Гаплогруппа C-F3393 - Википедия - Haplogroup C-F3393

Гаплогруппа C1 F3393
Возможное время происхожденияоколо 49200 лет назад[1]
Возможное место происхожденияЮго-Западная Азия[2]
ПредокГаплогруппа C
ПотомкиC1a CTS11043 (C1a1 M8; C1a2 (ранее C6) V20)
C1b1a B66 / Z16458; C1b1a1 M356 (ранее C5)
C1b2 C-B477 (C1b2a M38 (ранее C2); C1b2a1a P33; C1b2b (ранее C4) M347)
Определение мутацийF3393

Гаплогруппа C1 также известный как C-F3393, является основным Y-хромосома гаплогруппа. Это одна из двух основных ветвей более широкого Гаплогруппа C, другое существо C2 (также известный как C-M217; бывшая гаплогруппа C3).

Базальный парагруппа, C1 * (C-F3393 *), не обнаружен в пробах от живых или мертвых самцов.

Из двух первичных ветвей C1b часто встречается в частях Океания и Азия. Другая первичная ветвь, C1a, чрезвычайно редка во всем мире и обнаруживается в основном среди людей, происходящих из Япония или же Европа и среди европейцев верхнего палеолита, единичные случаи известны из Непал и Остров Чеджу через академические исследования и из этнических Армянский, этнический Kabyle, и этнический Хан из Ляонин провинции Китая в результате коммерческих испытаний.

Распределение

Миграция гаплогруппы C (Y-ДНК)

Субклады C1 (C-F3393) являются преобладающими гаплогруппами Y-ДНК среди некоторых коренных австралийских народов, некоторых Островитянин Тихого океана народов и некоторых этнических групп Малые Зондские острова Индонезии. Другие субклады обнаруживаются с очень низкой частотой в изолированных местах по всей Евразийский континент и прилегающие острова.

C1a (CTS11043)

Базальный C1a * (CTS11043) был обнаружен у европейцев верхнего палеолита (Ориньякцы ), GoyetQ116-1 и Pestera Muerii2.[3]

Среди наиболее интересных открытий недавних генетических исследований было то, что живые члены C1a также редки и географически распределены по чрезвычайно раздвоенной структуре.

C1a1 или же C-M8 в настоящее время обнаруживается регулярно только с низкой частотой (примерно 5% от всех проб) в Япония.[4]

C1a2 (ранее известный как C6) или C-V20 теперь, кажется, можно найти только среди Европейский, Kabyle, Армянский, и Непальский самцы.[5][6]

C1a2 присутствовал в останках в Европе Верхний палеолит, в том числе Вестоницкий кластер (Vestonice16) (т.е. останки найдены на территории современной Чехии). Он также был обнаружен у 7000-летнего (Мезолит ) остается от WHG (Западные охотники-собиратели ) известная как "Ла Брана 1", найденная в Ла Брана-Аринтеро, Леон, Испания.[7] Ла-Брана 1 была частью так называемого Кластер Виллабруна, названный в честь города на северо-востоке Италии. Однако ко времени кластера Виллабруна доминирующая гаплогруппа Y-ДНК в Западной Европе была I2. (И баланс снова был изменен массовые миграции в Европу неолитических ближневосточных фермеров и индоевропейцев бронзового века.)[8][9] далее: самец из Великая Венгерская равнина, приблизительно ровесник человека из Ла Бранья, также нес его,[4][10] как и 30 000-летние останки охотника-собирателя Вестоницкого кластера из Павлов-Дольни Вестонице площадь (Чехия ),[11] а также русские охотники-собиратели возрастом 34000 лет из Сунгирь (Сунгир 1/2/3/4).[12]

C1b (F1370)

Базальный C1b * (F1370) был обнаружен в останках человека, известного как Костенки-14 который умер около 37000 лет назад (Верхний палеолит ), найденный на Костенки археологический памятник в западной России. Он также был обнаружен у небольшого числа мужчин из Средний Восток.[13]

C1b2 (C-B477) является общим предком C-M38 и C-M347.

Вероятно, что более 40% Коренные австралийцы самцы до контакта с европейскими поселенцами принадлежали к субкладу C1b2b (C-M347), ранее известный как C4.[14] Внутри C-M347 были идентифицированы по крайней мере два субклада: C1b2b1 (DYS390.1del, M210) и еще нерешенное ответвление парагруппы C1b2b1 (то есть M347xDYS390.1del, M210).

C1b2a (M38), ранее известный как C2, практически ограничен Остров Юго-Восточная Азия, Новая Гвинея, Меланезия, и Полинезия.[4] Из его субкладов C1b2a1a (P33) встречается с высокой частотой среди Полинезийцы.[15][16]

Некоторые представители популяций в некоторых частях Азия было обнаружено, что они несут Y-ДНК, которая принадлежит гаплогруппе C1b1-AM00694 / K281. C1b1b-B68 был обнаружен в Дусун в Бруней.[17] C1b1a-B66 / Z16458 имеет три основных подклада: C1b1a1-M356, C1b1a2-B65 и C1b1a3-Z16582. C1b1a3-Z16582 был обнаружен у некоторых людей из Саудовская Аравия и Ирак. C1b1a2-B65 состоит из двух субкладов, C1b1a2a-B67 и C1b1a2b-F725. C1b1a2a-B67 был обнаружен в двух Люди Леббо в Борнео, Индонезия.[17] C1b1a2b-F725 был обнаружен в Хань китайский в Китай (Гуандун, Хунань, и Шэньси ), Дай люди в Юньнань, Мурут люди в Бруней,[17] Малайский народ в Сингапур,[17] и Люди Aeta в Филиппины.[17] C1b1a1-M356 был обнаружен с общей низкой частотой в Южная Азия, Центральная Азия, и Юго-Западная Азия.[18][19][20][21][22][23]

Филогенетическая структура

  • C1 F3393
    • C1a CTS11043
      • C1a1 M8
        • C1a1a P121
          • C1a1a1 CTS9336
            • C1a1a1a CTS6678 Япония, Южная Корея
            • C1a1a1b Z1356 Япония
          • C1a1a2 Z45460 Китай (Ляонин)
      • C1a2 (ранее C6) V20
        • C1a2a V182
          • C1a2a1 V222 Великобритания, Италия (Калабрия), Греция, Венгрия, Украина
            • C-Y12152 Шотландия
              • C-BY1117 Венгрия, Англия
              • C-Y11695 Италия, Греция, Украина
            • C-BY67541 Италия, Германия
          • C1a2a2 Z29329 Испания, Польша
        • C1a2b Z38888 / F16270 / PH428 Литва, Ирландия, Англия, Алжир, Армяне
          • C-Z44576 Алжир
          • К-Z44526 / F15182 Англия, Армянский
    • C1b F1370
      • C1b1 K281
        • C1b1a B66 / Z16458
          • C1b1a1 (ранее C5) M356 Индия, Шри-Ланка, Бангладеш, Непал, Пакистан, Афганистан,[24] Иран, Объединенные Арабские Эмираты, Кувейт, Саудовская Аравия, Китай (Синьцзян и Шаньси), Мьянма,[25] Таиланд[26]
          • C1b1a2 B65 Борнео, Китай (Юньнань, Гуандун, Хунань, Шэньси), Сингапур, Филиппины
          • C1b1a3 Z16582 Саудовская Аравия, Ирак
        • C1b1b B68 Борнео
      • C1b2 B477 / Z31885
        • C1b2a (ранее C2) M38
          • C1b2a1 M208
            • C1b2a1a P33 Полинезия
            • C1b2a1b P54
        • C1b2b (ранее C4) M347 Австралия
          • C1b2b1 M210

Смотрите также

Филогенетическое древо человека Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы [χ 1][χ 2]
"Y-хромосомный Адам "
A00A0-T  [χ 3]
A0A1  [χ 4]
A1aA1b
A1b1BT
BCT
DECF
DECF
F1 F2 F3 GHIJK
граммHIJK
IJKЧАС
IJK
я   J     LT  [χ 5]      K2 [χ 6]
L     Т    K2a  [χ 7]       K2b [χ 8]    K2c    K2dK2e  [χ 9]  
K-M2313 [χ 10]    K2b1 [χ 11]п  [χ 12]
НЕТ  S  [χ 13] M  [χ 14]   P1    P2
NОQр

Сноски

  1. ^ C-F3393 дерево, Yfull
  2. ^ 崎 谷 満 『DNA ・ 考古 ・ 言語 の 学 際 が 示 す 新 ・ 日本 列島』 （勉 誠 出 2009 2009） (на японском языке)
  3. ^ Fu, Q .; Posth, C .; Hajdinjak, M .; Петр, М .; Маллик, S .; Fernandes, D .; Furtwängler, A .; Haak, W .; Мейер, М .; Mittnik, A .; Никель, В .; Пельтцер, А .; Rohland, N .; Слон, В .; Talamo, S .; Lazaridis, I .; Lipson, M .; Mathieson, I .; Schiffels, S .; Skoglund, P .; Деревянко, А.П .; Дроздов, Н .; Славинский, В .; Цыбанков А .; Cremonesi, R.G .; Mallegni, F .; Gély, B .; Vacca, E .; González Morales, M.R .; и другие. (2016). «Генетическая история ледникового периода Европы». Природа. 534 (7606): 200–205. Bibcode:2016Натура.534..200F. Дои:10.1038 / природа17993. ЧВК  4943878. PMID  27135931.
  4. ^ а б c ISOGG, 2015 «Гаплогруппа C Y-ДНК и ее субклады - 2015» (15 сентября 2015 г.).
  5. ^ Scozzari R, Massaia A, D'Atanasio E, Myres NM, Perego UA, Trombetta B, Cruciani F (202). "Молекулярное вскрытие базальных клад в филогенетическом дереве Y-хромосомы человека". PLOS ONE. 7 (11): e49170. Bibcode:2012PLoSO ... 749170S. Дои:10.1371 / journal.pone.0049170. ЧВК  3492319. PMID  23145109.
  6. ^ Халласт П., Батини С., Задик Д., Майзано Делсер П., Веттон Дж. Х., Арройо-Пардо Е. и др. (Март 2015 г.). «Дерево Y-хромосомы распадается на лист: 13 000 SNP с высокой степенью достоверности, охватывающих большинство известных клад». Молекулярная биология и эволюция. 32 (3): 661–73. Дои:10.1093 / molbev / msu327. ЧВК  4327154. PMID  25468874.
  7. ^ http://dienekes.blogspot.ru/2014/01/brown-skinned-blue-eyed-y-haplogroup-c.html[требуется полная цитата ]
  8. ^ Гиббонс, Энн (2017). «Нет такого понятия, как« чистый »европеец - или кто-либо еще». Наука. Дои:10.1126 / science.aal1186.
  9. ^ Siska V, Jones ER, Jeon S, Bhak Y, Kim HM, Cho YS, Kim H, Lee K, Veselovskaya E, Balueva T, Gallego-Llorente M, Hofreiter M, Bradley DG, Eriksson A, Pinhasi R, Bhak J, Manica A (февраль 2017 г.). «Полногеномные данные двух людей из Восточной Азии в раннем неолите, датируемые 7700 лет назад». Достижения науки. 3 (2): e1601877. Bibcode:2017SciA .... 3E1877S. Дои:10.1126 / sciadv.1601877. ЧВК  5287702. PMID  28164156. Сложить резюме – Кембриджский университет исследований (1 февраля 2017 г.).
  10. ^ Хаак В., Лазаридис И., Паттерсон Н., Роланд Н., Маллик С., Лламас Б. и др. (Июнь 2015 г.). «Массовая миграция из степи была источником индоевропейских языков в Европе». Природа. 522 (7555): 207–11. arXiv:1502.02783. Bibcode:2015Натура.522..207H. Дои:10.1038 / природа14317. ЧВК  5048219. PMID  25731166.
  11. ^ Fu Q, Posth C, Hajdinjak M, Petr M, Mallick S, Fernandes D и др. (Июнь 2016). «Генетическая история ледникового периода Европы». Природа. 534 (7606): 200–5. Bibcode:2016Натура.534..200F. Дои:10.1038 / природа17993. ЧВК  4943878. PMID  27135931.
  12. ^ Сикора М., Сегуин-Орландо А., Суза В.К., Альбрехтсен А., Корнелиуссен Т., Ко А. и др. (Ноябрь 2017 г.). «Древние геномы показывают социальное и репродуктивное поведение собирателей раннего верхнего палеолита». Наука. 358 (6363): 659–662. Bibcode:2017Научный ... 358..659S. Дои:10.1126 / science.aao1807. PMID  28982795.
  13. ^ https://sites.google.com/site/haplogroupcproject/[требуется полная цитата ]
  14. ^ Худжашов Г., Кивисилд Т., Андерхилл П.А., Эндикотт П., Санчес Дж. Дж., Лин А.А., Шен П., Офнер П., Ренфрю С., Виллемс Р., Форстер П. (май 2007 г.). «Выявление доисторического поселения Австралии с помощью анализа Y-хромосомы и мтДНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 104 (21): 8726–30. Bibcode:2007PNAS..104.8726H. Дои:10.1073 / pnas.0702928104. ЧВК  1885570. PMID  17496137.
  15. ^ Hammer MF, Karafet TM, Park H, Omoto K, Harihara S, Stoneking M, Horai S (2006). «Двойное происхождение японцев: общая основа для Y-хромосом охотников-собирателей и фермеров». Журнал генетики человека. 51 (1): 47–58. Дои:10.1007 / s10038-005-0322-0. PMID  16328082.
  16. ^ Cox MP, Redd AJ, Karafet TM, Ponder CA, Lansing S, Sudoyo H, Hammer MF (октябрь 2007 г.). «Полинезийский мотив на Y-хромосоме: структура населения в отдаленной Океании». Человеческая биология. 79 (5): 525–35. Дои:10.1353 / хаб.2008.0004. HDL:1808/13585. PMID  18478968. S2CID  4834817.
  17. ^ а б c d е Кармин М., Сааг Л., Висенте М., Вильсон Сайрес М.А., Ярве М., Талас Ю.Г. и др. (Апрель 2015 г.). «Недавнее узкое место разнообразия Y-хромосомы совпадает с глобальным изменением культуры». Геномные исследования. 25 (4): 459–66. Дои:10.1101 / гр.186684.114. ЧВК  4381518. PMID  25770088.
  18. ^ Гайден Т., Каденас А.М., Регейро М., Сингх Н.Б., Животовский Л.А., Андерхилл П.А., Кавалли-Сфорца Л.Л., Эррера Р.Дж. (май 2007 г.). «Гималаи как направленный барьер для потока генов». Американский журнал генетики человека. 80 (5): 884–94. Дои:10.1086/516757. ЧВК  1852741. PMID  17436243.
  19. ^ Fornarino S, Pala M, Battaglia V, Maranta R, Achilli A, Modiano G, Torroni A, Semino O, Santachiara-Benerecetti SA (июль 2009 г.). «Разнообразие митохондрий и Y-хромосомы у Tharus (Непал): резервуар генетической изменчивости». BMC Эволюционная биология. 9: 154. Дои:10.1186/1471-2148-9-154. ЧВК  2720951. PMID  19573232.
  20. ^ Каденас AM, Животовский Л.А., Кавалли-Сфорца Л.Л., Андерхилл П.А., Эррера Р.Дж. (март 2008 г.). «Разнообразие Y-хромосомы характеризует Оманский залив». Европейский журнал генетики человека. 16 (3): 374–86. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5201934. PMID  17928816.
  21. ^ Абу-Амеро К.К., Хеллани А., Гонсалес А.М., Ларруга Дж.М., Кабрера В.М., Андерхилл, Пенсильвания (сентябрь 2009 г.). «Разнообразие Y-хромосомы Саудовской Аравии и его связь с соседними регионами». BMC Genetics. 10: 59. Дои:10.1186/1471-2156-10-59. ЧВК  2759955. PMID  19772609.
  22. ^ Сенгупта С., Животовский Л.А., Кинг Р., Мехди С.К., Эдмондс К.А., Чоу С.Э., Лин А.А., Митра М., Сил С.К., Рамеш А., Уша Рани М.В., Такур К.М., Кавалли-Сфорца Л.Л., Маджумдер П.П., Андерхилл, Пенсильвания (февраль 2006 ). «Полярность и временность распределений Y-хромосомы высокого разрешения в Индии позволяют идентифицировать как местные, так и экзогенные экспансии и выявить незначительное генетическое влияние среднеазиатских скотоводов». Американский журнал генетики человека. 78 (2): 202–21. Дои:10.1086/499411. ЧВК  1380230. PMID  16400607.
  23. ^ Karafet TM, Mendez FL, Meilerman MB, Underhill PA, Zegura SL, Hammer MF (май 2008 г.). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогруппы Y-хромосомы человека». Геномные исследования. 18 (5): 830–8. Дои:10.1101 / gr.7172008. ЧВК  2336805. PMID  18385274.
  24. ^ Лакау Х., Гайден Т., Регейро М., Ченнакришнайя С., Бухари А., Андерхилл ПА, Гарсия-Бертран Р.Л., Эррера Р.Дж. (2012). «Афганистан с точки зрения Y-хромосомы». Европейский журнал генетики человека. 20 (10): 1063–1070. Дои:10.1038 / ejhg.2012.59. ЧВК  3449065. PMID  22510847.
  25. ^ Пэн М.С., Хе Дж.Д., Фан Л., Лю Дж., Адеола А.С., Ву С.Ф., Мерфи Р.В., Яо Ю.Г., Чжан Ю.П. (2013). «Получение деревьев гаплогруппы Y хромосомы с использованием данных GWAS». Европейский журнал генетики человека. 22 (8): 1046–1050. Дои:10.1038 / ejhg.2013.272. ЧВК  4350590. PMID  24281365.
  26. ^ Brunelli A, Kampuansai J, Seielstad M, Lomthaisong K, Kangwanpong D, Ghirotto S и др. (2017). «Свидетельство Y-хромосомы о происхождении северных тайцев». PLOS ONE. 12 (7): e0181935. Bibcode:2017PLoSO..1281935B. Дои:10.1371 / journal.pone.0181935. ЧВК  5524406. PMID  28742125.