HHIPL1 - Википедия - HHIPL1

HHIPL1
Идентификаторы
ПсевдонимыHHIPL1, KIAA1822, UNQ9245, HHIP как 1
Внешние идентификаторыMGI: 1919265 ГомолоГен: 81985 Генные карты: HHIPL1
Расположение гена (человек)
Хромосома 14 (человек)
Chr.Хромосома 14 (человек)[1]
Хромосома 14 (человек)
Геномное расположение HHIPL1
Геномное расположение HHIPL1
Группа14q32.2Начинать99,645,110 бп[1]
Конец99,680,569 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

84439

214305

Ансамбль

ENSG00000182218

ENSMUSG00000021260

UniProt

Q96JK4

Q14DK5

RefSeq (мРНК)

NM_001127258
NM_032425
NM_001329411

NM_001044380

RefSeq (белок)

NP_001120730
NP_001316340
NP_115801

NP_001037845

Расположение (UCSC)Chr 14: 99,65 - 99,68 МбChr 12: 108.31 - 108.33 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

HHIP-подобный белок 1 (HHIPL1), также известный как HHIP2, является белок что у людей кодируется HHIPL1 ген на хромосома 14.[5] Он незначительно экспрессируется во многих тканях и типах клеток,[6] хотя HHIPL1 мРНК был обнаружен в губчатая кость клетки.[7] Мало что известно о точной биологической функции HHIPL1, но белок был связан с аденомы.[8] В HHIPL1 ген также содержит один из 27 SNP связано с повышенным риском ишемическая болезнь сердца.[9]

Структура

Ген

В HHIPL1 ген находится на хромосоме 14 на полосе 14q32 и содержит 13 экзоны.[5] Этот ген производит 2 изоформы через альтернативное сращивание.[10]

Протеин

Этот белок относится к HHIP семьи и является одним из трех членов, обнаруженных у людей.[10] HHIPL1 содержит SRCR домен и N-концевой сигнальный пептид.[7][10] Обработка сигнального пептида приводит к секреция. Как член HHIP, он также содержит консервативный HHIP-гомологичный домен (HIPH), состоящий из 18 цистеин остатки.[7]

Функция

Функция HHIPL1 неизвестна. Раздел ниже относится к функции HHIP.

Функция HHIP не очень хорошо известна, но было показано, что она тесно связана с функцией легких. Нокаут HHIP у мышей смертельно опасен для новорожденных из-за дефекта ветвления в легких.[11][12] Было показано, что гетерозиготный нокаут HHIP способствует более тяжелым эмфизема индуцированный сигаретным дымом по сравнению с мышами дикого типа.[13] Кроме того, увеличивалась спонтанная эмфизема и окислительный стресс уровни были обнаружены в легких HHIP гетерозиготный мышей.[14] Как уровень экспрессии, так и энхансерная активность HHIP снижаются в хроническая обструктивная болезнь легких (ХОБЛ) легкие, предполагая защитную роль HHIP в патогенезе ХОБЛ.[15]

Клиническое значение

Метилирование ДНК - одна из нескольких эпигенетических модификаций, признанных признаками туморогенеза. В полногеномном обзоре эпигеномных изменений подтипа аденомы ген HHIPL1 был гиперметилирован в 12 из 13 нефункционирующих (NF) аденом, а также в аденомах, секретирующих гормон роста (GH) и пролектин. Таким образом, HHIPL1 может служить биомаркером для прогнозирования или характеристики структуры опухолевого роста.[8] В отличие от другого члена семейства генов HHIP человека, HHIP, который рассматривается как фармакогеномная мишень в областях онкологии и сосудистой медицины, HHIPL1 еще не сообщался с таким потенциалом.[7]

Кроме того, в области сердечно-сосудистой системы HHIPL1 был связан с ИБС у европейцев, жителей Южной Азии и у населения Японии.[16][17] Однако в другом исследовании, основанном на популяции Японии, эту ассоциацию не удалось воспроизвести, что позволяет предположить, что эта ассоциация является специфической для населения.[18]

Клинический маркер

Мультилокусное исследование генетической шкалы риска, основанное на комбинации 27 локусов, включая ген HHIFL1, выявило лиц с повышенным риском как эпизодов, так и рецидивов ишемической болезни сердца, а также увеличения клинической пользы от терапии статинами. Исследование было основано на когортном исследовании сообщества (исследование Malmo Diet and Cancer) и четырех дополнительных рандомизированных контролируемых исследованиях когорт первичной профилактики (JUPITER и ASCOT) и когорт вторичной профилактики (CARE и PROVE IT-TIMI 22).[9]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000182218 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021260 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «HHIPL1 HHIP like 1 [Homo sapiens] - Gene». Национальный центр биотехнологической информации (NCBI). Получено 2016-10-06.
  6. ^ «BioGPS - ваша система генного портала». biogps.org. Получено 2016-10-06.
  7. ^ а б c d Като Ю., Като М. (февраль 2006 г.). «Сравнительная геномика по ортологам семейства HHIP». Международный журнал молекулярной медицины. 17 (2): 391–5. Дои:10.3892 / ijmm.17.2.391. PMID  16391842.
  8. ^ а б Duong CV, Emes RD, Wessely F, Yacqub-Usman K, Clayton RN, Farrell WE (декабрь 2012 г.). «Количественный, полногеномный анализ метилома ДНК спорадических аденом гипофиза». Эндокринный рак. 19 (6): 805–16. Дои:10.1530 / ERC-12-0251. PMID  23045325.
  9. ^ а б Mega JL, Stitziel NO, Smith JG, Chasman DI, Caulfield MJ, Devlin JJ и др. (Июнь 2015 г.). «Генетический риск, события ишемической болезни сердца и клиническая польза от терапии статинами: анализ испытаний первичной и вторичной профилактики». Ланцет. 385 (9984): 2264–71. Дои:10.1016 / S0140-6736 (14) 61730-X. ЧВК  4608367. PMID  25748612.
  10. ^ а б c «HHIPL1 - предшественник HHIP-подобного белка 1 - Homo sapiens (Человек) - ген и белок HHIPL1». UniProt. Получено 2016-10-06.
  11. ^ Chuang PT, Kawcak T, McMahon AP (февраль 2003 г.). «Контроль обратной связи передачи сигналов Hedgehog у млекопитающих с помощью Hedgehog-связывающего белка, Hip1, модулирует передачу сигналов Fgf во время морфогенеза ветвления легких». Гены и развитие. 17 (3): 342–7. Дои:10.1101 / gad.1026303. ЧВК  195990. PMID  12569124.
  12. ^ Chuang PT, McMahon AP (февраль 1999 г.). «Передача сигналов Hedgehog позвоночных, модулируемая индукцией Hedgehog-связывающего белка». Природа. 397 (6720): 617–21. Bibcode:1999Натура.397..617C. Дои:10.1038/17611. PMID  10050855.
  13. ^ Лао Т., Гласс К., Цю В., Полверино Ф., Гупта К., Морроу Дж. И др. (01.01.2015). «Гаплонедостаточность белка, взаимодействующего с Hedgehog, вызывает усиление эмфиземы, вызванной сигаретным дымом, из-за перенастройки сети». Геномная медицина. 7 (1): 12. Дои:10.1186 / s13073-015-0137-3. ЧВК  4355149. PMID  25763110.
  14. ^ Лао Т., Цзян Цзинь, Юн Дж., Цю В., Гуо Ф, Хуанг С. и др. (Август 2016 г.). «Гаплонедостаточность Hhip повышает чувствительность мышей к возрастной эмфиземе». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 113 (32): E4681-7. Дои:10.1073 / pnas.1602342113. ЧВК  4987811. PMID  27444019.
  15. ^ Чжоу X, Барон Р. М., Хардин М., Чо М. Х., Зелински Дж., Гаврилкевич И. и др. (Март 2012 г.). «Идентификация генетической детерминанты хронической обструктивной болезни легких, которая регулирует HHIP». Молекулярная генетика человека. 21 (6): 1325–35. Дои:10.1093 / hmg / ddr569. ЧВК  3284120. PMID  22140090.
  16. ^ Schunkert H, König IR, Kathiresan S, Reilly MP, Assimes TL, Holm H и др. (Апрель 2011 г.). «Крупномасштабный ассоциативный анализ выявил 13 новых локусов восприимчивости к ишемической болезни сердца». Природа Генетика. 43 (4): 333–8. Дои:10,1038 / нг.784. ЧВК  3119261. PMID  21378990.
  17. ^ Педен Дж. Ф. (апрель 2011 г.). «Полногеномное ассоциативное исследование европейцев и выходцев из Южной Азии выявило пять новых локусов ишемической болезни сердца». Природа Генетика. 43 (4): 339–44. Дои:10,1038 / нг.782. PMID  21378988.
  18. ^ Дечаметакун С., Икеда С., Араи Т., Сато Н., Савабе М., Мурамацу М. (01.01.2014). «Связь между полиморфизмами CDKN2A / B, ADTRP и PDGFD и развитием коронарного атеросклероза у японских пациентов». Журнал атеросклероза и тромбоза. 21 (7): 680–90. Дои:10.5551 / jat.22640. PMID  24573017.