Оптическая проекционная томография - Optical projection tomography
Оптическая проекционная томография это форма томография с участием оптическая микроскопия.[1] Техника OPT иногда упоминается в литературе как оптическая компьютерная томография (оптическая-CT) и оптико-эмиссионная компьютерная томография (оптическая-ECT), чтобы указать на тот факт, что метод имеет сходство с Рентгеновская компьютерная томография (CT) и однофотонная эмиссионная компьютерная томография (ОФЭКТ).[2]
Во многих отношениях это оптический эквивалент Рентгеновская компьютерная томография или медицинская компьютерная томография. OPT отличается тем, что часто использует ультрафиолетовые, видимые и ближние инфракрасные фотоны, а не рентгеновские фотоны. Однако основная математика и алгоритмы реконструкции, используемые для CT и OPT, похожи; Например, преобразование радона или же итеративная реконструкция на основе данных проекции используются как при медицинской компьютерной томографии, так и при OPT для 3D-реконструкции.
И медицинская КТ, и ОПТ вычисляют трехмерные объемы на основе прохождения фотона через интересующий материал. Учитывая, что ткань обычно непрозрачна в ультрафиолетовом, видимом и ближнем инфракрасном спектрах, ткань необходимо сначала очистить с помощью оптического очищающего агента, чтобы свет мог пройти. Обычные оптические очищающие агенты включают BABB и метилсалицилат (винтергрин).
OPT может принимать две основные формы - режим передачи и режим излучения. В режиме пропускания, когда свет проходит через оптически очищенный образец, можно получить структурную информацию об интересующем образце. В режиме излучения, когда образец освещается возбуждающим светом, можно получить функциональную информацию об интересующем образце. В тандеме с органами, полученными из генетически модифицированная мышь которые экспрессируют флуоресцентные белки, такие как зеленые флуоресцентные белки, режим излучения OPT может давать трехмерные изображения генетической экспрессии органа мыши.
Этот метод уже внес свой вклад в большое количество исследований, направленных на решение широкого круга биологических вопросов в различных системах, таких как человек, мыши, курица, муха, данио и растения. Более поздние адаптации позволили использовать эту технику для исследования образцов на шкале органов взрослых мышей.[3] отдельные ядра клеток и продольные оценки органные культуры.
Флуоресцентная оптическая проекционная томография визуализирует распределение красителей в образце.
Смотрите также
Рекомендации
- ^ «Оптическая проекционная томография как инструмент для трехмерной микроскопии и изучения экспрессии генов». Наука. 296 (5567): 541–5. Апрель 2002 г. Дои:10.1126 / science.1068206. PMID 11964482.
- ^ Олдхэм, Марк; Сахалкар, Харшад; Ван, Инь Минь; Го, Пэнги; Оливер, Тим; Бентли, Рекс; Вуяскович, Желько; Дьюхерст, Марк (2007). «Трехмерное изображение целых органов грызунов с использованием оптической компьютерной и эмиссионной томографии». Журнал биомедицинской оптики. 12 (1): 014009. Дои:10.1117/1.2709858.
- ^ "Алгоритмы обработки изображений для оптической проекционной томографии". IEEE Transactions по медицинской визуализации. 31 (1): 1–15. Январь 2012 г. Дои:10.1109 / TMI.2011.2161590. PMID 21768046.
внешняя ссылка
- https://web.archive.org/web/20101105182544/http://genex.hgu.mrc.ac.uk/OPT_Microscopy/optwebsite/frontpage/index.htm
- Видео I: Оптическая проекционная томография левой боковой доли печени мыши.
- Видео II: Оптическая проекционная томография эмбрионального желудка, кишечника и поджелудочной железы мыши.
- Внутренний мир хищных растений из Центра Джона Иннеса