LSM8 - LSM8

LSM8
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыLSM8, NAA38, гомолог LSM8, связанная с малой ядерной РНК U6
Внешние идентификаторыOMIM: 607288 MGI: 1923772 ГомолоГен: 9419 Генные карты: LSM8
Расположение гена (человек)
Хромосома 7 (человек)
Chr.Хромосома 7 (человек)[1]
Хромосома 7 (человек)
Геномное расположение LSM8
Геномное расположение LSM8
Группа7q31.31Начните118,184,144 бп[1]
Конец118,204,035 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE LSM8 219119 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_016200

NM_133939

RefSeq (белок)

NP_057284

NP_598700

Расположение (UCSC)Chr 7: 118.18 - 118.2 МбChr 6: 18,85 - 18,86 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

U6 snRNA-ассоциированный Sm-подобный белок LSm8 это белок что у людей кодируется LSM8 ген.[5][6]

Этот ген является членом семейства LSm и кодирует белок с замкнутой бочкообразной формой, состоящий из пяти антипараллельных бета-цепей и альфа-спирали. Белок сотрудничает с шестью паралогами, образуя гетерогептамерное кольцо, которое временно связывает РНК и участвует в общем созревании РНК в ядре.[6]

Взаимодействия

LSM8 показал себя взаимодействовать с LSM2.[7][8]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000128534 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000044155 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Ахсель Т., Брамс Х., Кастнер Б., Бачи А., Вильм М., Лурманн Р. (декабрь 1999 г.). «Гетеромер Sm-подобных белков человека в форме пончика связывается с 3'-концом мяРНК U6, тем самым облегчая образование дуплекса U4 / U6 in vitro». EMBO J. 18 (20): 5789–802. Дои:10.1093 / emboj / 18.20.5789. ЧВК  1171645. PMID  10523320.
  6. ^ а б "Ген Entrez: LSM8 LSM8 гомолог, связанная с малой ядерной РНК U6 (S. cerevisiae)".
  7. ^ Ленер, Бен; Сандерсон Кристофер М. (июль 2004 г.). «Структура взаимодействия белков для деградации мРНК человека». Genome Res. 14 (7): 1315–23. Дои:10.1101 / gr.2122004. ISSN  1088-9051. ЧВК  442147. PMID  15231747.
  8. ^ Ленер, Бен; Семпл Дженнифер I; Браун Стефани Э; Советник Дамиан; Кэмпбелл Р. Дункан; Сандерсон Кристофер М. (январь 2004 г.). «Анализ высокопроизводительной двугибридной дрожжевой системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области III класса MHC человека». Геномика. 83 (1): 153–67. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. ISSN  0888-7543. PMID  14667819.

дальнейшее чтение