Интерфером - Interferome

ИНТЕРФЕРОМ
Database.png
Содержание
Описаниебаза данных интерферон регулируемые гены
ОрганизмыHomo sapiens
Mus musculus
Пан троглодиты
Контакт
ЛабораторияИнститут медицинских исследований им. Монаша
Кембриджский университет
Основное цитированиеШамит Самараджива и др. (2009)[1]
Дата выхода2008
Доступ
Интернет сайтhttp://www.interferome.org

Интерфером это онлайн биоинформатика база данных из гены, регулируемые интерфероном (IRG).[1] Эти Интерферон Регулируемые гены также известны как гены, стимулированные интерфероном (ISG). База данных содержит информацию о регулируемых генах типа I (IFN альфа, бета), типа II (IFN гамма) и типа III (IFN лямбда) и регулярно обновляется. Он используется интерферон и цитокин исследовательское сообщество [2] и как инструмент анализа, и как информационный ресурс. Интерфероны были идентифицированы как противовирусные белки более 50 лет назад. Однако их участие в иммуномодуляция, распространение клеток, воспаление и другие гомеостатический процессы были с тех пор идентифицированы. Эти цитокины используются в качестве терапевтических средств при многих заболеваниях, таких как хронические популярный инфекции, рак и рассеянный склероз.[3] Эти интерфероны регулируют транскрипцию примерно 2000 генов в зависимости от подтипа интерферона, дозы, типа клетки и стимула. Эта база данных генов, регулируемых интерфероном, представляет собой попытку интеграции информации из высокопроизводительных экспериментов и баз данных молекулярной биологии для получения детального понимания биологии интерферона.

Содержание

Интерфером включает следующие наборы данных:

Инструменты

Interferome предлагает множество способов поиска и извлечения данных из базы данных:

  • Определить сигнатуры регулируемых интерфероном генов в данных микрочипа;
  • Генная онтология анализ и аннотация;
  • Нормальный ткань экспрессия генов, регулируемых интерфероном;
  • Регуляторный анализ генов, регулируемых интерфероном;
  • ВЗРЫВ (Basic Local Alignment Search Tool) анализ и загрузка последовательности ортолога;

Управление интерферомом

Интерферомом управляет команда в Университет Монаша  :Институт медицинских исследований им. Монаша и Кембриджский университет

Рекомендации

  1. ^ а б Самараджива, Шамит А; Форстер Сэм; Auchettl Katie; Герцог Пол Дж (январь 2009 г.). «ИНТЕРФЕРОМ: база данных генов, регулируемых интерфероном». Нуклеиновые кислоты Res. Англия. 37 (Проблема с базой данных): D852-7. Дои:10.1093 / nar / gkn732. ЧВК  2686605. PMID  18996892.
  2. ^ http://www.isicr.org/
  3. ^ http://www.cancerhelp.org.uk/help/default.asp?page=4009

внешняя ссылка