Международный координационный центр нейроинформатики - International Neuroinformatics Coordinating Facility

Международный координационный центр нейроинформатики
Логотип Международного координационного центра нейроинформатики, стиль только аббревиатуры.
СокращениеINCF
ДевизОбеспечение открытой и СПРАВЕДЛИВОЙ нейробиологии.[1]
Формирование2005; 15 лет назад (2005)[2]
Штаб-квартираСекретариат МКФ
Расположение
Координаты59 ° 20′54,46 ″ с.ш. 18 ° 1′25,78 ″ в.д. / 59.3484611 ° с.ш. 18.0238278 ° в. / 59.3484611; 18.0238278
Председатель Правления
Мэриэнн Мартоне[3]
Интернет сайтincf.org

В Международный координационный центр нейроинформатики (INCF ) - международная некоммерческая организация с миссией[4] для разработки, оценки и одобрения стандартов и передовых практик, которые охватывают принципы Открытости, Честности,[5] и Citable неврологии. INCF также проводит обучение тому, как стандарты и передовые методы способствуют воспроизводимости и позволяют публиковать полные результаты исследований, включая данные и код. INCF был создан в 2005 году по рекомендации рабочей группы Глобального научного форума ОЭСР.[6] INCF проводится Каролинский институт в Стокгольм, Швеция.[7] По состоянию на октябрь 2019 года у INCF есть активные узлы в 18 странах.[8] Исполнительный директор - Линда Ланьон,[9] Председатель Правления - Марианн Мартоне.

Сеть INCF стремится[10] способствовать применению вычислительных подходов к пониманию мозга и развитию инфраструктуры, необходимой для использования вычислительных методов для интеграции и анализа разнообразных данных в разных масштабах, методах и видах, чтобы понять мозг и положительно повлиять на здоровье и благополучие общества. .

Задний план

Смотрите также: Нейроинформатика

Ключевой элемент успешного понимания нервная система интеграция нейробиология с участием информационные науки. Область, изучающая нервную систему, нейробиология, ответила на фантастический вызов понимания того, как работает наш мозг, с использованием самых сложных технологий, на основе исследований геном тем, кто на визуализация мозга поведения людей и других видов в различных функциональных состояниях и на всех промежуточных аналитических уровнях. Эти усилия привели к появлению большого количества данных, которые постоянно увеличиваются на более высоких уровнях сложности. Полученные данные неоднородны, поступают с разных уровней изучения и методов анализа. Чтобы справиться с этой задачей интеграции и обеспечить эффективное и максимальное использование этих данных, теперь необходимо разработать и создать эти общие ресурсы:

  1. базы данных нейробиологии и знаний;
  2. инструменты аналитики и моделирования; и
  3. вычислительные модели.

Эта проблема решается путем слияния нейробиологии с информатикой - областью нейроинформатики.

История

Бытие

Рекомендация по координации международных усилий в новой области нейроинформатики впервые была сделана в отчете биоинформатика разработан под эгидой тогдашнего форума OECD Megascience Forum в 1998 г.[11] После обширных дискуссий в Рабочей группе по нейроинформатике Глобального научного форума под председательством доктора Стивена Х. Кослоу в 2002 году было представлено предложение о создании Международного координационного совета по нейроинформатике и системы грантового финансирования исследований в области нейроинформатики.[12] Этот проект был одобрен министрами науки ОЭСР на встрече в январе 2004 г. Шестнадцать стран (Австралия, Канада, Китай, Чешская Республика, Дания, Финляндия, Франция, Германия, Индия, Италия, Япония, Нидерланды, Норвегия, Швеция, Швейцария , Соединенное Королевство, Соединенные Штаты и Виктория, Австралия), а также Европейская комиссия разработали рабочие документы, которые составляют правовую основу для INCF и Программы международной нейроинформатики (PIN).[13]

Учреждение

Условия, изложенные для создания INCF[14] В июле 2005 г. семь стран (Чешская Республика, Финляндия, Германия, Норвегия, Швеция, Швейцария и США) подписали документ о взаимопонимании и заявили о своем финансовом вкладе. Заявка на размещение Секретариата INCF была объявлена. Было получено два предложения, и 3 ноября по поручению Совета управляющих ОЭСР[15] созвал группу экспертов для рассмотрения и ранжирования предложений. Комиссия присвоила шведскому предложению более высокий рейтинг, и эта рекомендация была одобрена Руководящим советом INCF, когда он собрался в штаб-квартире ОЭСР 28 ноября. После обширных международных обсуждений в феврале 2007 года был официально открыт INCF со штаб-квартирой в Каролинский институт в Стокгольме.

INCF способствует сотрудничеству в области нейроинформатики и воспроизводимости исследований мозга посредством

  • обеспечение координации глобальной инфраструктуры нейробиологии посредством разработки и утверждения стандартов и передовых практик в поддержку открытой нейробиологии и FAIR (Findable Accessible Interoperable Reusable)
  • обучение исследователей, администраторов и студентов тому, как нейроинформатика способствует строгости и воспроизводимости, открытой и ЧЕСТНОЙ науке и публикации всей своей исследовательской продукции: повествования, данных и кода
  • поощрение нейробиологии как дисциплины к движению к FORCE (FAIR, Open, Research-object based и Citable Ecosystem)
  • содействие продвижению и постоянному развитию нейроинформатики как научной дисциплины

Основные результаты программы

включают

  • Пространство Ваксгольма (WHS), основанное на координатах эталонное пространство мозга грызунов
  • Масштабируемый атлас мозга,[16] веб-движок для отображения атласов мозга, данных изображений и топологий
  • NineML,[17] общий язык описания модели
  • Координатор мульти-симуляции (МУЗЫКА),[18] что позволяет крупномасштабным симуляторам нейронов и другим приложениям обмениваться данными во время выполнения
  • Модель данных информатики нейровизуализации (NI-DM),[19] структура для генерации, хранения и запроса метаданных, включая информацию о происхождении
  • Пространство знаний,[20] энциклопедия на уровне сообщества, которая связывает концепции исследования мозга с данными, моделями и литературой со всего мира
  • TrainingSpace,[21] онлайн-хранилище, объединяющее учебные ресурсы по нейроинформатике, разработанные как INCF, нашими партнерами, так и существующими ресурсами сообщества.

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ "О нас". INCF. Получено 9 октября 2019.
  2. ^ "История". KI.se. Получено 9 октября 2019.
  3. ^ а б "Контакт". INCF. Получено 9 октября 2019.
  4. ^ "Миссия | INCF". www.incf.org. Получено 2019-10-09.
  5. ^ Хагстром, Стефани (2014-09-03). «Принципы честных данных». FORCE11. Получено 2017-12-04.
  6. ^ "Около". Консорциум экспертной оценки неврологии. Получено 19 сентября 2017.
  7. ^ "Расположение | INCF". www.incf.org. Получено 2019-10-09.
  8. ^ «Управляющие и ассоциированные узлы | INCF». www.incf.org. Получено 2019-10-09.
  9. ^ «Ключевой персонал | МККФ». www.incf.org. Получено 2019-10-08.
  10. ^ «Что мы делаем | INCF». www.incf.org. Получено 2017-12-04.
  11. ^ Рабочая группа Megascience Forum по биологической информатике (январь 1999 г.). Заключительный отчет (Отчет). Организация экономического сотрудничества и развития. С. 3–4, 49–50, 70–72. Получено 19 сентября 2017 - через INCF ownCloud.
  12. ^ Рабочая группа по нейроинформатике Глобального научного форума (июнь 2002 г.). Отчет по нейроинформатике (Отчет). Организация экономического сотрудничества и развития. С. 5, 11–15, 46. Получено 19 сентября 2017 - через ICNF ownCloud.
  13. ^ «Луч проекта | INCF». www.OECD.org. Получено 2019-10-09.
  14. ^ "Incf | INCF". www.incf.org. Получено 2017-12-04.
  15. ^ "OECD.org - ОЭСР". www.oecd.org. Получено 2017-12-04.
  16. ^ «Масштабируемый атлас мозга - нейроанатомия у вас под рукой». scalablebrainatlas.incf.org. Получено 2017-12-04.
  17. ^ "NineML". NineML. Получено 2017-12-04.
  18. ^ MUSIC, координатор MUltiSimulation, Международный координационный центр нейроинформатики (INCF), 2017-11-14, получено 2017-12-04
  19. ^ «- Модель данных нейровизуализации». Получено 2017-12-04.
  20. ^ «Пространство знаний - Главная». knowledge-space.org. Получено 2017-12-04.
  21. ^ «TrainingSpace - Дом». training.incf.org. Получено 2018-04-24.

внешние ссылки