Интегрин бета 7 - Integrin beta 7

ITGB7
Белок ITGB7 PDB 2brq.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыITGB7, субъединица интегрина бета 7
Внешние идентификаторыOMIM: 147559 MGI: 96616 ГомолоГен: 20247 Генные карты: ITGB7
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человек)[1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение ITGB7
Геномное расположение ITGB7
Группа12q13.13Начните53,191,323 бп[1]
Конец53,207,282 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE ITGB7 205718 в fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_000889

NM_013566

RefSeq (белок)

NP_000880

NP_038594

Расположение (UCSC)Chr 12: 53.19 - 53.21 МбChr 15: 102.22 - 102.23 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Интегрин бета-7 является интегрин белок что у людей кодируется ITGB7 ген.[5][6] Он может сочетаться с ITGA4 (CD49d) для формирования гетеродимерный интегрин рецептор α4β7, или с ITGAE (CD103) с образованием αEβ7.[7]

Структура

Как и все субъединицы интегрина, β7 представляет собой очень гибкий, связанный с мембраной внеклеточный белок, который для стабильности должен спариваться с субъединицей α. Гибкость молекулы позволяет ей динамически регулировать свое сродство к лиганд через конформационные изменения.[8] Начиная с апикального конца белка, наиболее удаленного от клеточной мембраны, β7 состоит из головы и верхних конечностей, вместе известных как головной убор, нижних конечностей, трансмембранный домен и цитоплазматический хвостик. На вершине головы находится I-подобный домен, иногда называемый доменом βI, который в сочетании с субъединицей α связывает лиганд. Чуть ниже находится гибридный домен, часть которого N-концевой в домен I-like. Ниже гибридного домена находится домен PSI, который завершает головной убор. Голени состоят из EGF домены 1-4 и β-хвостовая область. Наконец, есть трансмембранный домен, и C-терминал цитоплазматический хвост.[9]

Взаимодействия

ITGB7 был показан взаимодействовать с участием EED.[10]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000139626 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000001281 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Эрле Диджей, Рюэгг С., Шеппард Д., Пытела Р. (июнь 1991 г.). «Полная аминокислотная последовательность бета-субъединицы интегрина (бета 7), идентифицированная в лейкоцитах». Журнал биологической химии. 266 (17): 11009–16. PMID  2040616.
  6. ^ «Энтрез Ген: интегрин ITGB7, бета 7».
  7. ^ Байрон А., Хамфрис Дж. Д., Аскари Дж. А., Крейг С. Е., Молд А. П., Хамфрис М. Дж. (Ноябрь 2009 г.). «Моноклональные антитела против интегрина». Журнал клеточной науки. 122 (Pt 22): 4009–11. Дои:10.1242 / jcs.056770. ЧВК  3329622. PMID  19910492.
  8. ^ Резюме Кармана, Springer TA (октябрь 2003 г.). «Интегринная регуляция авидности: недооцениваются ли изменения сродства и конформации?». Текущее мнение в области клеточной биологии. 15 (5): 547–56. Дои:10.1016 / j.ceb.2003.08.003. PMID  14519389.
  9. ^ Ю И, Чжу Дж, Ми ЛЗ, Вальц Т, Сун Х, Чен Дж, Спрингер Т.А. (январь 2012 г.). «Структурная специализация α (4) β (7), интегрина, который обеспечивает адгезию при качении». Журнал клеточной биологии. 196 (1): 131–46. Дои:10.1083 / jcb.201110023. ЧВК  3255974. PMID  22232704.
  10. ^ Рицлер М., Биттнер М., Коланус В., Шустер А., Хольцманн Б. (октябрь 1998 г.). «Белок с повторением WD человека WAIT-1 специфически взаимодействует с цитоплазматическими хвостами бета7-интегринов». Журнал биологической химии. 273 (42): 27459–66. Дои:10.1074 / jbc.273.42.27459. PMID  9765275.

дальнейшее чтение

внешние ссылки