Педуовирус - Peduovirus
Педуовирус | |
---|---|
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область: | Дуплоднавирия |
Королевство: | Heunggongvirae |
Тип: | Уровирикота |
Учебный класс: | Caudoviricetes |
Заказ: | Caudovirales |
Семья: | Myoviridae |
Подсемейство: | Peduovirinae |
Род: | Педуовирус |
Типовой вид | |
Вирус эшерихии P2 |
Педуовирус (также известные как P2-подобные фаги и P2-подобные вирусы) - это род вирусы в порядке Caudovirales, в семье Myoviridae, в подсемействе Peduovirinae. Бактерии служат естественными хозяевами, передача которых достигается путем пассивной диффузии. В настоящее время этот род насчитывает 6 видов, включая типовой вид. Вирус эшерихии P2.[1][2][3]
Таксономия
Признаны следующие виды:[2]
- Вирус эшерихии fiAA91ss
- Вирус эшерихии P2
- Вирус эшерихии pro147
- Вирус эшерихии pro483
- Вирус эшерихии Wphi
- Вирус иерсинии L413C
Структура
Педуовирусы без оболочки, с головой и хвостом. Головка икосаэдра имеет диаметр примерно 60 нм и правый симметрия (T = 7), состоит из 72 капсомеров. Хвост имеет длину около 135 нм, ширину 18 нм, имеет 6 коротких изогнутых хвостовых волокон. Хвост заключен в оболочку, которая при сокращении расслабляется и скользит по сердцевине хвоста.[1]
Род | Структура | Симметрия | Капсид | Геномное расположение | Геномная сегментация |
---|---|---|---|---|---|
Педуовирус | Хвост-Хвост | T = 7 правый | Без оболочки | Линейный | Одночастный |
Геном
Геномы девяти из тринадцати вирусов были полностью секвенированы и доступны на веб-сайте NCBI (хотя фаг Salmonella Fels-2 в настоящее время внесен в список неклассифицированных). Они варьируются от 30 до 39 тысяч нуклеотидов, от 40 до 51 белка. Все восемь полных геномов, а также несколько дополнительных «неклассифицированных» вирусных геномов доступны по адресу [1][3]
Жизненный цикл
Репликация вируса происходит в цитоплазме. Вирус прикрепляется к клетке-хозяину с помощью хвостовых волокон и выбрасывает вирусную ДНК в цитоплазму хозяина за счет сокращения оболочки хвоста. Транскрипция с использованием ДНК-шаблона - это метод транскрипции. После репликации вирусных генов прокапсид собирается и упаковывается. Затем собирается хвост, и зрелые вирионы высвобождаются посредством лизиса и белков холина / эндолизина / спанина.[1]
Род | Детали хоста | Тканевый тропизм | Детали входа | Детали выпуска | Сайт репликации | Сайт сборки | Передача инфекции |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Педуовирус | Бактерии | Никто | Инъекция | Лизис | Цитоплазма | Цитоплазма | Пассивная диффузия |
История
В соответствии с ICTV отчет 1996 г., род P2likevirus был впервые принят под именем P2-подобные фаги в семье Myoviridae, не назначен подсемейству. Название рода изменено на P2-подобные вирусы в 7-м отчете ICTV в 1999 году. Он был перемещен в подсемейство Peduovirinae с момента создания в 2010-11 гг. В следующем году (2012 г.) род был переименован в P2likevirus. Эти отчеты доступны через ICTV здесь: 1996, 1999, 2010, 2012.[2] Позже род был переименован в Педуовирус ' и несколько его видов были удалены.
Рекомендации
- ^ а б c «Вирусная зона». ExPASy. Получено 1 июля 2015.
- ^ а б c «Таксономия вирусов: выпуск 2019 г.». talk.ictvonline.org. Международный комитет по таксономии вирусов. Получено 3 мая 2020.
- ^ а б NCBI. «Полные геномы P2linkevirus». Получено 13 февраля 2015.