IbpB термометр - IbpB thermometer

IbpB термометр
IbpB Thermometer.png
Сохранено вторичная структура термометра IbpB
Идентификаторы
СимволibpB 5 'UTR
Прочие данные
РНК типТермометр РНК
Домен (ы)Кишечная палочка
PDB структурыPDBe

В IbpB термометр является Термометр РНК элемент найден в ibpAB оперон.[1] Оперон содержит два гена теплового шока, кодирующие тело включения связывающие белки A и B (IbpA / B), и является наиболее резко активируемым опероном при тепловом шоке у кишечная палочка.[2]

IbpA регулируется РОЗА элемент найдено в его 5 'UTR,[3][4] в то время как IbpB имеет свой термочувствительный цис-регуляторный элемент. Подтверждена активность этого терморегулятора. in vitro но не был найден in vivo, предполагая, что в бактериальных клетках существует более сложная регуляция оперона.[1]

Белок IbpB

Белок IbpB, экспрессия которого регулируется термометром IbpB, на 48% идентичен IbpA (на уровне аминокислота последовательность), но играет другую роль в тепловом шоке. Когда IbpB отсутствует, белок IbpA образует длинные фибриллы что необычно для белок теплового шока; IbpB, действующий как сопроводитель, ингибирует IbpA от образования этой структуры.[5]

При тепловом шоке белок IbpB диссоциирует с образованием двух субъединиц меньшего размера, а также перестраивает свою третичная структура.[6] Эта «замечательная конформационная трансформация»[7] считается важным для IbpB действовать в качестве ко-шаперона с IbpA при тепловом шоке.[8]

Было обнаружено, что IbpB сохраняет свою активность в течение значительного времени после удаления стимула теплового шока.[7]

использованная литература

  1. ^ а б Gaubig LC, Waldminghaus T, Narberhaus F (январь 2011 г.). «Несколько уровней контроля регулируют экспрессию оперона теплового шока Escherichia coli ibpAB». Микробиология. 157 (Pt 1): 66–76. Дои:10.1099 / мик.0.043802-0. PMID  20864473.
  2. ^ Ричмонд К.С., Гласнер Д.Д., Мау Р., Джин Х., Блаттнер FR (октябрь 1999 г.). «Полногеномный профиль экспрессии в Escherichia coli K – 12». Исследования нуклеиновых кислот. 27 (19): 3821–3835. Дои:10.1093 / nar / 27.19.3821. ЧВК  148645. PMID  10481021.
  3. ^ Waldminghaus T, Gaubig LC, Klinkert B, Narberhaus F (сентябрь – октябрь 2009 г.). «Термометр Escherichia coli ibpA состоит из стабильных и нестабильных конструктивных элементов». РНК Биология. 6 (4): 455–463. Дои:10.4161 / rna.6.4.9014. PMID  19535917.
  4. ^ Waldminghaus T, Fippinger A, Alfsmann J, Narberhaus F (декабрь 2005 г.). «РНК-термометры распространены у альфа- и гамма-протеобактерий». Биологическая химия. 386 (12): 1279–1286. Дои:10.1515 / BC.2005.145. PMID  16336122.
  5. ^ Ратайчак Э., Строжецка Я., Матушевска М., Зиткевич С., Кучиньска-Висник Д., Ласковска Е., Либерек К. (июнь 2010 г.). «IbpA, небольшой белок теплового шока из Escherichia coli, образует фибриллы в отсутствие своего коаперона IbpB». Письма FEBS. 584 (11): 2253–2257. Дои:10.1016 / j.febslet.2010.04.060. PMID  20433838.
  6. ^ Shearstone JR, Baneyx F (апрель 1999 г.). «Биохимическая характеристика малого белка теплового шока IbpB из Escherichia coli». Журнал биологической химии. 274 (15): 9937–9945. Дои:10.1074 / jbc.274.15.9937. PMID  10187768.
  7. ^ а б Цзяо В., Хун В., Ли П, Сун С., Ма Дж, Цянь М., Ху М., Чанг З. (февраль 2008 г.). «Резко повышенная шаперонная активность малого белка теплового шока IbpB сохраняется в течение длительного периода времени после снятия стрессового состояния». Биохимический журнал. 410 (1): 63–70. Дои:10.1042 / BJ20071120. PMID  17995456.
  8. ^ Цзяо В., Цянь М., Ли П, Чжао Л., Чанг З. (апрель 2005 г.). «Существенная роль гибких концов в термочувствительности олигомерного состояния и шапероноподобной активности полидисперсного малого белка теплового шока IbpB из Escherichia coli». Журнал молекулярной биологии. 347 (4): 871–884. Дои:10.1016 / j.jmb.2005.01.029. PMID  15769476.