Пол В. Штернберг - Paul W. Sternberg

Пол В. Штернберг американский биолог. Он проводит исследования для WormBase на C. elegans, а модельный организм.

ранняя жизнь и образование

Пол Штернберг вырос на Лонг-Айленде, штат Нью-Йорк. Он присутствовал Хэмпширский колледж поступил на бакалавриат в Амхерст, штат Массачусетс, где получил степень бакалавра искусств. в 1978 г. После этого он отправился в Массачусетский технологический институт где он получил докторскую степень по биологии за работу по развитию нематод с Роберт Хорвиц. Он продолжал проводить постдокторские исследования с Ира Херсковиц в молекулярном развитии дрожжей в Калифорнийском университете в Сан-Франциско.[1] В настоящее время он работает в Калифорнийский технологический институт как профессор биологии Томаса Ханта Моргана.[2]

WormBase

Штернберг - главный следователь WormBase. WormBase - это хранилище данных по биологии нематод. C. elegans был использован в исследованиях развития и нейробиологии. WormBase содержит информацию по девяти видам и пяти из них. Caenorhabditis, один из которых C. elegans. WormBase предоставляет: браузер генома, наборы геномов, генов и белков для поиска сходства последовательностей и сводок генов и белков.[3]

Консорциум генных онтологий

Он также является главным следователем Консорциум генных онтологий. Консорциум предоставляет знания о функциях генов и генных продуктов. Он был основан в 1998 году и широко используется в биологических науках. Ресурс Gene Ontology содержит наиболее полную информацию о функциях генов.[4]«Онтология охватывает три различных аспекта функции генов: молекулярную функцию, клеточный компонент и биологический процесс».[4]

Текущее исследование

Штернберг является соавтором статьи ".Аутизм -ассоциированные миссенс-генетические варианты влияют на локомоцию и нейроразвитие Caenorhabditis elegans"(2019). Они использовали C. elegans в качестве генетической модели для поиска фенотипических миссенс-аллелей, собранных в ходе исследований расстройств аутистического спектра на людях. Варианты Missense вызывают около половины генетических изменений, которые, как известно, вызывают заболевания. Они использовали CRISPR-Cas9 чтобы генерировать C. elegans эквивалентные миссенс-мутанты человека. Они сравнили фенотипы миссенс-мутантов с диким типом и известными контрольными мутантами с потерей функции в ассоциированных с аутизмом миссенс-аллелях и обнаружили, что 70% миссенс-аллелей показали очевидные фенотипические изменения в локомоции, морфологии и плодовитости. Они использовали этот метод, чтобы показать тонкие фенотипические изменения и влияние, которое миссенс-мутации могут оказывать на болезнь человека. Они действительно обнаружили, что 14 вариантов миссенс играют важную роль в C. elegans ортологи генов человека.[5]

Публикации

"Клоны гонадных клеток нематоды Panagrellus redivivus и последствия для эволюции путем модификации клеточного происхождения "(1981) Sternberg и Horvitz сравнили линии гонадных клеток Panagrellus redivivus к гонадным линиям C.elegans. Они обнаружили, что гибель Z4.pp - это то, что, вероятно, препятствует развитию заднего яичника у P. redivivus, который у C. elegans контролирует развитие этого заднего яичника. Считается, что это причина того, почему существует большая разница в морфологии женских гонад P.redivivus и гермафродитов C.elegans.[6]

«Постэмбриональные негонадные клеточные линии нематоды Panagrellus redivivus: описание и сравнение с таковыми у Caenorhabditis elegans» (1982) Horvitz и Sternberg изучили постэмбриональные негонодальные клеточные линии P.redivivus и сравнили их с C.elegans. Они обнаружили незначительные различия в двух клеточных линиях и обнаружили, что эти различия связаны с двумя типами эволюционных изменений.[7]

«Мутации, которые влияют на клоны нервных клеток и судьбы клеток во время развития нематоды Caenorhabditis elegans» (1983). В этой публикации они обнаружили 19 генов у C. elegans, которые влияют на судьбу нервных клеток и клеточные клоны во время развития. Мутации в генах lin-22, lin-12, unc-86 и ced-3 могут вызывать специфические трансформации в судьбе определенных клеток. Они обнаружили, что эти и другие гены могут действовать в иерархии, чтобы влиять на решения на разных этапах внутри клетки. Они обнаружили, что unc-86 может влиять на не нейронные аспекты развития, даже если он специфичен для нейронных линий.[8]

«Множественные функции let-23, гена тирозинкиназы рецептора caenorhabditis elegans, необходимого для индукции вульвы»(1991) Ген Let-23 выполняет множество различных функций во время развития C.elegans. Ароян и Стернберг обнаружили, что функция let-23 необходима клеткам-предшественникам вульвы для ответа на сигнал, ответственный за дифференцировку вульвы. Тирозинкиназа рецептора let-23 контролирует два противоположных пути. Один путь отвечает за стимуляцию дифференцировки вульвы, а другой предотвращает дифференцировку вульвы. Они также обнаружили, что let-23 киназа функционирует как минимум в 5 различных тканях.[9]

«Локус lin-15 кодирует два негативных регулятора развития вульвы caenorhabditis elegans».(1994) lin-15 является негативным регулятором дифференцировки вуваля. Хуанг, Цзоу и Штернберг обнаружили, что lin-15 кодирует 2 транскрипта, которые не перекрываются и транскрибируются в одном направлении. Они смогли проанализировать, какую роль lin-15 играет в сигнальном пути, и обнаружили, что lin-15 действует выше и параллельно индуктивному сигналу let-23.[10]

«Сигнал выживания, полученный из гонад, для клеток-предшественников вульвы у двух видов нематод»(1998) Феликс и Штернберг обнаружили, что существует сигнал выживания, который предотвращает гибель клеток-предшественников вульвы у T.aceti и Halicephalobus sp. Удаление гонад у этих двух нематод вызывает гибель клеток-предшественников вульвы. Это противоположно тому, что наблюдается у C.elegans и многих других видов нематод, обычно при абляции гонад клетки-предшественники вульвы по умолчанию принимают эпидермальную судьбу и не подвергаются запрограммированной гибели клеток.[11]

«Свидетельства поиска партнера у нематоды-гермафродита Caenorhabditis elegans»(2002) Саймон и Стернберг выполнили несколько различных анализов и обнаружили, что именно мужчины реагируют на половой диморфный сигнал, исходящий от гермафродитов. Они обнаружили, что реплика не выходит из тканей вульвы. Сигнал, вероятно, обнаружен химио-сенсорным органом у мужчины. Их результаты показали, что у самцов действительно есть предпочтение при выборе партнера, а гермафродиты действительно играют роль в спаривании.[12]

«Система визуализации для стандартизированного количественного анализа поведения C. elegans»(2004) Sternberg et al. Создали широко доступный количественный метод оценки поведенческих фенотипов. Они смогли записывать поведение при большом увеличении в течение длительных периодов времени и количественно определять поведенческие характеристики для последующего анализа. Это позволяет легко сравнивать данные из разных лабораторий путем стандартизации поведенческих анализов. Это также позволило бы регистрировать отдельных нематод и количественно определять 144 специфических параметра фенотипа.[13]

Популярные публикации

Ниже приведены некоторые из наиболее цитируемых публикаций Штернберга:

  • Мюллер, Ханс-Михаэль; Kenny, Eimear E .; Штернберг, Пол В. (2004). "Textpresso: система поиска и извлечения информации на основе онтологий для биологической литературы". PLOS Биология. 2 (11): e309. Дои:10.1371 / journal.pbio.0020309. ЧВК  517822. PMID  15383839.
  • Greenwald, Iva S .; Sternberg, Paul W .; Роберт Хорвиц, Х. (1983). «Локус lin-12 определяет судьбы клеток у caenorhabditis elegans». Клетка. 34 (2): 435–444. Дои:10.1016 / 0092-8674 (83) 90377-X. PMID  6616618. S2CID  40668388.
  • Левченко, А .; Bruck, J .; Штернберг, П. В. (2000). «Белки каркаса могут двухфазно влиять на уровни передачи сигналов митоген-активируемой протеинкиназы и снижать ее пороговые свойства». Труды Национальной академии наук. 97 (11): 5818–5823. Bibcode:2000PNAS ... 97.5818L. Дои:10.1073 / pnas.97.11.5818. ЧВК  18517. PMID  10823939.
  • Aroian, Raffi V .; Кога, Макото; Mendel, Jane E .; Осима, Ясуми; Штернберг, Пол В. (1990). «Ген let-23, необходимый для индукции вульвы Caenorhabditis elegans, кодирует тирозинкиназу подсемейства рецепторов EGF». Природа. 348 (6303): 693–699. Bibcode:1990Натура.348..693A. Дои:10.1038 / 348693a0. PMID  1979659. S2CID  4358437.

Членство

  • Американская академия искусств и наук
  • Национальная Академия Наук
  • Член Американской ассоциации развития науки[2]

Рекомендации

  1. ^ Штернберг, Пол В. (сентябрь 2013 г.). "Пол В. Штернберг". Текущая биология. 23 (17): R704 – R705. Дои:10.1016 / j.cub.2013.07.023. PMID  24156105.
  2. ^ а б "Пол В. Штернберг". Американская академия искусств и наук. Получено 2020-04-26.
  3. ^ Харрис, Тодд У .; Антошечкин Игорь; Биери, Тамберлин; Блазиар, Дарин; Чан, Хуанкарлос; Chen, Wen J .; Де ла Крус, Норри; Дэвис, Пол; Дуэсбери, Маргарет; Фанг, Руихуа; Фернандес, Джолин (январь 2010 г.). «WormBase: всеобъемлющий ресурс для исследования нематод». Исследования нуклеиновых кислот. 38 (Suppl_1): D463 – D467. Дои:10.1093 / нар / gkp952. ISSN  0305-1048. ЧВК  2808986. PMID  19910365.
  4. ^ а б Консорциум генных онтологий (2019-01-08). «Ресурсы по генной онтологии: 20 лет и все еще сильны». Исследования нуклеиновых кислот. 47 (D1): D330 – D338. Дои:10.1093 / нар / gky1055. ISSN  0305-1048. ЧВК  6323945. PMID  30395331.
  5. ^ Вонг, Ван-Ронг; Бругман, Катерина I; Махер, Шайда; О, Джун Ён; Хау, Кевин; Като, Михоко; Штернберг, Пол В (2019-04-01). «Связанные с аутизмом миссенс-генетические варианты влияют на передвижение и нервное развитие у Caenorhabditis elegans». Молекулярная генетика человека. 28 (13): 2271–2281. Дои:10.1093 / hmg / ddz051. ISSN  0964-6906. ЧВК  6586145. PMID  31220273.
  6. ^ Sternberg, Paul W .; Хорвиц, Х. Роберт (ноябрь 1981 г.). «Клоны гонадных клеток нематоды Panagrellus redivivus и последствия для эволюции путем модификации клеточного происхождения». Биология развития. 88 (1): 147–166. Дои:10.1016/0012-1606(81)90226-8. ISSN  0012-1606. PMID  7286441.
  7. ^ Sternberg, Paul W .; Хорвиц, Х. Роберт (сентябрь 1982 г.). «Постэмбриональные негонадные клеточные линии нематоды Panagrellus redivivus: описание и сравнение с таковыми Caenorhabditis elegans». Биология развития. 93 (1): 181–205. Дои:10.1016/0012-1606(82)90251-2. ISSN  0012-1606. PMID  7128930.
  8. ^ Horvitz, H.R .; Sternberg, P.W .; Greenwald, I.S .; Fixsen, W .; Эллис, Х. (1983-01-01). «Мутации, которые влияют на клоны нервных клеток и клеточные судьбы во время развития нематоды Caenorhabditis elegans». Симпозиумы Колд-Спринг-Харбор по количественной биологии. 48: 453–463. Дои:10.1101 / sqb.1983.048.01.050. ISSN  0091-7451. PMID  6586368.
  9. ^ Aroian, R. V .; Штернберг, П. В. (1991-06-01). «Множественные функции let-23, гена тирозинкиназы рецептора Caenorhabditis elegans, необходимого для индукции вульвы». Генетика. 128 (2): 251–267. ISSN  0016-6731. ЧВК  1204464. PMID  2071015.
  10. ^ Хуанг, Л. С; Цзоу, П; Штернберг П. В. (апрель 1994 г.). «Локус lin-15 кодирует два негативных регулятора развития вульвы Caenorhabditis elegans». Молекулярная биология клетки. 5 (4): 395–411. Дои:10.1091 / mbc.5.4.395. ISSN  1059-1524. ЧВК  301050. PMID  8054684.
  11. ^ Феликс, Мари-Анн; Штернберг, Пол В. (февраль 1998 г.). «Сигнал выживания, полученный из гонад, для клеток-предшественников вульвы у двух видов нематод». Текущая биология. 8 (5): 287–290. Дои:10.1016 / s0960-9822 (98) 70111-3. ISSN  0960-9822. PMID  9501068.
  12. ^ Саймон, Дж. М .; Штернберг, П. В. (29 января 2002 г.). "Свидетельства о поиске партнера у нематоды-гермафродита Caenorhabditis elegans". Труды Национальной академии наук. 99 (3): 1598–1603. Дои:10.1073 / pnas.032225799. ISSN  0027-8424. PMID  11818544.
  13. ^ Фэн, Чжаоян; Кронин, Кристофер Дж; Виттиг, Джон Х; Штернберг, Пауль В; Шафер, Уильям Р. (2004-08-26). «Система визуализации для стандартизированного количественного анализа поведения C. elegans». BMC Bioinformatics. 5 (1): 115. Дои:10.1186/1471-2105-5-115. ISSN  1471-2105. ЧВК  517925. PMID  15331023.