Захват генов - Википедия - Gene trapping
Захват генов это высокая пропускная способность подход, который используется для введения инсерционного мутации по геному организма.
Метод
Захват осуществляется с помощью векторов-ловушек для генов, основным элементом которых является кассета для улавливания генов, состоящая из репортерного гена без промотора и / или выбираемого генетический маркер, фланкированный восходящим 3 'сайтом сплайсинга (акцептор сплайсинга; SA) и нижележащим транскрипционный последовательность завершения (полиаденилирование последовательность; полиА).
При вставке в интрон экспрессируемого гена кассета-ловушка для гена транскрибируется с эндогенного промотора этого гена в форме слитого транскрипта, в котором экзон (ы), расположенный выше сайта вставки, сплайсирован в рамке с геном-репортером / селективным маркером. Поскольку транскрипция преждевременно обрывается на вставленном сайте полиаденилирования, обработанный гибридный транскрипт кодирует усеченную и нефункциональную версию клеточного белок и репортер / выбираемый маркер. Таким образом, генные ловушки одновременно инактивируют и сообщают об экспрессии захваченного гена в сайте встраивания и обеспечивают ДНК tag (тег последовательности генной ловушки, GTST) для быстрой идентификации нарушенного ген.[1][2]
Доступ
Международный консорциум генных ловушек централизует данные и поставляет модифицированные клеточные линии.[3]
Рекомендации
- ^ Cobellis, G; Николаус, G; и другие. (2005). «Маркировка генов с помощью сайтов обмена кассет». Нуклеиновые кислоты Res. 33 (4): e44. Дои:10.1093 / nar / gni045. ЧВК 552971. PMID 15741177.
- ^ Де-Золт, С; Schnutgen, F; и другие. (2006). «Высокая пропускная способность улавливания генов секреторного пути в эмбриональных стволовых клетках мыши». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (3): 25.
- ^ "IGTC, Международный консорциум генных ловушек". www.genetrap.org. Получено 2018-02-11.
дальнейшее чтение
- Госслер А., Джойнер А.Л., Россант Дж., Скарнес В.К. (апрель 1989 г.). «Эмбриональные стволовые клетки мыши и репортерные конструкции для обнаружения генов, регулируемых развитием». Наука. 244 (4903): 463–5. Дои:10.1126 / science.2497519. PMID 2497519.
- фон Мельхнер Х., Рулей Х.Э. (август 1989 г.). «Идентификация клеточных промоторов с помощью ловушки промотора ретровируса». Журнал вирусологии. 63 (8): 3227–33. ЧВК 250892. PMID 2545900.
- Фридрих Г., Сориано П. (сентябрь 1991 г.). «Промоторные ловушки в эмбриональных стволовых клетках: генетический скрининг для выявления и мутации генов развития у мышей». Гены и развитие. 5 (9): 1513–23. Дои:10.1101 / gad.5.9.1513. PMID 1653172.
- Замбрович Б.П., Фридрих Г.А., Бакстон Э.С., Лиллеберг С.Л., человек С., Сэндс А.Т. (апрель 1998 г.). «Нарушение и идентификация последовательности 2000 генов в эмбриональных стволовых клетках мыши». Природа. 392 (6676): 608–11. Дои:10.1038/33423. PMID 9560157.
- Wiles MV, Vauti F, Otte J, Füchtbauer EM, Ruiz P, Füchtbauer A, Arnold HH, Lehrach H, Metz T, von Melchner H, Wurst W (январь 2000 г.). «Создание библиотеки тегов последовательности генной ловушки для создания мутантных мышей из эмбриональных стволовых клеток». Природа Генетика. 24 (1): 13–4. Дои:10.1038/71622. PMID 10615117.
- Стэнфорд В.Л., Кон Дж. Б., Кордес С. П. (октябрь 2001 г.). «Мутагенез генных ловушек: прошлое, настоящее и будущее». Обзоры природы. Генетика. 2 (10): 756–68. Дои:10.1038/35093548. PMID 11584292.
- Скарнес В.К., фон Мельхнер Х., Вурст В., Хикс Г., Норд А.С., Кокс Т., Янг С.Г., Руис П., Сориано П., Тессье-Лавин М., Конклин Б.Р., Стэнфорд В.Л., Россант Дж. (Июнь 2004 г.). «Общедоступный ресурс по генной ловушке для функциональной геномики мышей». Природа Генетика. 36 (6): 543–4. Дои:10.1038 / ng0604-543. ЧВК 2716026. PMID 15167922.
- Хансен Дж., Флосс Т., Ван Слоун П., Фюхтбауэр Е.М., Ваути Ф., Арнольд Х. Х., Шнютген Ф., Вурст В., фон Мельхнер Х., Руис П. (август 2003 г.). «Крупномасштабный подход к генному мутагенезу для функционального анализа генома мыши». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (17): 9918–22. Дои:10.1073 / pnas.1633296100. ЧВК 187885. PMID 12904583.
- Замбрович Б.П., Абуин А., Рамирес-Солис Р., Рихтер Л.Дж., Пигготт Дж., БелтранделРио Х. и др. (Ноябрь 2003 г.). «Дефицит киназы Wnk1 снижает кровяное давление у мышей: скрининг генных ловушек для выявления потенциальных целей для терапевтического вмешательства». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (24): 14109–14. Дои:10.1073 / pnas.2336103100. ЧВК 283554. PMID 14610273.
- Schnütgen F, De-Zolt S, Van Sloun P, Hollatz M, Floss T., Hansen J, Altschmied J, Seisenberger C, Ghyselinck NB, Ruiz P, Chambon P, Wurst W., von Melchner H (май 2005 г.). «Полногеномное производство многоцелевых аллелей для функционального анализа генома мыши». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 102 (20): 7221–6. Дои:10.1073 / pnas.0502273102. ЧВК 1129123. PMID 15870191.
- Springer PS (июль 2000 г.). «Генные ловушки: инструменты для развития растений и геномики». Растительная клетка. 12 (7): 1007–20. Дои:10.2307/3871251. JSTOR 3871251. ЧВК 149045. PMID 10899970.