LZTR1 - LZTR1
Регулятор транскрипции, подобный лейциновой молнии 1 это белок что у людей кодируется LZTR1 ген.[5][6][7]
Ген LZTR1 предоставляет инструкции по созданию белка из класса суперсемейства широкого комплекса, tamtrack & Brick-a-bac / poxvirus и цинкового пальца (BTB / POZ). Суперсемейство белков выполняет широкий спектр функций, включая конденсацию хроматина во время конформации клеточного цикла. Другие названия, связанные с геном LZTR: BTBD29, LZTR-1, NS10, NS2, SWNTS2. Этот ген кодирует член BTB -кельч надсемейство. Первоначально описанный как предполагаемый регулятор транскрипции, основанный на слабой гомологии с членами основных лейциновая молния -подобное семейство, впоследствии было показано, что кодируемый белок локализуется исключительно в сети Гольджи, где он может помочь стабилизировать аппарат Гольджи.[7]
Функция
Основываясь на его роли в нескольких типах опухолей, считается, что белок LZTR1 действует как опухолевый супрессор. Супрессоры опухолей - это белки, которые не позволяют клеткам расти и делиться слишком быстро или неконтролируемым образом. LZTR1 - это неспецифический белок, который содержится во всех клетках тела. Считается, что он является регулятором транскрипции, который обычно разрушается на апоптотических клетках. Белок будет фосфорилирован по своим тирозиновым рецепторам, которые будут нацелены на его разложение. Внутриклеточно белки LZTR обнаруживаются в аппарате Гольджи. Исследования показывают, что белок LZTR1 может помочь стабилизировать эту структуру. Белок LTZR1, возможно, может быть связан с комплексом убиквитин-лигазы CUL3 (убиквитин-лигаза 3 на основе кулина), который помогает разрушать ненужные белки в клетке. Также было замечено, что белок LZTR будет ингибировать передачу сигналов Ras в мембране за счет снижения сродства Рас к мембране. Рас принадлежит к семье GTPases которые участвуют в регуляции транскрипции и активации ферментов Raf. Молекулы Raf будут каскадно фосфорилировать другие молекулы в организме, чтобы оказывать широкое влияние на клетку. Исследования с использованием иммунопреципитации эндогенного LZTR1 с последующим вестерн-блоттингом были использованы для определения функции гена LZTR. Улавливая комплексы LZTR1 из интактных клеток млекопитающих, Steklov et al. (2018) идентифицировали гуанозинтрифосфатазу RAS в качестве субстрата для комплекса LZTR1-CUL3.[8]
Ген
Ген LZTR 1 расположен на 22-й хромосоме, а точнее на длинном плече 22q11.21. Длина гена составляет примерно 16 768 пар оснований.
Мутации
Исследования показали, что мутации в гене LZTR1 были обнаружены в злокачественных раковых клетках в опухолях пациентов с глиобластомой. Эти мутации оказались соматическими, обычно вызванными факторами окружающей среды, а потеря гена LZTR1 наблюдается в клетках, которые бесконтрольно делятся.
Синдром ДиДжорджи
Синдром ДиДжорджи.[7] (известная как делеция 22q11.2), вызванная делецией в 22-й хромосоме. Некоторые из типичных симптомов, связанных с синдромом ДиДжорджи, - это особенности лица, врожденные пороки сердца и задержка развития. Последствия мутации LTZR1 были впервые диагностированы у пациентов с диагнозом ДиДжордж. Исследования показали, что делеция или мутация LZTR1 выявляются у большинства пациентов, у которых был диагностирован синдром ДиДжорджи. Возможности регуляции транскрипции гена LZTR1 могут играть важную роль в эмбриогенезе и наблюдаются в нескольких органах плода.[9]
Синдром Нунана
Синдром Нунана представляет собой аутосомно-доминантное мультисистемное заболевание, характеризующееся широким фенотипическим спектром, включая характерный лицевой дисморфизм, задержку послеродового роста, низкий рост, эктодермальные и скелетные дефекты, врожденные пороки сердца, почечные аномалии, лимфатические пороки, затруднения кровотечения и различные когнитивные нарушения.
Исследования показали, что в 29 генах было 163 варианта у пациентов, страдающих синдромом Нунана. В исследовании с использованием В Silco Программное обеспечение, гетерозиготная миссенс-мутация гена LZTR1 в экзоне 4 была наиболее патогенной.[10] Эта миссенс-мутация приведет к замене аланина на валин в первичной структуре аминокислоты белка LZTR.
Шванноматоз
У больных шванноматозом наблюдается более пятидесяти различных мутаций в гене LZTR1.[11] Этих мутаций недостаточно, чтобы вызвать заболевание, но они обычно связаны с ним. Соматические изменения, вызванные факторами окружающей среды, также наблюдаются у пациентов с шванноматозом. Когда ген изменен, белок LTZR не может функционировать должным образом, чтобы регулировать клеточный цикл, контролируя деление роста. Этот нерегулируемый рост приведет к раковому росту вдоль клеток Шванна.
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000099949 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022761 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Курахаси Х, Акаги К., Инадзава Дж., Охта Т., Ниикава Н., Каятани Ф., Сано Т., Окада С., Нишишо И. (сентябрь 1995 г.). «Выделение и характеристика нового гена, удаленного при синдроме Ди Джорджи». Хум Мол Генет. 4 (4): 541–9. Дои:10,1093 / чмг / 4.4.541. PMID 7633402.
- ^ Накак Т.Г., Лептиен К., Феллнер Д., Огюстин Г.Г., Кролл Дж. (Февраль 2006 г.). «Белок BTB-kelch LZTR-1 представляет собой новый белок Гольджи, который разрушается при индукции апоптоза». J Biol Chem. 281 (8): 5065–71. Дои:10.1074 / jbc.M509073200. PMID 16356934.
- ^ а б c «Ген Entrez: LZTR1, подобный лейциновой молнии, регулятор транскрипции 1».
- ^ "OMIM Entry - * 600574 - ТРАНСКРИПЦИОННЫЙ РЕГУЛЯТОР 1 ЛЕЙЦИНОВОГО МОЛНИИ; LZTR1". www.omim.org. Получено 2019-04-18.
- ^ Kurahashi, H .; Акаги, К .; Inazawa, J .; Охта, Т .; Niikawa, N .; Каятани, Ф .; Sano, T .; Окада, S .; Нишишо, И. (апрель 1995 г.). «Выделение и характеристика нового гена, удаленного при синдроме Ди Джорджи». Молекулярная генетика человека. 4 (4): 541–549. Дои:10,1093 / чмг / 4.4.541. ISSN 0964-6906. PMID 7633402.
- ^ Справка, Дом генетики. «Синдром Нунана». Домашний справочник по генетике. Получено 2019-04-18.
- ^ Пиотровски А., Се Дж., Лю Ю. Ф., Поплавски А. Б., Гомес А. Р., Маданецки П., Фу С., Кроули М. Р., Кроссман Д. К., Армстронг Л., Бабович-Вуксанович Д., Бергнер А., Блейкли Дж. О., Блюменталь А. Л., Дэниэлс М. С., Фейт Х, Гарднер К., Херст С., Кобелка С., Ли С., Надь Р., Рауэн К.А., Слопис Дж. М., Суваннарат П., Вестман Дж. А., Занко А., Корф Б. Р., Мессиан Л. М. (декабрь 2013 г.). «Мутации потери функции зародышевой линии в LZTR1 предрасполагают к наследственному заболеванию множественных шванном». Нат Жене. 46 (2): 182–7. Дои:10,1038 / нг.2855. ЧВК 4352302. PMID 24362817.
дальнейшее чтение
- Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК 1356129. PMID 16344560.
- Барриос-Родилес М., Браун К.Р., Оздамар Б. и др. (2005). «Высокопроизводительное отображение динамической сигнальной сети в клетках млекопитающих». Наука. 307 (5715): 1621–5. Bibcode:2005Научный ... 307.1621B. Дои:10.1126 / science.1105776. PMID 15761153.
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК 139146. PMID 9110174.
- Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Д.Ю. и др. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.