POLDIP2 - POLDIP2

POLDIP2
Идентификаторы
ПсевдонимыPOLDIP2, PDIP38, POLD4, p38, дельта-взаимодействующий белок 2 с полимеразой (ДНК), дельта-взаимодействующий белок 2 с ДНК-полимеразой
Внешние идентификаторыOMIM: 611519 MGI: 1915061 ГомолоГен: 9201 Генные карты: POLDIP2
Расположение гена (человек)
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человек)[1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение POLDIP2
Геномное расположение POLDIP2
Группа17q11.2Начинать28,346,633 бп[1]
Конец28,357,527 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE POLDIP2 217806 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_015584
NM_001290145

NM_026389

RefSeq (белок)

NP_001277074
NP_056399

NP_080665

Расположение (UCSC)Chr 17: 28.35 - 28.36 МбChr 11: 78,51 - 78,52 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Полимеразный дельта-взаимодействующий белок 2 также известен как Полимеразный дельта-взаимодействующий белок 38 кДа (PDIP38) кодируется POLDIP2 ген в людях [5][6].

Этот ген кодирует белок, который взаимодействует с субъединицей ДНК-полимеразы дельта p50. Кодируемый белок также взаимодействует с ядерным антигеном пролиферирующих клеток. Некоторые транскрипты этого гена перекрываются в ориентации хвост к хвосту с геном фактора некроза опухоли, альфа-индуцированным белком 1 (TNFAIP1). [6]. POLDIP2 / PDIP38 - это подрабатывающий белок, который был идентифицирован в обоих ядрах [7] и митохондрия [8][9]

Взаимодействия

Было показано, что в ядре POLDIP2 взаимодействовать с PCNA [5], в то время как в митохондрии POLDIP2, как было показано, взаимодействует с белками, составляющими нуклеоид митохондриальной ДНК [10] и AAA + протеаза CLPXP [9][11] где он модулирует как специфичность, так и стабильность этой протеолитической машины.

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000004142 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001100 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б Лю Л., Родригес-Бельмонте Э.М., Мазлум Н., Се Б., Ли М.Ю. (март 2003 г.). «Идентификация нового белка PDIP38, который взаимодействует с субъединицей p50 дельта ДНК-полимеразы и ядерным антигеном пролиферирующих клеток». Журнал биологической химии. 278 (12): 10041–7. Дои:10.1074 / jbc.M208694200. PMID  12522211.
  6. ^ а б «Ген Entrez: полимераза POLDIP2 (ДНК-направленная), дельта-взаимодействующий белок 2».
  7. ^ Wong A, Zhang S, Mordue D, Wu JM, Zhang Z, Darzynkiewicz Z и др. (Октябрь 2013). «PDIP38 перемещается в сплайсосомы / ядерные спеклы в ответ на УФ-индуцированное повреждение ДНК и требуется для УФ-индуцированного альтернативного сплайсинга MDM2». Клеточный цикл. 12 (19): 3184–93. Дои:10.4161 / cc.26221. ЧВК  3865014. PMID  23989611.
  8. ^ Се Б., Ли Х, Ван Ц., Се С., Рахме А., Дай В., Ли М.И. (июнь 2005 г.). «Дальнейшая характеристика белка, взаимодействующего с дельта-дельта ДНК-полимеразой человека 38». Журнал биологической химии. 280 (23): 22375–84. Дои:10.1074 / jbc.M414597200. PMID  15811854.
  9. ^ а б Strack PR, Brodie EJ, Zhan H, Schuenemann VJ, Valente LJ, Saiyed T. и др. (Ноябрь 2020 г.). «Полимеразный дельта-взаимодействующий белок 38 (PDIP38) модулирует стабильность и активность митохондриальной AAA + протеазы CLPXP». Биология коммуникации. 3 (1): 646. Дои:10.1038 / с42003-020-01358-6. ЧВК  7647994. PMID  33159171.
  10. ^ Cheng X, Kanki T, Fukuoh A, Ohgaki K, Takeya R, Aoki Y и др. (Декабрь 2005 г.). «PDIP38 связывается с белками, составляющими нуклеоид митохондриальной ДНК». Журнал биохимии. 138 (6): 673–8. Дои:10.1093 / jb / mvi169. PMID  16428295.
  11. ^ Паредес Ф., Шелдон К., Лассег Б., Уильямс Х.С., Фейдли Э.А., Бенавидес Г.А. и др. (Февраль 2018). «Poldip2 - это чувствительный к кислороду белок, который контролирует липоилирование и активацию PDH и αKGDH для поддержки метаболической адаптации при гипоксии и раке». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 115 (8): 1789–1794. Дои:10.1073 / pnas.1720693115. ЧВК  5828627. PMID  29434038.

дальнейшее чтение