HPS4 - HPS4

HPS4
Идентификаторы
ПсевдонимыHPS4, LE, BLOC3S2, биогенез комплекса 3 лизосомных органелл субъединица 2, HPS4 биогенез комплекса 3 лизосомных органелл субъединица 2
Внешние идентификаторыOMIM: 606682 MGI: 2177742 ГомолоГен: 11123 Генные карты: HPS4
Расположение гена (человек)
Хромосома 22 (человек)
Chr.Хромосома 22 (человек)[1]
Хромосома 22 (человек)
Геномное расположение HPS4
Геномное расположение HPS4
Группа22q12.1Начните26,443,423 бп[1]
Конец26,483,837 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE HPS4 54037 в формате fs.png

PBB GE HPS4 218402 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_138646
NM_001359853

RefSeq (белок)

NP_619587
NP_001346782

Расположение (UCSC)Chr 22: 26.44 - 26.48 МбChr 5: 112.34 - 112.38 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Синдром Германского – Пудлака 4 белка это белок что у людей кодируется HPS4 ген.[5][6][7]

Синдром Германского-Пудлака - это нарушение биогенеза органелл, при котором кожный альбинизм, кровотечение и фиброз легких являются результатом дефектов меланосом, плотных гранул тромбоцитов и лизосом. Мутации в этом гене, а также в некоторых других могут вызвать этот синдром. Белок, кодируемый этим геном, играет важную роль в биогенезе органелл и подобен белку «светлого уха» мыши. Для этого гена обнаружено пять вариантов транскрипта, кодирующих разные изоформы. Кроме того, существуют варианты транскриптов, использующие альтернативные сигналы полиаденилирования.[7]

В меланоцитарных клетках экспрессия гена HPS4 может регулироваться MITF.[8]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100099 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042328 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Сузуки Т., Ли В., Чжан К., Карим А., Новак Е.К., Свидерская Е.В., Хилл С.П., Беннетт Д.К., Левин А.В., Ньювенхейс Г.К., Фонг С.Т., Кастеллан С., Митерски Б., Суонк Р.Т., Спритц Р.А. (март 2002 г.). «Синдром Германского-Пудлака вызван мутациями в HPS4, человеческом гомологе гена легкого уха мыши». Нат Жене. 30 (3): 321–4. Дои:10,1038 / ng835. PMID  11836498.
  6. ^ Чианг П. У., Ойсо Н., Гаутам Р., Сузуки Т., Суонк РТ, Спритц Р. А. (май 2003 г.). «Синдром Германского-Пудлака 1 (HPS1) и белки HPS4 являются компонентами двух комплексов, BLOC-3 и BLOC-4, участвующих в биогенезе органелл, связанных с лизосомами». J Biol Chem. 278 (22): 20332–7. Дои:10.1074 / jbc.M300090200. PMID  12663659.
  7. ^ а б "Энтрез Джин: HPS4 синдром Германского – Пудлака 4".
  8. ^ Хук К.С., Шлегель Н.С., Эйххофф О.М. и др. (2008). «Новые мишени MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии ДНК-микрочипов». Пигментная клетка Melanoma Res. 21 (6): 665–76. Дои:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID  19067971.

внешняя ссылка

дальнейшее чтение