PCDH8 - PCDH8

PCDH8
Идентификаторы
ПсевдонимыPCDH8, ARCADLIN, PAPC, протоколадгерин 8
Внешние идентификаторыOMIM: 603580 MGI: 1306800 ГомолоГен: 1943 Генные карты: PCDH8
Расположение гена (человек)
Хромосома 13 (человек)
Chr.Хромосома 13 (человек)[1]
Хромосома 13 (человек)
Геномное расположение PCDH8
Геномное расположение PCDH8
Группа13q14.3Начинать52,842,889 бп[1]
Конец52,848,641 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PCDH8 206935 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_032949
NM_002590

NM_001042726
NM_021543

RefSeq (белок)

NP_002581
NP_116567

NP_001036191
NP_067518

Расположение (UCSC)Chr 13: 52,84 - 52,85 МбChr 14: 79.77 - 79.77 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Протокадгерин-8 это белок что у людей кодируется PCDH8 ген.[5][6][7]

Этот ген принадлежит к семейству генов протокадгерина, подсемейству суперсемейства кадгеринов. Ген кодирует интегральный мембранный белок, который, как считается, функционирует в клеточной адгезии специфическим для ЦНС образом. В отличие от классических кадгеринов, которые обычно кодируются 15-17 экзонами, этот ген включает только 3 экзона. Следует отметить большой первый экзон, кодирующий внеклеточную область, включая 6 доменов кадгерина и трансмембранную область. Альтернативный сплайсинг дает изоформы с уникальными цитоплазматическими хвостами.[7]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000136099 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036422 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Strehl S, Glatt K, Liu QM, Glatt H, Lalande M (декабрь 1998 г.). «Характеристика двух новых протокадгеринов (PCDH8 и PCDH9), локализованных на хромосоме 13 человека и хромосоме 14 мыши». Геномика. 53 (1): 81–9. Дои:10.1006 / geno.1998.5467. PMID  9787079.
  6. ^ Strehl S, LaSalle JM, Lalande M (октябрь 1997 г.). «Анализ с высоким разрешением организации домена репликации ДНК через границу R / G-полосы». Mol Cell Biol. 17 (10): 6157–66. ЧВК  232466. PMID  9315676.
  7. ^ а б "Энтрез Ген: протокол 8 PCDH8".

дальнейшее чтение