P4HA1 - P4HA1

P4HA1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1TJC, 2В5Ф, 2YQ8, 4BT8, 4BT9, 4BTA, 4БТБ
Идентификаторы
Псевдонимы	P4HA1, P4HA, субъединица альфа-1 пролил-4-гидроксилазы
Внешние идентификаторы	OMIM: 176710 MGI: 97463 ГомолоГен: 30998 Генные карты: P4HA1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 10 (человек)
Конец	73,096,974 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 10 (мышь)
Конец	59,373,304 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание ионов железа; • Связывание L-аскорбиновой кислоты; • оксидоредуктазная активность; • GO: 0001948 связывание с белками; • оксидоредуктазная активность, действующая на отдельных доноров с включением молекулярного кислорода, включение двух атомов кислорода; • активность диоксигеназы; • Проколлаген-пролин-4-диоксигеназная активность; • оксидоредуктазная активность, действующая на парных доноров, с включением или восстановлением молекулярного кислорода; • связывание ионов металлов; • идентичное связывание с белками;
Сотовый компонент	• Проколлаген-пролин-4-диоксигеназный комплекс; • эндоплазматический ретикулум; • митохондрия; • мембрана; • внутриклеточная мембраносвязанная органелла; • просвет эндоплазматического ретикулума;
Биологический процесс	• гидроксилирование пептидил-пролина до 4-гидрокси-L-пролина; • окислительно-восстановительный процесс; • организация фибрилл коллагена;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5033
	18451
	ENSG00000122884
	ENSMUSG00000019916
	P13674
	Q60715
	NM_001142596; NM_000917; NM_001017962; NM_001142595
	NM_011030; NM_001316370; NM_001316371
	NP_000908; NP_001017962; NP_001136067; NP_001136068
	NP_001303299; NP_001303300; NP_035160
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Субъединица альфа-1 пролил-4-гидроксилазы является фермент что у людей кодируется P4HA1 ген.^[5]^[6]

Этот ген кодирует компонент пролил 4-гидроксилаза, ключевой фермент в коллаген синтез, состоящий из двух идентичных альфа-субъединиц и двух бета-субъединиц. Кодируемый белок является одним из нескольких различных типов альфа-субъединиц и обеспечивает большую часть каталитического сайта активного фермента. В коллагене и родственных белках пролил-4-гидроксилаза катализирует образование 4-гидроксипролин это важно для правильного трехмерного сворачивания вновь синтезированных проколлаген цепи. Альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие разные изоформы были описаны.^[6]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000122884 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019916 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Паюнен Л., Джонс Т.А., Хелаакоски Т., Пихлаяниеми Т., Соломон Э., Шеер Д., Кивирикко К.И. (январь 1990 г.). «Отнесение гена, кодирующего альфа-субъединицу пролил-4-гидроксилазы к области хромосомы человека 10q21.3-23.1». Am J Hum Genet. 45 (6): 829–34. ЧВК 1683466. PMID 2556027.
^ ^а ^б «Ген Entrez: проколлаген-пролин P4HA1, 2-оксоглутарат-4-диоксигеназа (пролин-4-гидроксилаза), альфа-полипептид I».

дальнейшее чтение

Хелаакоски Т., Вуори К., Мюллюла Р. и др. (1989). «Молекулярное клонирование альфа-субъединицы человеческой пролил-4-гидроксилазы: полная аминокислотная последовательность, полученная из кДНК, и доказательства альтернативного сплайсинга транскриптов РНК». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 86 (12): 4392–6. Дои:10.1073 / pnas.86.12.4392. ЧВК 287275. PMID 2543975.
Хелаакоски Т., Вейола Дж., Вуори К. и др. (1994). «Структура и экспрессия человеческого гена альфа-субъединицы пролил-4-гидроксилазы. Два альтернативно сплайсированных типа мРНК соответствуют двум гомологичным экзонам, последовательности которых экспрессируются в различных тканях». J. Biol. Chem. 269 (45): 27847–54. PMID 7961714.
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Аннунен П., Хелаакоски Т., Мюллюхарью Дж. И др. (1997). "Клонирование изоформы альфа-субъединицы пролил-4-гидроксилазы человека альфа (II) и характеристика тетрамера фермента типа II. Альфа (I) и альфа (II) субъединицы не образуют смешанного альфа (I) альфа (II) бета2 тетрамер ". J. Biol. Chem. 272 (28): 17342–8. Дои:10.1074 / jbc.272.28.17342. PMID 9211872.
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Хорелли-Куйтунен Н., Квист А.П., Хелаакоски Т. и др. (1998). «Порядок и транскрипционная ориентация генов COL13A1 и P4HA человека на длинном плече хромосомы 10 определены с помощью FISH с высоким разрешением». Геномика. 46 (2): 299–302. Дои:10.1006 / geno.1997.5015. PMID 9417920.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Делукас П., Earthrowl ME, Grafham DV, et al. (2004). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 10 человека». Природа. 429 (6990): 375–81. Дои:10.1038 / природа02462. PMID 15164054.
Равендран М., Сентил Д., Утама Б. и др. (2004). «Сигарета подавляет экспрессию P4Halpha и производство коллагена в сосудах». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 323 (2): 592–8. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.08.129. PMID 15369792.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Фэлинг М., Мровка Р., Стиге А. и др. (2006). «Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин-A2 / B1 модулирует коллаген-пролил-4-гидроксилазу, стабильность альфа (I) мРНК». J. Biol. Chem. 281 (14): 9279–86. Дои:10.1074 / jbc.M510925200. PMID 16464861.
Chen L, Shen YH, Wang X и др. (2006). «Транскрипция человеческой пролил-4-гидроксилазы альфа (I) опосредуется вышестоящими стимулирующими факторами». J. Biol. Chem. 281 (16): 10849–55. Дои:10.1074 / jbc.M511237200. ЧВК 2819823. PMID 16488890.
Фэлинг М., Мровка Р., Стиге А. и др. (2006). «Трансляционный контроль экспрессии гена пролил 4-гидроксилазы-альфа (I) коллагена в условиях гипоксии». J. Biol. Chem. 281 (36): 26089–101. Дои:10.1074 / jbc.M604939200. PMID 16837461.
Гриммер С., Бальбус Н., Ланг У и др. (2006). «Регулирование синтеза коллагена II типа при остеоартрозе пролил-4-гидроксилазами: возможное влияние низкого уровня кислорода». Am. Дж. Патол. 169 (2): 491–502. Дои:10.2353 / ajpath.2006.050738. ЧВК 1698781. PMID 16877351.
Койвунен П., Хирсиля М., Кивирикко К.И., Мюллюхарью Дж. (2006). «Длина пептидных субстратов оказывает заметное влияние на гидроксилирование пролил-4-гидроксилазами индуцируемого гипоксией фактора». J. Biol. Chem. 281 (39): 28712–20. Дои:10.1074 / jbc.M604628200. PMID 16885164.

Эта статья о ген на хромосома человека 10 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000122884 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019916 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid2556027-5] Паюнен Л., Джонс Т.А., Хелаакоски Т., Пихлаяниеми Т., Соломон Э., Шеер Д., Кивирикко К.И. (январь 1990 г.). «Отнесение гена, кодирующего альфа-субъединицу пролил-4-гидроксилазы к области хромосомы человека 10q21.3-23.1». Am J Hum Genet. 45 (6): 829–34. ЧВК 1683466. PMID 2556027.

[entrez-6] а ^б «Ген Entrez: проколлаген-пролин P4HA1, 2-оксоглутарат-4-диоксигеназа (пролин-4-гидроксилаза), альфа-полипептид I».

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]