PCBP1 - PCBP1

PCBP1
Белок PCBP1 PDB 1wvn.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыPCBP1, HEL-S-85, HNRPE1, HNRPX, hnRNP-E1, hnRNP-X, поли (rC) связывающий белок 1
Внешние идентификаторыOMIM: 601209 MGI: 1345635 ГомолоГен: 68506 Генные карты: PCBP1
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человек)[1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение PCBP1
Геномное расположение PCBP1
Группа2п13.3Начинать70,087,477 бп[1]
Конец70,089,203 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PCBP1 208620 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_006196

NM_011865

RefSeq (белок)

NP_006187

NP_035995

Расположение (UCSC)Chr 2: 70.09 - 70.09 МбChr 6: 86,52 - 86,53 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Поли (rC) -связывающий белок 1 это белок что у людей кодируется PCBP1 ген.[5]

Считается, что этот безинтронный ген был создан ретротранспозиция полностью процессированной мРНК PCBP-2. Этот ген и PCBP-2 имеют паралоги (PCBP3 и PCBP4), которые, как полагают, возникли в результате дублирования целых генов. Белок, кодируемый этим геном, кажется многофункциональным. Это вместе с PCBP2 и ГНРНПК соответствует основному клеточному поли (rC) -связывающему белку. Он содержит три K-гомологичный (KH) домены, которые могут участвовать в связывании РНК. Этот кодируемый белок вместе с ПКБП-2 также действует как трансляционные коактиваторы полиовирус РНК посредством специфичного для последовательности взаимодействия со стеблем-петлей IV IRES и способствует репликации РНК полиовируса путем связывания с его 5'-концевой структурой клеверного листа.

Он также участвует в контроле трансляции мРНК 15-липоксигеназы, вирус папилломы человека мРНК L2 типа 16 и гепатит А РНК вируса. Также предполагается, что кодируемый белок играет роль в формировании комплекса мРНП альфа-глобина, специфичного для последовательности, который связан со стабильностью мРНК альфа-глобина.[6]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000169564 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000051695 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Томмеруп Н., Лефферс Х (май 1997 г.). «Назначение генов, содержащих KH-бокс человека, путем гибридизации in situ: HNRNPK картируется с 9q21.32-q21.33, PCBP1 с 2p12-p13, а PCBP2 с 12q13.12-q13.13, дистальнее FRA12A». Геномика. 32 (2): 297–8. Дои:10.1006 / geno.1996.0121. PMID  8833161.
  6. ^ «Ген Entrez: связывающий поли (rC) белок 1 PCBP1».

дальнейшее чтение