ГАЗ5 - GAS5

ГАЗ5
Идентификаторы
ПсевдонимыГАЗ5, NCRNA00030, SNHG2, специфическая задержка роста 5 (небелковое кодирование)
Внешние идентификаторыOMIM: 608280 Генные карты: ГАЗ5
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение GAS5
Геномное расположение GAS5
Группа1q25.1Начинать173,863,900 бп[1]
Конец173,868,882 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

н / д

н / д

RefSeq (белок)

н / д

н / д

Расположение (UCSC)Chr 1: 173,86 - 173,87 Мбн / д
PubMed поиск[2]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Специфично для остановки роста 5 небелковое кодирование РНК что у человека кодируется GAS5 ген.[3][4]

ГАЗ5 некодирующая РНК, который накапливается в клетках с задержкой роста, действует как приманка гормональный ответный элемент для рецептор глюкокортикоидов (GR) и, следовательно, блокирует усиление экспрессии генов активированным GR.[5][6]

Ряд исследований связали GAS5 с апоптоз и это может играть роль в развитии некоторых типов рак.[7][8][9]

Интроны GAS5 содержат несколько snoRNA последовательности, включая SNORD81, SNORD47, SNORD80, SNORD79, SNORD78, SNORD44, SNORD77, SNORD76, SNORD75 и SNORD74.[4][10][11][12] Эти интронные последовательности более консервативны, чем экзоны гена-хозяина, такие гены часто называют «генами наизнанку».[13]

Недавно было обнаружено, что нонсенс-опосредованный путь деградации может регулировать функцию GAS5 в клетках млекопитающих.[14]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000234741 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ «Ген Entrez: специфическая задержка роста 5 (кодирование белка)».
  4. ^ а б Smith, C.M .; Стейтц, Дж. А. (декабрь 1998 г.). "Классификация газ5 как ген хозяина с несколькими малыми ядрышками РНК (мяРНК) и член семейства 5'-концевых олигопиримидиновых генов обнаруживает общие черты генов хозяина мяРНК ». Молекулярная и клеточная биология. 18 (12): 6897–6909. Дои:10.1128 / mcb.18.12.6897. ЧВК  109273. PMID  9819378.
  5. ^ Kino T, Hurt DE, Ichijo T, Nader N, Chrousos GP (2010). «Некодирующая РНК Gas5 является репрессором глюкокортикоидного рецептора, связанным с задержкой роста и голоданием». Научный сигнал. 3 (107): ra8. Дои:10.1126 / scisignal.2000568. ЧВК  2819218. PMID  20124551.
  6. ^ Гарабедян MJ, Логан СК (2010). «Приманка, связывающая ДНК глюкокортикоидного рецептора, представляет собой газ». Научный сигнал. 3 (108): pe5. Дои:10.1126 / scisignal.3108pe5. PMID  20145207.
  7. ^ Муртада-Маарабуни М, Пикард М.Р., Хедж В.Л., Фарзане Ф., Уильямс ГТ (2009). «GAS5, небелковая РНК, контролирует апоптоз и подавляется при раке груди». Онкоген. 28 (2): 195–208. Дои:10.1038 / onc.2008.373. PMID  18836484.
  8. ^ Накамура Ю., Такахаши Н., Какегава Е., Ёсида К., Ито Ю., Каяно Н., Нийцу Н., Джиннай И., Бесшо М. (2008). «Ген GAS5 (специфический для остановки роста транскрипт 5) сливается с BCL6 в результате t (1; 3) (q25; q27) у пациента с B-клеточной лимфомой». Рак Genet Cytogenet. 182 (2): 144–9. Дои:10.1016 / j.cancergencyto.2008.01.013. PMID  18406879.
  9. ^ Муртада-Маарабуни М, Хедж В.Л., Киркхэм Л., Фарзане Ф., Уильямс ГТ (2008). «Остановка роста Т-клеток человека контролируется некодирующим РНК-специфическим для остановки роста транскриптом 5 (GAS5)». J Cell Sci. 121 (Pt 7): 939–46. Дои:10.1242 / jcs.024646. PMID  18354083.
  10. ^ Танака Р., Сато Х., Морияма М., Сато К., Моришита Ю., Ёсида С., Ватанабэ Т., Накамура И., Мори С. (2000). «Ген-хозяин малой ядрышковой РНК (мяРНК) Intronic U50, не обладающий потенциалом кодирования белка, картирован в точке разрыва хромосомы t (3; 6) (q27; q15) В-клеточной лимфомы человека». Гены Клетки. 5 (4): 277–87. Дои:10.1046 / j.1365-2443.2000.00325.x. PMID  10792466.
  11. ^ Рахо Г., Бароне В., Росси Д., Филипсон Л., Соррентино В. (2000). «Ген gas 5 показывает четыре альтернативных паттерна сплайсинга без кодирования белка». Ген. 256 (1–2): 13–7. Дои:10.1016 / S0378-1119 (00) 00363-2. PMID  11054530.
  12. ^ Хиросе Т., Стейтц Дж. А. (2001). «Положение в интроне хозяина имеет решающее значение для эффективного процессинга snoRNA C / D бокса в клетках млекопитающих». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (23): 12914–9. Дои:10.1073 / pnas.231490998. ЧВК  60799. PMID  11606788.
  13. ^ Эдди SR (1999). «Гены некодирующей РНК». Текущее мнение в области генетики и развития. 9 (6): 695–9. Дои:10.1016 / S0959-437X (99) 00022-2. PMID  10607607.
  14. ^ Тани Х., Торимура М., Акимицу Н. (2013). «Путь деградации РНК регулирует функцию GAS5, некодирующую РНК в клетках млекопитающих». PLOS ONE. 8 (1): e556884. Дои:10.1371 / journal.pone.0055684. ЧВК  3559549. PMID  23383264.

дальнейшее чтение