в сплайсинге РНК». J. Biol. Chem. 273 (43): 27761–4. Дои:10.1074 / jbc.273.43.27761. PMID  9774382.
  6. ^ Клинтон Дж. М., Чански Х. А., Оделл Д. Д., Зелинска-Квятковска А., Хикштейн Д. Д., Ян Л. (март 2002 г.). «Характеристика и экспрессия человеческого гена, кодирующего два белка серин-аргинина, ассоциированных с транслокационной липосаркомой (TASR)». Ген. 284 (1–2): 141–7. Дои:10.1016 / S0378-1119 (02) 00382-7. PMID  11891055.
  7. ^ а б «Ген Entrez: FUSIP1 FUS взаимодействующий белок (богатый серином / аргинином) 1».
  8. ^ Ян Л., Эмбри Л.Дж., Хикштейн Д.Д. (май 2000 г.). «Слитый белок лейкемии TLS-ERG ингибирует сплайсинг РНК, опосредованный серин-аргининовыми белками». Мол. Cell. Биол. 20 (10): 3345–54. Дои:10.1128 / MCB.20.10.3345-3354.2000. ЧВК  85627. PMID  10779324.

дальнейшее чтение