PARD6A - PARD6A

PARD6A
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1WMH
Идентификаторы
Псевдонимы	PARD6A, PAR-6A, PAR6, PAR6C, PAR6alpha, TAX40, TIP-40, регулятор полярности клеток семейства par-6 альфа
Внешние идентификаторы	OMIM: 607484 MGI: 1927223 ГомолоГен: 9661 Генные карты: PARD6A
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 16 (человек)
Конец	67,662,778 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 8 (мышь)
Конец	105,703,496 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание фактора транскрипции; • GTP-зависимое связывание с белками; • GO: 0001948 связывание с белками; • Связывание Rho GTPase; • связывание протеинкиназы C;
Сотовый компонент	• цитозоль; • проекция клетки; • мембрана; • двухклеточное плотное соединение; • взъерошить; • клеточная мембрана; • клеточная кора; • ядро клетки; • цитоплазма; • центросома; • центр организации микротрубочек; • цитоскелет; • соединение клеток; • центриолярный спутник; • макромолекулярный комплекс; • апикальная плазматическая мембрана;
Биологический процесс	• отрицательная регуляция фосфорилирования белков; • деление клеток; • обслуживание межклеточного перехода; • сборка двухклеточного плотного спая; • клеточный цикл; • GO: 0022415 вирусный процесс; • трансформирующий сигнальный путь бета-рецептора фактора роста; • Путь передачи сигналов Wnt, путь планарной полярности клеток; • положительная регуляция локализации белка на центросоме; • центросомный цикл; • установление или поддержание полярности клеток; • регуляция клеточной локализации; • положительное регулирование секреции белка;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	50855
	56513
	ENSG00000102981
	ENSMUSG00000005699
	Q9NPB6
	Q9Z101
	NM_001037281; NM_016948
	NM_001047435; NM_001047436; NM_001286344; NM_001286345; NM_019695
	NP_001032358; NP_058644
	NP_001040900; NP_001040901; NP_001273273; NP_001273274; NP_062669
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Разделение дефектных 6 гомологов альфа это белок что у людей кодируется PARD6A ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Этот ген является членом семейства PAR6 и кодирует белок с доменом PSD95 / Discs-large / ZO1 (PDZ) и доменом полу-Cdc42 / Rac интерактивного связывания (CRIB). Этот белок клеточной мембраны участвует в процессах асимметричного деления клеток и поляризации клеток как член мультибелкового комплекса. Белок также играет роль в эпителиально-мезенхимальном переходе (EMT), который характеризует инвазивный фенотип, связанный с метастатическими карциномами. Были охарактеризованы альтернативные варианты транскрипционного сплайсинга, кодирующие разные изоформы.^[7]

Недавнее исследование показывает, что Par6 ассоциирует с PKC-ι, но не с PKC-zeta при меланоме. Онкогенный PKC-йота может способствовать инвазии клеток меланомы за счет активации пути PKC-ι / Par6 во время ЕМТ. Ингибирование или нокдаун PKC-i приводило к увеличению уровней E-кадгерина и RhoA при одновременном снижении общего виментина, фосфорилированного виментина (S39) и Par6 в метастатических клетках меланомы. Эти результаты предполагают, что PKC-ι участвует в сигнальных путях, которые активируют ЕМТ при меланоме.^[8]

Взаимодействия

PARD6A был показан взаимодействовать с участием:

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000102981 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000005699 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Руссе Р., Фабр С., Десбуа С., Бантиньи Ф., Жалино П. (март 1998 г.). «С-конец онкобелка HTLV-1 Tax опосредует взаимодействие с доменом PDZ клеточных белков». Онкоген. 16 (5): 643–54. Дои:10.1038 / sj.onc.1201567. PMID 9482110.
^ ^а ^б ^c ^d Нода Й, Такея Р., Оно С., Наито С., Ито Т., Сумимото Х. (март 2001 г.). «Человеческие гомологи белка PAR6 клеточной полярности Caenorhabditis elegans в качестве адаптера, который связывает малые GTPases Rac и Cdc42 с атипичной протеинкиназой C». Гены Клетки. 6 (2): 107–19. Дои:10.1046 / j.1365-2443.2001.00404.x. PMID 11260256. S2CID 8789941.
^ ^а ^б «Ген Entrez: PARD6A par-6, разделяющий дефектный 6-альфа-гомолог (C. elegans)».
^ ^а ^б Ратнаяке WS, Апостолатос А.Х., Остров Д.А., Асеведо-Дункан М (2017). «Два новых атипичных ингибитора PKC; ACPD и DNDA эффективно уменьшают пролиферацию клеток и эпителиально-мезенхимальный переход метастатической меланомы, вызывая апоптоз». Int. Дж. Онкол. 51 (5): 1370–1382. Дои:10.3892 / ijo.2017.4131. ЧВК 5642393. PMID 29048609.
^ Джоберти Г., Петерсен С., Гао Л., Макара И.Г. (август 2000 г.). «Белок клеточной полярности Par6 связывает Par3 и атипичную протеинкиназу C с Cdc42». Nat. Cell Biol. 2 (8): 531–9. Дои:10.1038/35019573. PMID 10934474. S2CID 27139234.
^ ^а ^б Цю Р., Або А, Стивен Мартин Дж. (Июнь 2000 г.). «Человеческий гомолог детерминанты полярности C. elegans Par-6 связывает Rac и Cdc42 с передачей сигналов PKCzeta и трансформацией клеток». Curr. Биол. 10 (12): 697–707. Дои:10.1016 / s0960-9822 (00) 00535-2. PMID 10873802. S2CID 14825707.
^ ^а ^б Лю XF, Исида Х., Разиуддин Р., Мики Т. (август 2004 г.). «Фактор обмена нуклеотидов ECT2 взаимодействует с белковым комплексом полярности Par6 / Par3 / протеинкиназой Czeta (PKCzeta) и регулирует активность PKCzeta». Мол. Cell. Биол. 24 (15): 6665–75. Дои:10.1128 / MCB.24.15.6665-6675.2004. ЧВК 444862. PMID 15254234.
^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

дальнейшее чтение

Solecki DJ, Govek EE, Hatten ME (2006). «mPar6 альфа контролирует миграцию нейронов». J. Neurosci. 26 (42): 10624–5. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.4060-06.2006. ЧВК 6674730. PMID 17050699.
Цю Р., Або А, Стивен Мартин Дж. (2000). «Человеческий гомолог детерминанты полярности C. elegans Par-6 связывает Rac и Cdc42 с передачей сигналов PKCzeta и трансформацией клеток». Curr. Биол. 10 (12): 697–707. Дои:10.1016 / S0960-9822 (00) 00535-2. PMID 10873802. S2CID 14825707.
Джоберти Г., Петерсен С., Гао Л., Макара И.Г. (2000). «Белок клеточной полярности Par6 связывает Par3 и атипичную протеинкиназу C с Cdc42». Nat. Cell Biol. 2 (8): 531–9. Дои:10.1038/35019573. PMID 10934474. S2CID 27139234.
Йоханссон А., Дриссенс М., Аспенстрём П. (2000). «Гомолог белка полярности Caenorhabditis elegans PAR-6 у млекопитающих является партнером по связыванию для Rho GTPases Cdc42 и Rac1». J. Cell Sci. 113 (18): 3267–75. PMID 10954424.
Судзуки А., Яманака Т., Хиросе Т., Манабэ Н., Мидзуно К., Симидзу М., Акимото К., Изуми Ю., Ониси Т., Оно С. (2001). «Атипичная протеинкиназа С участвует в эволюционно законсервированном белковом комплексе par и играет важную роль в создании эпителиальных структур соединения».. J. Cell Biol. 152 (6): 1183–96. Дои:10.1083 / jcb.152.6.1183. ЧВК 2199212. PMID 11257119.
Кодзима М., Нода Й, Такея Р., Сайто Н., Такеучи К., Сумимото Х (2003). «PAR3beta, новый гомолог белка клеточной полярности PAR3, локализуется в плотных контактах». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 299 (4): 641–6. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 02698-0. PMID 12459187.
Херд Т.В., Гао Л., Ро М.Х., Макара И.Г., Марголис Б. (2003). «Прямое взаимодействие комплексов двух полярностей, участвующих в сборке плотных соединений эпителия». Nat. Cell Biol. 5 (2): 137–42. Дои:10.1038 / ncb923. PMID 12545177. S2CID 25212419.
Браженович М., Джоберти Г., Кюстер Б., Бауместер Т., Древес Г. (2004). «Всесторонний протеомный анализ человеческих белковых комплексов Par показывает взаимосвязанную белковую сеть». J. Biol. Chem. 279 (13): 12804–11. Дои:10.1074 / jbc.M312171200. PMID 14676191.
Леммерс К., Мишель Д., Лейн-Гермонпрез Л., Делгросси М. Х., Медина Е., Арсанто Дж. П., Ле Бивик А. (2004). «CRB3 напрямую связывается с Par6 и регулирует морфогенез плотных контактов в эпителиальных клетках млекопитающих». Мол. Биол. Ячейка. 15 (3): 1324–33. Дои:10.1091 / mbc.E03-04-0235. ЧВК 363137. PMID 14718572.
Weyrich P, Kapp K, Niederfellner G, Melzer M, Lehmann R, Häring HU, Lammers R (2005). «Белок с дефектом разделения 6 регулирует инсулинозависимый синтез гликогена с помощью атипичной протеинкиназы С.» Мол. Эндокринол. 18 (5): 1287–300. Дои:10.1210 / me.2003-0253. PMID 14976222.
Лю XF, Исида Х, Разиуддин Р., Мики Т (2004). «Фактор обмена нуклеотидов ECT2 взаимодействует с белковым комплексом полярности Par6 / Par3 / протеинкиназой Czeta (PKCzeta) и регулирует активность PKCzeta». Мол. Cell. Биол. 24 (15): 6665–75. Дои:10.1128 / MCB.24.15.6665-6675.2004. ЧВК 444862. PMID 15254234.
Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А., Шварц Д., Гиги С.П. (2005). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши». Мол. Cell. Протеомика. 3 (11): 1093–101. Дои:10.1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID 15345747.
Хирано Ю., Йошинага С., Такея Р., Сузуки Н. Н., Хориучи М., Кодзима М., Сумимото Н., Инагаки Ф. (2005). «Структура регулятора полярности клетки, комплекс между атипичными доменами PKC и Par6 PB1». J. Biol. Chem. 280 (10): 9653–61. Дои:10.1074 / jbc.M409823200. PMID 15590654.
Вейрих П., Ламмерс Р., Фриче А., Мачикао Ф., Херинг Х.У., Стефан Н. (2005). «Новый функциональный полиморфизм (-336A / G) в промоторе гена дефектного по распределению белка-6alpha связан с повышенной толерантностью к глюкозе и более низкими концентрациями неэтерифицированных жирных кислот в сыворотке». Диабетология. 48 (4): 669–74. Дои:10.1007 / s00125-005-1688-4. PMID 15744531.
Оздамар Б., Бозе Р., Барриос-Родилес М., Ван Х. Р., Чжан И., Врана Д. Л. (2005). «Регулирование полярности белка Par6 рецепторами TGFbeta контролирует пластичность эпителиальных клеток». Наука. 307 (5715): 1603–9. Дои:10.1126 / science.1105718. PMID 15761148. S2CID 41013935.
Барриос-Родилес М., Браун К.Р., Оздамар Б., Бозе Р., Лю З., Донован Р.С., Синджо Ф., Лю Ю., Дембовы Дж., Тейлор И. В., Луга В., Прзуль Н., Робинсон М., Сузуки Н., Хаяшизаки Ю., Юрисика И., Врана JL (2005). «Высокопроизводительное отображение динамической сигнальной сети в клетках млекопитающих». Наука. 307 (5715): 1621–5. Дои:10.1126 / science.1105776. PMID 15761153. S2CID 39457788.

Эта статья о ген на хромосома человека 16 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000102981 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000005699 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid9482110-5] Руссе Р., Фабр С., Десбуа С., Бантиньи Ф., Жалино П. (март 1998 г.). «С-конец онкобелка HTLV-1 Tax опосредует взаимодействие с доменом PDZ клеточных белков». Онкоген. 16 (5): 643–54. Дои:10.1038 / sj.onc.1201567. PMID 9482110.

[pmid11260256-6] а ^б ^c ^d Нода Й, Такея Р., Оно С., Наито С., Ито Т., Сумимото Х. (март 2001 г.). «Человеческие гомологи белка PAR6 клеточной полярности Caenorhabditis elegans в качестве адаптера, который связывает малые GTPases Rac и Cdc42 с атипичной протеинкиназой C». Гены Клетки. 6 (2): 107–19. Дои:10.1046 / j.1365-2443.2001.00404.x. PMID 11260256. S2CID 8789941.

[entrez-7] а ^б «Ген Entrez: PARD6A par-6, разделяющий дефектный 6-альфа-гомолог (C. elegans)».

[pmid29048609-8] а ^б Ратнаяке WS, Апостолатос А.Х., Остров Д.А., Асеведо-Дункан М (2017). «Два новых атипичных ингибитора PKC; ACPD и DNDA эффективно уменьшают пролиферацию клеток и эпителиально-мезенхимальный переход метастатической меланомы, вызывая апоптоз». Int. Дж. Онкол. 51 (5): 1370–1382. Дои:10.3892 / ijo.2017.4131. ЧВК 5642393. PMID 29048609.

[pmid10934474-9] Джоберти Г., Петерсен С., Гао Л., Макара И.Г. (август 2000 г.). «Белок клеточной полярности Par6 связывает Par3 и атипичную протеинкиназу C с Cdc42». Nat. Cell Biol. 2 (8): 531–9. Дои:10.1038/35019573. PMID 10934474. S2CID 27139234.

[pmid10873802-10] а ^б Цю Р., Або А, Стивен Мартин Дж. (Июнь 2000 г.). «Человеческий гомолог детерминанты полярности C. elegans Par-6 связывает Rac и Cdc42 с передачей сигналов PKCzeta и трансформацией клеток». Curr. Биол. 10 (12): 697–707. Дои:10.1016 / s0960-9822 (00) 00535-2. PMID 10873802. S2CID 14825707.

[pmid15254234-11] а ^б Лю XF, Исида Х., Разиуддин Р., Мики Т. (август 2004 г.). «Фактор обмена нуклеотидов ECT2 взаимодействует с белковым комплексом полярности Par6 / Par3 / протеинкиназой Czeta (PKCzeta) и регулирует активность PKCzeta». Мол. Cell. Биол. 24 (15): 6665–75. Дои:10.1128 / MCB.24.15.6665-6675.2004. ЧВК 444862. PMID 15254234.

[pmid16189514-12] Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]