PPM1D - PPM1D

PPM1D
Идентификаторы
Псевдонимы	PPM1D, PP2C-DELTA, WIP1, протеинфосфатаза, Mg2 + / Mn2 + зависимая 1D, IDDGIP, JDVS
Внешние идентификаторы	OMIM: 605100 MGI: 1858214 ГомолоГен: 31185 Генные карты: PPM1D
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 17 (человек)
Конец	60,666,280 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 11 (мышь)
Конец	85,347,066 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• активность протеин-серин / треонинфосфатазы; • GO: 0001948 связывание с белками; • каталитическая активность; • фосфопротеинфосфатазная активность; • гидролазная активность; • связывание ионов металлов; • катионное связывание; • Связывание митоген-активированной протеинкиназы; • активность протеин-серин / треонинкиназы; • магний-зависимая активность протеин-серин / треонинфосфатазы;
Сотовый компонент	• нуклеоплазма; • ядро клетки; • цитоплазма; • цитозоль;
Биологический процесс	• клеточный ответ на голодание; • клеточный цикл; • реакция на радиацию; • дефосфорилирование белков; • G2 / M переход митотического клеточного цикла; • реакция на бактерии; • дефосфорилирование пептидил-треонина; • отрицательное регулирование пролиферации клеток; • Метилирование ДНК; • подавление хроматина; • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • фосфорилирование белков; • отрицательная регуляция экспрессии генов, эпигенетическая; • Ответ на повреждение ДНК, передача сигнала медиатором класса p53;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	8493
	53892
	ENSG00000170836
	ENSMUSG00000020525
	O15297
	Q9QZ67
	NM_003620
	NM_016910
	NP_003611
	NP_058606
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Протеиновая фосфатаза 1D является фермент что у людей кодируется PPM1D ген.^[5]^[6]

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства PP2C протеинфосфатаз Ser / Thr. Известно, что члены семейства PP2C являются негативными регуляторами путей реакции клеток на стресс. Экспрессия этого гена индуцируется р53-зависимым образом в ответ на различные стрессы окружающей среды. Будучи побуждаемым белок-супрессор опухолей TP53 / p53, эта фосфатаза негативно регулирует активность p38 MAP киназа (MAPK / p38), посредством которого он снижает фосфорилирование p53 и, в свою очередь, подавляет опосредованную p53 транскрипцию и апоптоз. Таким образом, эта фосфатаза опосредует регулирование по обратной связи передачи сигналов p38-p53, что способствует ингибированию роста и подавлению апоптоза, вызванного стрессом. Этот ген расположен в хромосомной области, которая, как известно, амплифицируется при раке груди. Амплификация этого гена была обнаружена как в клеточной линии рака груди, так и в первичных опухолях молочной железы, что предполагает роль этого гена в развитии рака.^[6]

Взаимодействия

PPM1D показал себя взаимодействовать с участием CDC5L.^[7]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000170836 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020525 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Фиселла М., Чжан Х., Фан С., Сакагути К., Шен С., Мерсер В.Е., Ванде Вуде Г.Ф., О'Коннор П.М., Аппелла Е. (июль 1997 г.). «Wip1, новая человеческая протеинфосфатаза, которая индуцируется в ответ на ионизирующее излучение p53-зависимым образом». Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (12): 6048–53. Bibcode:1997PNAS ... 94.6048F. Дои:10.1073 / пнас.94.12.6048. ЧВК 20998. PMID 9177166.
^ ^а ^б «Ген Entrez: протеинфосфатаза PPM1D 1D, магний-зависимая, дельта-изоформа».
^ Ajuh, P; Kuster B; Панов К; Zomerdijk J C; Mann M; Ламонд А. I (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ человеческого комплекса CDC5L и идентификация его компонентов с помощью масс-спектрометрии». EMBO J. 19 (23): 6569–81. Дои:10.1093 / emboj / 19.23.6569. ISSN 0261-4189. ЧВК 305846. PMID 11101529.

дальнейшее чтение

Адамс, доктор медицины, Керлаваж А.Р., Флейшманн, Р.Д. и др. (1995). «Первоначальная оценка разнообразия генов человека и паттернов экспрессии на основе 83 миллионов нуклеотидов последовательности кДНК» (PDF). Природа. 377 (6547 Прил.): 3–174. PMID 7566098.
Хирано К., Ито М., Хартсхорн DJ (1995). «Взаимодействие рибосомного белка L5 с протеинфосфатазой 1 типа». J. Biol. Chem. 270 (34): 19786–90. Дои:10.1074 / jbc.270.34.19786. PMID 7649987.
Такекава М., Адачи М., Накахата А. и др. (2001). «p53-индуцируемая фосфатаза wip1 опосредует регуляцию отрицательной обратной связи передачи сигналов p38 MAPK-p53 в ответ на УФ-излучение». EMBO J. 19 (23): 6517–26. Дои:10.1093 / emboj / 19.23.6517. ЧВК 305857. PMID 11101524.
Аджух П., Кустер Б., Панов К. и др. (2001). «Функциональный анализ человеческого комплекса CDC5L и идентификация его компонентов с помощью масс-спектрометрии». EMBO J. 19 (23): 6569–81. Дои:10.1093 / emboj / 19.23.6569. ЧВК 305846. PMID 11101529.
Чой Дж., Нанненга Б., Демидов О.Н. и др. (2002). «Мыши с дефицитом гена фосфатазы, индуцированного р53 дикого типа (Wip1), демонстрируют дефекты репродуктивных органов, иммунной функции и контроля клеточного цикла». Мол. Cell. Биол. 22 (4): 1094–105. Дои:10.1128 / MCB.22.4.1094-1105.2002. ЧВК 134641. PMID 11809801.
Ли Дж, Ян Й, Пэн Й и др. (2002). «Онкогенные свойства PPM1D, локализованного в эпицентре амплификации рака молочной железы в 17q23». Nat. Genet. 31 (2): 133–4. Дои:10.1038 / ng888. PMID 12021784. S2CID 5750250.
Булавин Д.В., Демидов О.Н., Сайто С. и др. (2002). «Амплификация PPM1D в опухолях человека отменяет активность супрессора опухолей p53». Nat. Genet. 31 (2): 210–5. Дои:10.1038 / ng894. PMID 12021785. S2CID 30048056.
Моримото Х., Окамура Х., Ханеджи Т (2002). «Взаимодействие протеинфосфатазы 1 дельта с нуклеолином в остеобластических клетках человека». J. Histochem. Cytochem. 50 (9): 1187–93. Дои:10.1177/002215540205000905. PMID 12185196.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Имабаяси Х., Мори Т., Годзё С. и др. (2003). «Повторная дифференцировка дедифференцированных хондроцитов и хондрогенез стромальных клеток костного мозга человека посредством образования хондросфер с профилированием экспрессии с помощью крупномасштабного анализа кДНК». Exp. Cell Res. 288 (1): 35–50. Дои:10.1016 / S0014-4827 (03) 00130-7. PMID 12878157.
Бернардс Р. (2004). «Устранение рака». Nat. Genet. 36 (4): 319–20. Дои:10.1038 / ng0404-319. PMID 15054481.
Лу X, Бокангель Д., Нанненга Б. и др. (2004). «Р53-индуцированная онкогенная фосфатаза PPM1D взаимодействует с урацил-ДНК-гликозилазой и подавляет эксцизионную репарацию оснований». Мол. Ячейка. 15 (4): 621–34. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.08.007. PMID 15327777.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Ямагути Х., Минополи Г., Демидов О.Н. и др. (2005). «Субстратная специфичность человеческой протеинфосфатазы 2Cdelta, Wip1». Биохимия. 44 (14): 5285–94. Дои:10.1021 / bi0476634. PMID 15807522.
Лу X, Nannenga B, Donehower LA (2005). «PPM1D дефосфорилирует Chk1 и p53 и отменяет контрольные точки клеточного цикла». Genes Dev. 19 (10): 1162–74. Дои:10.1101 / gad.1291305. ЧВК 1132003. PMID 15870257.
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Раута Дж., Алармо Э.Л., Каураниеми П. и др. (2006). «Серин-треониновая протеинфосфатаза PPM1D часто активируется путем амплификации в агрессивных первичных опухолях молочной железы». Рак молочной железы Res. Рассматривать. 95 (3): 257–63. Дои:10.1007 / s10549-005-9017-7. PMID 16254685. S2CID 9693018.
Фудзимото Х., Ониши Н., Като Н. и др. (2006). «Регулирование антионкогенной киназы Chk2 онкогенной фосфатазой Wip1». Разница в гибели клеток. 13 (7): 1170–80. Дои:10.1038 / sj.cdd.4401801. PMID 16311512.
Mendrzyk F, Radlwimmer B, Joos S и др. (2006). «Профили экспрессии генома и белка идентифицируют CDK6 как новый независимый прогностический маркер медуллобластомы». J. Clin. Онкол. 23 (34): 8853–62. Дои:10.1200 / JCO.2005.02.8589. PMID 16314645.

Эта статья о ген на хромосома человека 17 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000170836 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020525 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid9177166-5] Фиселла М., Чжан Х., Фан С., Сакагути К., Шен С., Мерсер В.Е., Ванде Вуде Г.Ф., О'Коннор П.М., Аппелла Е. (июль 1997 г.). «Wip1, новая человеческая протеинфосфатаза, которая индуцируется в ответ на ионизирующее излучение p53-зависимым образом». Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (12): 6048–53. Bibcode:1997PNAS ... 94.6048F. Дои:10.1073 / пнас.94.12.6048. ЧВК 20998. PMID 9177166.

[entrez-6] а ^б «Ген Entrez: протеинфосфатаза PPM1D 1D, магний-зависимая, дельта-изоформа».

[pmid11101529-7] Ajuh, P; Kuster B; Панов К; Zomerdijk J C; Mann M; Ламонд А. I (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ человеческого комплекса CDC5L и идентификация его компонентов с помощью масс-спектрометрии». EMBO J. 19 (23): 6569–81. Дои:10.1093 / emboj / 19.23.6569. ISSN 0261-4189. ЧВК 305846. PMID 11101529.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]