Майкл Эйзен - Википедия - Michael Eisen

Майкл Эйзен
Plos eisen.jpg
Майкл Эйзен
Родившийся
Майкл Брюс Эйзен

(1967-04-13) 13 апреля 1967 г. (возраст 53 года)
Бостон, Массачусетс, Соединенные Штаты
НациональностьАмериканец
Альма-матерГарвардский университет (AB, кандидат наук )
ИзвестенПубличная научная библиотека (PLOS)
НаградыПремия Бенджамина Франклина (биоинформатика) (2002)
Научная карьера
Поля
УчрежденияКалифорнийский университет в Беркли
ТезисСтруктурные исследования белков вируса гриппа А  (1996)
ДокторантДон Крейг Вайли[нужна цитата ]
Интернет сайт

Майкл Брюс Эйзен (родился 13 апреля 1967 г.) - американский компьютерный биолог и главный редактор журнала. eLife.[2] Он профессор генетика, геномика и разработка в Калифорнийский университет в Беркли.[3][4][5][6][7] Он является ведущим защитником научное издание открытого доступа и является соучредителем Публичная научная библиотека (PLOS). В 2018 году Айзен объявил свою кандидатуру. Сенат США от Калифорнии как Независимый, хотя он не прошел для голосования.[8]

ранняя жизнь и образование

Родился в Бостоне, Эйзен и его брат Джонатан были воспитаны в семье ученых. Их дед был рентгеновский кристаллограф, их отец, Говард Эйзен, врач, и мать, Лаура[9] биохимик. Они переехали в Бетесда, Мэриленд когда Эйзену было четыре или пять лет. Летом братья проводили на Лонг-Айленде со своими бабушкой и дедушкой. Эйзен утверждает, что он любил лягушек и саламандр. «Даже больше, чем у меня есть фетиш на лягушек, у меня есть болотный фетиш. Мне очень нравится быть в болотах». Он также очень интересовался математикой и был капитаном математической команды средней школы . Эйзен окончил Средняя школа Уолта Уитмена в 1985 году. Намереваясь получить специализацию по математике в Гарвардском университете, он понял, что там [он может встретить] других более блестящих студентов-математиков, это было Хорошая будет охота Момент, и он решил, что не хочет специализироваться на математике: «Вы не хотите быть Сальери для Моцарта». В течение своих лет в Гарварде Эйзен работал над «открытием трехмерных структур белков». Ему показали Микрочип ДНК который научил его «новому способу заниматься биологией».[10]

Эйзен получил докторскую степень в Гарвардский университет в биофизике и B.S. (также из Гарварда) по математике.[11] Он находился под присмотром Дон Крейг Вайли[12] во время учебы Вирус гриппа А Белки.[13]

Есть вещи, которые действительно действительно трудны, это те проблемы, над которыми нужно работать. Не так-то просто отличить невозможную проблему от действительно очень сложной. Но научиться этому критически важно. - Вещи, которые я узнал из работы с Пэтом Брауном - 2015 [12]

Получив докторскую степень, Эйзен был научным сотрудником в Стэндфордский Университет в лаборатории Дэвид Ботштейн, где он наиболее заметно разработал метод интерпретации данных экспрессии генов с микрочипов. Основополагающее исследование этого проекта, автором которого является Эйзен, было процитировано более 16 000 раз.[14]

Бейсбол и биология

Когда Эйзен жил в Теннесси, он работал диктор игры для бейсбольной команды низшей лиги,[11] то Columbia Mules. Он самопровозглашенный Red Sox фанатик.[10] Он и компьютерный биолог Джеймс Фрейзер записали для iBiology видео о роли бейсбольной статистики в их исследованиях. Их аргумент состоит в том, что секвенирование ДНК похоже на подсчет очков в бейсбольном матче, и что многие компьютерные биологи научились думать о научных вычислениях из-за навязчивого интереса к бейсбольной статистике. Упражнение по сравнению статистики конкретного игрока с базой данных других похожих игроков позволяет фанату бейсбола предсказать будущие результаты. Эта же система работает с белками и функциями прогнозирования. По мере разработки инструментов, которые анализируют и отслеживают всю статистику, касающуюся бейсболистов, технологии улучшаются вместе с генетикой. Как в бейсболе, так и в генетике разрабатываются инструменты, уточняющие модели.[15] На лекции в 2015 году Эйзен заявил, что получил компьютер от своего деда на свой двенадцатый день рождения, и следующие пять лет потратил на обучение программированию, чтобы он мог отслеживать бейсбольную статистику.[12]

Исследование

Его академические исследования сосредоточены на эволюция из генная регуляция.[16][17][18][19] Несмотря на такую ​​направленность, работа Эйзена исторически охватывала очень разные дисциплины. Например, его 5 наиболее цитируемых работ охватывают широкий круг тем, включая методы иерархическая кластеризация,[16] приложения к человеку рак груди (с Дэвид Ботштейн и Шарль Перу),[5] и открытие подтипов опухолей в диффузная В-клеточная лимфома большого размера (с Аш Ализаде и Луи Штаудт ).[17] Его дальнейшая исследовательская работа продолжалась плодовые мошки и Дрозофила[20] и как они «развиваются из крошечного одноклеточного яйца до зрелого взрослого. Он говорит, что они понимают, что с возрастом у людей идет не так».[11] Он получает финансирование от Медицинский институт Говарда Хьюза за его исследования.[20]

Гонка в Сенате США 2018

Айзен объявил через Twitter 25 января о своем намерении баллотироваться в Сенат США от Калифорнии в 2018 году для сенатора-демократа Дайан Файнштейн место, зарегистрировав дескриптор Twitter Сенатор.[21] Его предвыборный лозунг был «Свобода, равенство, реальность». Причины, по которым Эйзен баллотировался в Конгресс, включали его веру в то, что Администрация Трампа не отвечает на изменение климата и другие вопросы, связанные с наукой. Другой причиной, по которой Эйзен решил баллотироваться, был его опыт наблюдения за тем, как назначенные Кабинетом министров брали интервью в Сенате об изменении климата. Он подумал: «Было бы очень хорошо, если бы ученые задавали вопросы назначенным в Кабинет министров, потому что сенаторы, похоже, не понимают проблемы и задают неправильные вопросы».[11] Он считает, что для того, чтобы наука была на переднем крае разработки политики, «ученые должны баллотироваться на должности». Он чувствовал, что Калифорния 2018 года праймериз в джунглях дала ему больше шансов попасть в последние два на всеобщих выборах, но он не попал в два последних (которыми были Дайанна Файнштейн и Кевин де Леон ).[11]

В течение очень долгого времени ученые наблюдали, как политические процессы разрушаются, и наблюдали, как политики открыто высмеивают науку, игнорируя роль, которую наука играет в нашей повседневной жизни. Ученые сидели здесь, надеясь, что кто-нибудь придет и защитит этих принципов. На мой взгляд, политика должна функционировать аналогично науке. Мы должны попытаться выяснить, что происходит в мире, а затем обсудить, как это сделать, чтобы сделать мир лучше. Лучшие инструменты, которые у нас есть для характеристики реальности, - это инструменты наблюдения, которые наука использует постоянно. Слишком много политики отвергло тот основной принцип, что ученые все время живут и дышат.[11]

Эйзен выбыл из гонки, когда не прошел квалификацию на первичное голосование в июне 2018 года.[22]

Защита открытого доступа

На протяжении всей своей карьеры он был защитником "открытая наука ", которая представляет собой бесплатное распространение материального и интеллектуального продукта научных исследований. Он является ведущим сторонником научное издание открытого доступа[23][24][25] и является соучредителем Публичная научная библиотека (PLOS) и входит в правление PLOS, Академический руководящий и адвокационный комитет Открытая гуманитарная библиотека,[26] и является советником Science Commons.

В 2012 году Эйзен начал протестовать против Закон о научно-исследовательских работах как часть его призыва содействовать открытому доступу к информации.[27]

Награды и отличия

В 2002 году Айзен был удостоен первой Премия Бенджамина Франклина в биоинформатике за его работу над PLOS и доступность его программного обеспечения кластерного анализа микрочипов в открытом доступе.[28]

Рекомендации

  1. ^ Майкл Эйзен публикации, проиндексированные Google ученый
  2. ^ "eLife приветствует Майкла Эйзена в качестве главного редактора". eLife. 2019-03-05. Получено 2019-03-05.
  3. ^ "Майкл Б. Эйзен, доктор философии". Медицинский институт Говарда Хьюза. Получено 23 сентября 2013.
  4. ^ Публикации Майкла Эйзена индексируется Scopus библиографическая база данных. (требуется подписка)
  5. ^ а б Perou, C.M .; Sørlie, T; Eisen, M. B .; Ван Де Рейн, М; Джеффри, С. С .; Rees, C.A .; Pollack, J. R .; Росс, Д. Т .; Johnsen, H; Акслен, Л. А .; Fluge, O; Пергаменщиков А; Уильямс, C; Zhu, S. X .; Lønning, P.E .; Børresen-Dale, A. L .; Brown, P.O .; Ботштейн, Д. (2000). «Молекулярные портреты опухолей груди человека». Природа. 406 (6797): 747–52. Дои:10.1038/35021093. PMID  10963602. S2CID  1280204.
  6. ^ Айер, В. Р. (1999). «Программа транскрипции в ответе фибробластов человека на сыворотку». Наука. 283 (5398): 83–7. Bibcode:1999Научный ... 283 ... 83I. Дои:10.1126 / science.283.5398.83. PMID  9872747.
  7. ^ Росс, Д. Т .; Scherf, U; Eisen, M. B .; Perou, C.M .; Рис, C; Spellman, P; Айер, В; Джеффри, С. С .; Ван Де Рейн, М; Уолтем, М. Пергаменщиков А; Lee, J.C .; Лашкари, Д; Шалон, Д; Myers, T. G .; Weinstein, J. N .; Botstein, D; Браун, П. О. (2000). «Систематические вариации в паттернах экспрессии генов в линиях раковых клеток человека». Природа Генетика. 24 (3): 227–35. Дои:10.1038/73432. PMID  10700174. S2CID  1135137.
  8. ^ CohenJan. 27, Джон; 2017; Вечер, 15:30 (27.01.2017). «Вопросы и ответы: Майкл Эйзен претендует на должность первого биолога по мухам в Сенате США». Наука | AAAS. Получено 2020-04-13.CS1 maint: числовые имена: список авторов (связь)
  9. ^ Оки, Сьюзен. "УЧЕНЫЙ ИЗ NIH САМОУБИЙСТВО НА ПРОБЛЕМЕ БУМАГИ". Вашингтон Пост. Получено 7 февраля 2017.
  10. ^ а б Механик, Майкл. «Украдите эту исследовательскую работу! (Вы уже заплатили за это.)». Мать Джонс. Получено 7 февраля 2017.
  11. ^ а б c d е ж Кригер, Лиза (2017-02-04). «Молекулярный биолог из области залива Майкл Эйзен объявляет заявку на избрание в Сенат США». Новости Калифорнии. Новости Сан-Хосе Меркьюри. Получено 7 февраля 2017.
  12. ^ а б c «Майкл Эйзен: бейсбол, математика и биология». Индия Био Наука. Получено 7 февраля 2017.
  13. ^ Эйзен, Майкл Брюс (1996). Структурные исследования белков вируса гриппа А (Кандидатская диссертация). Гарвардский университет. OCLC  48938206.
  14. ^ Эйзен, МБ; Spellman, PT; Браун, ПО; Ботштейн, Д. (8 декабря 1998 г.). «Кластерный анализ и отображение паттернов экспрессии всего генома». Proc Natl Acad Sci U S A. 95 (25): 14863–8. Bibcode:1998PNAS ... 9514863E. Дои:10.1073 / пнас.95.25.14863. ЧВК  24541. PMID  9843981.
  15. ^ "Джеймс Фрейзер и Майкл Эйзен: бейсбол встречается с биологией". Образование. iBiology. Получено 7 февраля 2017.
  16. ^ а б Эйзен, М.; Spellman, P .; Браун, П.; Ботштейн, Д. (1998). «Кластерный анализ и отображение паттернов экспрессии всего генома». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (25): 14863–14868. Bibcode:1998PNAS ... 9514863E. Дои:10.1073 / пнас.95.25.14863. ЧВК  24541. PMID  9843981.
  17. ^ а б Ализаде, А. А .; Эйзен, М.; Дэвис, Р. Э .; Ma, C .; Lossos, I. S .; Розенвальд, А .; Boldrick, J.C .; Sabet, H .; Тран, Т .; Yu, X .; Powell, J. I .; Ян, Л .; Марти, Г. Э .; Мур, Т .; Hudson Jr, J .; Lu, L .; Lewis, D. B .; Tibshirani, R .; Шерлок, Дж .; Chan, W. C .; Greiner, T. C .; Weisenburger, D. D .; Armitage, J. O .; Warnke, R .; Levy, R .; Wilson, W .; Grever, M. R .; Byrd, J.C .; Botstein, D .; Браун, П. О. (2000). «Определенные типы диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфомы, идентифицированные с помощью профилирования экспрессии генов». Природа. 403 (6769): 503–511. Bibcode:2000Натура 403..503А. Дои:10.1038/35000501. PMID  10676951. S2CID  4382833.
  18. ^ Drosophila 12 Genomes, Консорциум; Clark, A.G .; Эйзен, М.; Smith, D. R .; Bergman, C.M .; Оливер, B; Марков, Т. А .; Kaufman, T. C .; Келлис, М; Гелбарт, Вт; Айер, В. Н .; Поллард, Д. А .; Sackton, T. B .; Larracuente, A.M .; Сингх, Н. Д .; Abad, J. P .; Abt, D. N .; Адриан, Б; Агуаде, М; Акаши, H; Андерсон, В. В .; Aquadro, C.F .; Ardell, D. H .; Arguello, R; Artieri, C.G .; Барбаш, Д. А .; Баркер, Д; Barsanti, P; Баттерхэм, П; и другие. (2007). «Эволюция генов и геномов на филогении дрозофилы». Природа. 450 (7167): 203–18. Bibcode:2007Натура.450..203С. Дои:10.1038 / природа06341. PMID  17994087.
  19. ^ Spellman, P.T .; Шерлок, Дж .; Zhang, M. Q .; Айер, В. Р .; Андерс, К .; Eisen, M. B .; Brown, P.O .; Botstein, D .; Футчер, Б. (1998). «Комплексная идентификация генов, регулируемых клеточным циклом дрожжей Saccharomyces cerevisiae, с помощью гибридизации микрочипов». Молекулярная биология клетки. 9 (12): 3273–97. Дои:10.1091 / mbc.9.12.3273. ЧВК  25624. PMID  9843569.
  20. ^ а б Хармон, Эми; Генри Фонтан (06.02.2017). «В эпоху Трампа ученые демонстрируют признаки политического импульса». Нью-Йорк Таймс. NYT. Получено 7 февраля 2017.
  21. ^ Рирдон, Сара (2017). «Генетик подает заявку на избрание Сената США». Природа. Дои:10.1038 / природа.2017.21381. S2CID  78431422. Получено 7 февраля 2017.
  22. ^ "Майкл Эйзен". Баллотпедия. Получено 2020-04-13.
  23. ^ Эйзен, Майкл (8 октября 2003 г.). «Публикуй и хвалийся». Хранитель. Получено 23 сентября 2013.
  24. ^ Браун, П. О.; Эйзен, М.; Вармус, Х. (2003). «Почему PLoS стала издателем». PLOS Биология. 1 (1): E36. Дои:10.1371 / journal.pbio.0000036. ЧВК  212706. PMID  14551926.
  25. ^ https://www.wired.com/wired/archive/12.04/rave_pr.html 2004 Проводной журнал Rave Awards «За то, что сломал хребет научному картелю»
  26. ^ Ховард, Дженнифер (29 января 2013 г.). «Проект направлен на привнесение открытости в стиле PLoS в гуманитарные науки». Хроника высшего образования. Получено 19 ноября 2013.
  27. ^ Доббс, Дэвид (6 января 2012 г.). «Конгресс рассматривает возможность платного доступа к науке, за которую вы уже заплатили». wired.com. Получено 12 февраля 2012.
  28. ^ "Премия Бенджамина Франклина - Bioinformatics.org". www.bioinformatics.org. Получено 7 февраля 2017.

внешняя ссылка