Вирус виноградной лозы Пино Гри - Grapevine Pinot gris virus
| Вирус виноградной лозы Пино Гри | |
|---|---|
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область: | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Kitrinoviricota |
| Учебный класс: | Alsuviricetes |
| Заказ: | Tymovirales |
| Семья: | Бетафлексивирусы |
| Род: | Триховирус |
| Разновидность: | Вирус виноградной лозы Пино Гри |
Вирус виноградной лозы Пино Гри (GPGV) - это положительный смысл одноцепочечной РНК вируса в роду Триховирус. Влияет на рост виноградная лоза листья и плоды растений и похож на вирус внутреннего некроза ягод виноградной лозы.
История
Виноградники на северо-западе Италии начали замечать симптомы GPGV в 2003 году. Первыми двумя пострадавшими виноградниками были Пиана Роталиана и Коллио в Трентино-Альто-Адидже. Оттуда вирус распространился на виноградники по всему Трентино-Альто-Адидже и Фриули-Венеция-Джулия, затем в Эмилии-Романье и Венето. Впервые вирус был идентифицирован на виноградных лозах Пино Гри, отсюда и название, но вскоре распространился на другие сорта. В 2011 году Annalisa Giampetruzzi et al. опубликовал статью в журнале Вирусные исследования официальная идентификация и название вируса.[1] Джампетруцци и ее коллеги использовали глубокое секвенирование, чтобы найти сходство с другими вирусами, и обнаружили участки вирусного РНК-генома, соответствующие последовательностям, обнаруженным в РНК-геномах как вируса внутреннего некроза ягод виноградной лозы (GINV), так и вируса, связанного с язвой стеблей винограда Rupestris ). Также были обнаружены меньшие проценты других вирусных геномов. Поскольку его полная геномная последовательность не может быть найдена в База данных эталонных последовательностей NCBI, геном был признан полностью новым, а вирус официально получил название Grapevine Pinot gris virus. Вирус был признан Национальным агентством защиты растений Италии в феврале 2014 года.[2] и ProMEDMail опубликовали первый отчет о его существовании. После прибытия в различные районы Италии было обнаружено, что вирус распространяется по Европе, а в декабре 2014 года был обнаружен в Чешской и Словацкой республиках.[3] В ноябре 2015 года вирус был обнаружен в Калифорнии,[4] а в апреле 2016 года он был обнаружен на китайских виноградниках в провинциях Ляонин, Пекин и Чжэцзян.[5] Самая последняя вспышка вируса произошла в Австралии в августе 2017 года.[6]
Классификация
GPGV - это вирус с положительной одноцепочечной РНК,[1] это означает, что геном вируса состоит из РНК нуклеотиды. Хотя Джампетруцци и ее коллеги обнаружили, что геном имеет сходство с марафивирусами Grapevine Syrah virus-1 и Grapevine Rupestris вирусом оперения вен, было обнаружено, что он больше похож на Триховирус род. Помимо GINV, другие триховирусы включают: Вирус хлоротичной пятнистости листьев яблони, Вирус псевдохлоротической пятнистости листьев абрикоса, Вирус крапчатости листьев вишни и вирус мозаики персика.[7]
Структура генома
Giampetruzzi et al. первоначально сообщили о полной согласованной последовательности 7258 нуклеотиды (за исключением хвоста полиА), что составляет три перекрывающиеся рамки считывания (ORF). Длина каждой ORF в парах оснований, вес в килодальтонах и белки /ферменты коды которых указаны в таблице ниже. Затем последовательность продолжается с нетранслируемой областью из 82 пар оснований и оканчивается на полиА-хвосте, что типично для вирусных геномов.
| Длина | Масса | Ферменты | Примечания | |
|---|---|---|---|---|
| ORF1 | 1865 | 214 кДа | Связанные с репликазой белки, метилтрансфераза, геликаза и RdRp | Также содержит домен AlkB и коды для Fe2+ координационные мотивы и остатки |
| ORF2 | 376 | 42 кДа | Белки движения, гомологичные белкам вируса хлоротичной пятнистости листьев яблони | |
| ORF3 | 195 | 22 кДа | Предполагаемый белок оболочки |
Симптомы
Симптомы наиболее заметны весной, когда начинают расти новые побеги и листья.[6] Симптомы GPGV включают хлоротичную пятнистость листьев, деформацию листьев, задержку роста, низкокачественные плоды, аномальное ветвление и снижение урожайности.[8] Наиболее частые симптомы - пятнистость и деформация листьев.[9] Другие отмеченные симптомы - это задержка распускания бутонов, укороченные междоузлия и более кислые ягоды. Также важно отметить, что у зараженных растений симптомы могут даже не проявляться.[6]
Цикл репликации
Цикл репликации этого вируса в настоящее время неизвестен. Возможное резервуары может включать насекомых, клещей или нематоды. Основываясь на недавнем открытии вируса, по этому аспекту было проведено не так много исследований.
Распространение вируса
Принято считать, что этот вирус распространяется через зараженные машины, материалы и инструменты для размножения и, возможно, при торговле размноженными стеблями между виноградниками.[8]
Рекомендации
- ^ а б Джампетруцци, Анналиса и др. «Новый вирус виноградной лозы, обнаруженный глубоким секвенированием малых РНК, полученных из вирусов и вироидов, в сорте Пино Гри». Вирусные исследования, т. 163, нет. 1, 2012, стр. 262–268, DOI: 10.1016 / j.virusres.2011.10.010.
- ^ http://archives.eppo.int/EPPOReporting/2014/Rse-1401.pdf
- ^ http://archives.eppo.int/EPPOReporting/2014/Rse-1411.pdf
- ^ «В Калифорнии обнаружен новый вирус виноградной лозы: виноградная лоза Пино Гри ...» www.winebusiness.com. Получено 4 ноября 2017.
- ^ http://archives.eppo.int/EPPOReporting/2016/Rse-1603.pdf
- ^ а б c «В Австралии обнаружен вирус Пино Гри». 10 августа 2017 г.. Получено 4 ноября 2017.
- ^ «Полные геномы: триховирус». www.ncbi.nlm.NIH.gov. Получено 7 ноября 2017.
- ^ а б http://www.iobc-wprs.org/pub/2013_WG_Viticulture_meeting_Ascona_CH/20-Ghidoni.pdf
- ^ «Новая болезнь итальянских виноградников». Получено 4 ноября 2017.