КМТ5А - KMT5A

КМТ5А
Белок SETD8 PDB 1zkk.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыКМТ5А, PR-Set7, SET07, SET8, SETD8, лизинметилтрансфераза 5A, PR / SET07
Внешние идентификаторыOMIM: 607240 MGI: 1915206 ГомолоГен: 41372 Генные карты: КМТ5А
Номер ЕС2.1.1.354
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человек)[1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение KMT5A
Геномное расположение KMT5A
Группа12q24.31Начинать123,383,773 бп[1]
Конец123,409,353 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE SETD8 220200 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_030241
NM_001310723
NM_001310725
NM_001310727

RefSeq (белок)

NP_001297652
NP_001297654
NP_001297656
NP_084517

Расположение (UCSC)Chr 12: 123.38 - 123.41 МбChr 5: 124.44 - 124.46 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

N-лизинметилтрансфераза KMT5A является фермент что у людей кодируется КМТ5А ген.[5][6][7][8] Фермент - это гистон-метилтрансфераза, SET, содержащие домен и специфичный для лизина. Фермент переносит один метильная группа к гистон H4 лизин остаток в положении 20. S-Аденозилметионин (SAM) одновременно кофактор и донор метильной группы. Остаток лизина превращается в N6-метиллизин остаток.

Крайний левый: боковая цепь лизина. Следующий: N6-метиллизиновая боковая цепь.

Эта модификация гистонов часто обозначается сокращенно H4K20me1:

  • H4 - тип гистона
  • К - символ лизина
  • 20 - положение остатка лизина модифицировано
  • я - сокращение от метильной группы
  • 1 - количество переданных метильных групп

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000183955 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000049327 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Couture JF, Collazo E, Brunzelle JS, Trievel RC (июнь 2005 г.). «Структурный и функциональный анализ SET8, метилтрансферазы гистона H4 Lys-20». Гены и развитие. 19 (12): 1455–65. Дои:10.1101 / gad.1318405. ЧВК  1151662. PMID  15933070.
  6. ^ Nishioka K, Rice JC, Sarma K, Erdjument-Bromage H, Werner J, Wang Y, Chuikov S, Valenzuela P, Tempst P, Steward R, Lis JT, Allis CD, Reinberg D (июнь 2002 г.). «PR-Set7 представляет собой метилтрансферазу, специфичную для нуклеосом, которая модифицирует лизин 20 гистона H4 и связана с молчащим хроматином». Молекулярная клетка. 9 (6): 1201–13. Дои:10.1016 / S1097-2765 (02) 00548-8. PMID  12086618.
  7. ^ Фанг Дж., Фэн Кью, Кетель С.С., Ван Х., Цао Р., Ся Л., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Саймон Дж. А., Чжан Ю. (июль 2002 г.). «Очистка и функциональная характеристика SET8, нуклеосомной гистон H4-лизин-20-специфической метилтрансферазы». Текущая биология. 12 (13): 1086–99. Дои:10.1016 / S0960-9822 (02) 00924-7. PMID  12121615. S2CID  15504308.
  8. ^ «Ген Entrez: KMT5A лизинметилтрансфераза 5A [Homo sapiens (человек)]».

дальнейшее чтение

{{PBB_F Further_reading | цитаты =