PAN домен - PAN domain

PAN_1
PDB 1hky EBI.jpg
состав раствора модуля поддона из eimeria tenella
Идентификаторы
СимволPAN_1
PfamPF00024
Pfam кланCL0168
ИнтерПроIPR003014
PROSITEPDOC00376
SCOP21 бат / Объем / СУПФАМ

СКОВОРОДА домены обладают значительной функциональной универсальностью, выполняя разнообразные биологический роли путем посредничества белок-протеин и белок-углеводные взаимодействия.[1] Эти домены содержат петля для волос подобная структура, аналогичная найденной в узелки но с другим образцом дисульфидные связи.

Было показано, что N-концевые домены членов группы плазминоген /фактор роста гепатоцитов семья, яблочные владения плазма прекалликреин /фактор коагуляции XI семья, и домены различных нематода белки принадлежат к одному суперсемейству модулей, модулю PAN.[1] Домен PAN содержит консервированный ядро из трех дисульфидных мостиков. У некоторых членов семейства есть дополнительный четвертый дисульфидный мостик, который связывает N- и C-конец домена.

Домен Apple, как и другие примеры домена PAN, состоит из 7 β-тяжи которые складываются в изогнутые антипараллельные простынь качать α-спираль. Две дисульфидные связи фиксируют спираль на центральных цепях β4 и β5, тогда как третья соединяет N- и C-концы домена. В яблочном домене петля β4-β5 и петля кроссовера β5-β6 создают небольшой карман на противоположной стороне листа от α-спирали.[2]

В нативном плазминогене домен PAN связан с пятью крингл домены.[3] Взаимодействия между доменом PAN и кринглами играют решающую роль в стабилизации четвертичного комплекса природного плазминогена;

Рекомендации

  1. ^ а б Тордай Х., Баньяи Л., Патти Л. (ноябрь 1999 г.). «Модуль PAN: N-концевые домены плазминогена и фактора роста гепатоцитов гомологичны яблочным доменам семейства прекалликреина и новому домену, обнаруженному во многих белках нематод». FEBS Lett. 461 (1–2): 63–7. Дои:10.1016 / s0014-5793 (99) 01416-7. PMID  10561497. S2CID  29929643.
  2. ^ Эмсли Дж., Макьюэн П.А., Гайлани Д. (апрель 2010 г.). «Структура и функции фактора XI». Кровь. 115 (13): 2569–77. Дои:10.1182 / кровь-2009-09-199182. ЧВК  4828079. PMID  20110423.
  3. ^ Сюэ Й., Бодин С., Олссон К. (2012). «Кристаллическая структура природного плазминогена обнаруживает устойчивую к активации компактную конформацию». Дж. Тромб Хемост. 10 (7): 1385–96. Дои:10.1111 / j.1538-7836.2012.04765.x. PMID  22540246.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR003014