HMG20B - HMG20B

HMG20B
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2CRJ
Идентификаторы
Псевдонимы	HMG20B, BRAF25, BRAF35, HMGX2, HMGXB2, PP7706, SMARCE1r, SOXL, pp8857, группа высокой мобильности 20B
Внешние идентификаторы	OMIM: 605535 MGI: 1341190 ГомолоГен: 74949 Генные карты: HMG20B
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 19 (человек)
Конец	3,579,088 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 10 (мышь)
Конец	81,350,480 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• активность гетеродимеризации белков; • Связывание ДНК; • GO: 0001948 связывание с белками; • активность гистондеацетилазы; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• ядро клетки; • нуклеоплазма; • хромосома; • ядерное тело;
Биологический процесс	• дифференциация клеток скелетных мышц; • клеточный цикл; • отрицательная регуляция сумоилирования белков; • коагуляция крови; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • положительная регуляция дифференцировки нейронов; • транскрипция, ДНК-шаблон; • деацетилирование гистонов; • организация хроматина; • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	10362
	15353
	ENSG00000064961
	ENSMUSG00000020232
	Q9P0W2
	Q9Z104
	NM_006339
	NM_001163165; NM_001163166; NM_010440
	NP_006330
	NP_001156637; NP_001156638; NP_034570
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Связанный с SWI / SNF матрикс-зависимый актин-зависимый регулятор хроматина подсемейства E, связанный с членом 1 это белок что у людей кодируется HMG20B ген.^[5]^[6]

Взаимодействия

HMG20B был показан взаимодействовать с:

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000064961 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020232 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Sumoy L, Carim L, Escarceller M, Nadal M, Gratacòs M, Pujana MA, Estivill X, Peral B (июнь 2000 г.). «HMG20A и HMG20B картируются в человеческих хромосомах 15q24 и 19p13.3 и составляют отдельный класс генов HMG-бокса с повсеместной экспрессией». Цитогенетика и клеточная генетика. 88 (1–2): 62–7. Дои:10.1159/000015486. PMID 10773667. S2CID 22921110.
^ "Entrez Gene: группа высокой мобильности HMG20B 20B".
^ ^а ^б ^c ^d ^е Хакими М.А., Бочар Д.А., Ченовет Дж., Лейн В.С., Мандель Г., Шихаттар Р. (май 2002 г.). «Комплекс ядро-BRAF35, содержащий гистондеацетилазу, опосредует репрессию нейронально-специфических генов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (11): 7420–5. Дои:10.1073 / pnas.112008599. ЧВК 124246. PMID 12032298.
^ Марморштейн Л.Ю., Кинев А.В., Чан Г.К., Бочар Д.А., Бения Х., Эпштейн Дж.А., Йен Т.Дж., Шихаттар Р. (январь 2001 г.). «Комплекс BRCA2 человека, содержащий компонент, связывающий структурную ДНК, влияет на развитие клеточного цикла». Ячейка. 104 (2): 247–57. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00209-4. PMID 11207365. S2CID 5822368.
^ Хакими М.А., Донг Й., Лейн В.С., Спайчер Д.В., Шихаттар Р. (февраль 2003 г.). «Кандидат Х-сцепленного гена умственной отсталости является компонентом нового семейства комплексов, содержащих гистондеацетилазу». Журнал биологической химии. 278 (9): 7234–9. Дои:10.1074 / jbc.M208992200. PMID 12493763.
^ Ли Ю.М., Ким В. (сентябрь 2003 г.). "Ассоциация члена 4 суперсемейства кинезинов человека с BRCA2-ассоциированным фактором 35". Биохимический журнал. 374 (Pt 2): 497–503. Дои:10.1042 / BJ20030452. ЧВК 1223617. PMID 12809554.
^ Ивасе С., Джанума А., Миямото К., Шоно Н., Хонда А., Янагисава Дж., Баба Т. (сентябрь 2004 г.). «Характеристика BHC80 в комплексе BRAF-HDAC, вовлеченном в репрессию нейрон-специфического гена». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 322 (2): 601–8. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.07.163. PMID 15325272.

дальнейшее чтение

Wattler F, Wattler S, Kelly M, Skinner HB, Nehls M (сентябрь 1999 г.). «Клонирование, хромосомная локализация и анализ экспрессии мышиного Smarce1-родственного, нового члена семейства генов группы 365 с высокой мобильностью». Геномика. 60 (2): 172–8. Дои:10.1006 / geno.1999.5913. PMID 10486208.
Марморштейн Л.Ю., Кинев А.В., Чан Г.К., Бочар Д.А., Бения Х., Эпштейн Дж. А., Йен Т.Дж., Шихаттар Р. (январь 2001 г.). «Комплекс BRCA2 человека, содержащий структурный компонент связывания ДНК, влияет на развитие клеточного цикла». Ячейка. 104 (2): 247–57. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00209-4. PMID 11207365. S2CID 5822368.
Ли Ю.М., Шин Х., Чой В., Ан С., Ким В. (апрель 2002 г.). «Характеристика человеческого белка группы высокой подвижности SMARCE1r». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1574 (3): 269–76. Дои:10.1016 / s0167-4781 (01) 00373-6. PMID 11997092.
Хакими М.А., Бочар Д.А., Ченовет Дж., Лейн В.С., Мандель Г., Шихаттар Р. (май 2002 г.). «Комплекс ядро-BRAF35, содержащий гистондеацетилазу, опосредует репрессию нейронально-специфических генов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (11): 7420–5. Дои:10.1073 / pnas.112008599. ЧВК 124246. PMID 12032298.
Ван С., Маккарти И.М., Балаш Л., Ли Ю., Штайнер М.С. (июль 2002 г.). «Клонирование кДНК, кодирующей альтернативно сплайсированный белок BRCA2-ассоциированного фактора 35». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 295 (1): 129–35. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 00624-1. PMID 12083779.
Ван С., Маккарти И.М., Балаш Л., Ли Ю., Штайнер М.С. (июль 2002 г.). «Иммуногистологическое обнаружение BRAF25 в образцах опухоли и рака предстательной железы человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 295 (1): 136–41. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 00625-3. PMID 12083780.
Хакими М.А., Донг Й., Лейн В.С., Спайчер Д.В., Шихаттар Р. (февраль 2003 г.). «Кандидат Х-сцепленного гена умственной отсталости является компонентом нового семейства комплексов, содержащих гистондеацетилазу». Журнал биологической химии. 278 (9): 7234–9. Дои:10.1074 / jbc.M208992200. PMID 12493763.
Ли Ю.М., Ким В. (сентябрь 2003 г.). "Ассоциация члена 4 суперсемейства кинезинов человека с BRCA2-ассоциированным фактором 35". Биохимический журнал. 374 (Pt 2): 497–503. Дои:10.1042 / BJ20030452. ЧВК 1223617. PMID 12809554.
Ивасе С., Джанума А., Миямото К., Шоно Н., Хонда А., Янагисава Дж., Баба Т. (сентябрь 2004 г.). «Характеристика BHC80 в комплексе BRAF-HDAC, вовлеченном в репрессию нейрон-специфического гена». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 322 (2): 601–8. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.07.163. PMID 15325272.
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

внешняя ссылка

HMG20B расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
HMG20B детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.

Эта статья о ген на хромосома человека 19 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000064961 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020232 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid10773667-5] Sumoy L, Carim L, Escarceller M, Nadal M, Gratacòs M, Pujana MA, Estivill X, Peral B (июнь 2000 г.). «HMG20A и HMG20B картируются в человеческих хромосомах 15q24 и 19p13.3 и составляют отдельный класс генов HMG-бокса с повсеместной экспрессией». Цитогенетика и клеточная генетика. 88 (1–2): 62–7. Дои:10.1159/000015486. PMID 10773667. S2CID 22921110.

[entrez-6] "Entrez Gene: группа высокой мобильности HMG20B 20B".

[pmid12032298-7] а ^б ^c ^d ^е Хакими М.А., Бочар Д.А., Ченовет Дж., Лейн В.С., Мандель Г., Шихаттар Р. (май 2002 г.). «Комплекс ядро-BRAF35, содержащий гистондеацетилазу, опосредует репрессию нейронально-специфических генов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (11): 7420–5. Дои:10.1073 / pnas.112008599. ЧВК 124246. PMID 12032298.

[pmid11207365-8] Марморштейн Л.Ю., Кинев А.В., Чан Г.К., Бочар Д.А., Бения Х., Эпштейн Дж.А., Йен Т.Дж., Шихаттар Р. (январь 2001 г.). «Комплекс BRCA2 человека, содержащий компонент, связывающий структурную ДНК, влияет на развитие клеточного цикла». Ячейка. 104 (2): 247–57. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00209-4. PMID 11207365. S2CID 5822368.

[pmid12493763-9] Хакими М.А., Донг Й., Лейн В.С., Спайчер Д.В., Шихаттар Р. (февраль 2003 г.). «Кандидат Х-сцепленного гена умственной отсталости является компонентом нового семейства комплексов, содержащих гистондеацетилазу». Журнал биологической химии. 278 (9): 7234–9. Дои:10.1074 / jbc.M208992200. PMID 12493763.

[pmid12809554-10] Ли Ю.М., Ким В. (сентябрь 2003 г.). "Ассоциация члена 4 суперсемейства кинезинов человека с BRCA2-ассоциированным фактором 35". Биохимический журнал. 374 (Pt 2): 497–503. Дои:10.1042 / BJ20030452. ЧВК 1223617. PMID 12809554.

[pmid15325272-11] Ивасе С., Джанума А., Миямото К., Шоно Н., Хонда А., Янагисава Дж., Баба Т. (сентябрь 2004 г.). «Характеристика BHC80 в комплексе BRAF-HDAC, вовлеченном в репрессию нейрон-специфического гена». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 322 (2): 601–8. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.07.163. PMID 15325272.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]