Подавление элемента экспрессии гена теплового шока (РОЗА) - Repression of heat shock gene expression (ROSE) element

Подавление элемента экспрессии гена теплового шока (РОЗА)
RF00435.jpg
Идентификаторы
СимволРОЗА
РфамRF00435
Прочие данные
РНК типСнг; терморегулятор
Домен (ы)Бактерии
ТАКТАК: 0000204
PDB структурыPDBe
Представление трехмерной структуры РНК microROSE. Это получено из решения ЯМР структура элемента microROSE.[1]

В подавление элемента экспрессии гена теплового шока (РОЗА) является Элемент РНК найдено в 5 'UTR некоторых белков теплового шока мРНК. Элемент РОЗА - это Термометр РНК что негативно регулирует тепловой удар экспрессия гена. Считается, что вторичная структура изменяется под воздействием температуры, поэтому это термометр РНК. Эта структура блокирует доступ к сайт связывания рибосомы при нормальной температуре. Однако во время теплового шока структура меняется, освобождая рибосома сайт связывания и обеспечение экспрессии.[2][3]

Частичная структура этого элемента РНК была определена с использованием ЯМР.[1]

РОЗА1 и РОЗАAT2

РОЗА1 и РОЗАAT2 являются конкретными примерами элементов РОЗА.[4] РОЗА1 находится в Bradyrhizobium japonicum тогда как РОЗАAT2 является тесно связанным элементом из Agrobacterium tumefaciens. Два элемента РНК имеют одинаковые второстепенные конструкции с РОЗой1 наличие дополнительных заколка для волос.[4] Все элементы ROSE содержат характерную выпуклую букву G напротив Последовательность Шайна-Далгарно сайт привязки, без этого нуклеотид термометр РНК теряет температурную чувствительность.[5]

IpbA

Экспрессия белка теплового шока IpbA у видов Псевдомонады контролируется РНК-термометром ROSE-типа. Этот термометр состоит всего из двух хайпринов. Подавляет перевод IpbA при низких температурах и допускает трансляцию при повышении температуры.[6]

rhlA и lsdI РОЗОВЫЕ элементы

Синегнойная палочка проверка кворума -зависимые факторы вирулентности можно терморегулировать. Термометр ROSE присутствует в 5'UTR rhlA и ROSE-подобный термометр в 5'UTR ласи заблокировать перевод при более низких температурах.[7]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б Чоудхури С., Марис С., Аллен Ф. Х., Нарберхаус Ф (2006). «Молекулярная основа измерения температуры с помощью термометра РНК». EMBO J. 25 (11): 2487–2497. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601128. ЧВК  1478195. PMID  16710302.
  2. ^ Нокер, А; Hausherr T; Balsiger S; Крстулович Н.П .; Hennecke H; Нарберхаус F (2001). «Термосенсор на основе мРНК контролирует экспрессию ризобиальных генов теплового шока». Нуклеиновые кислоты Res. 29 (23): 4800–4807. Дои:10.1093 / nar / 29.23.4800. ЧВК  96696. PMID  11726689.
  3. ^ Балсигер, S; Ragaz C; Барон C; Нарберхаус F (2004). «Репликон-специфическая регуляция генов малого теплового шока в Agrobacterium tumefaciens». J Бактериол. 186 (20): 6824–6829. Дои:10.1128 / JB.186.20.6824-6829.2004. ЧВК  522190. PMID  15466035.
  4. ^ а б Narberhaus F, Waldminghaus T, Chowdhury S (январь 2006 г.). «Термометры РНК». FEMS Microbiol. Rev. 30 (1): 3–16. Дои:10.1111 / j.1574-6976.2005.004.x. PMID  16438677. Архивировано из оригинал на 2013-01-05. Получено 2010-07-20.
  5. ^ Нокер А., Хаушер Т., Балсигер С., Крстулович Н.П., Хеннеке Х., Нарберхаус Ф. (декабрь 2001 г.). «Термосенсор на основе мРНК контролирует экспрессию ризобиальных генов теплового шока». Нуклеиновые кислоты Res. 29 (23): 4800–4807. Дои:10.1093 / nar / 29.23.4800. ЧВК  96696. PMID  11726689. Получено 2010-07-20.
  6. ^ Краевский, СС; Нагель, М; Нарберхаус, Ф (2013). «Термометры с короткой РОЗЕПодобной РНК контролируют синтез IbpA у видов Pseudomonas». PLOS ONE. 8 (5): e65168. Дои:10.1371 / journal.pone.0065168. ЧВК  3669281. PMID  23741480.
  7. ^ Гроссо-Бесерра, Мария Виктория; Крода-Гарсия, Херардо; Мерино, Энрике; Сервин-Гонсалес, Луис; Мохика-Эспиноса, Рауль; Соберон-Чавес, Глория (28 октября 2014 г.). «Регулирование факторов вирулентности Pseudomonas aeruginosa двумя новыми РНК-термометрами». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 111 (43): 15562–15567. Дои:10.1073 / pnas.1402536111. ISSN  1091-6490. ЧВК  4217398. PMID  25313031.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка