Phikzvirus - Phikzvirus
| Phikzvirus | |
|---|---|
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область: | Дуплоднавирия |
| Королевство: | Heunggongvirae |
| Тип: | Уровирикота |
| Учебный класс: | Caudoviricetes |
| Заказ: | Caudovirales |
| Семья: | Myoviridae |
| Род: | Phikzvirus |
| Типовой вид | |
| Вирус псевдомонады phiKZ | |
Phikzvirus (синоним: PhiKZ-подобные вирусы, Phikzlikevirus до 2015 г.) является родом вирусы в порядке Caudovirales, в семье Myoviridae. Бактерии служат естественными хозяевами. В настоящее время в этом роде три вида, включая типовой вид. Вирус псевдомонады phiKZ (он же Pseudomonas phage phiKZ ).[1][2][3]
Фаги этого рода считаются крупными фагами или фагами-гигантами. Известно, что три фага этого рода (φKZ, φPA3 и 201φ2-1) собирают структуру «фагового ядра», аналогичную по функциям эукариотической. ядро клетки который включает в себя ДНК, а также механизмы репликации и транскрипции. Эти конструкции построены из тубулин -подобно PhuZ белок и gp105 белок оболочки. Он обеспечивает иммунитет к таким защитным средствам хозяина, как рестрикционные ферменты и CRISPR -Cas системы.[4]
Таксономия
Группа: dsDNA
- Семья: Myoviridae
- Род: Phikzvirus (ранее Phikzlikevirus)
- Вирус псевдомонады phiKZ
- Фаг Pseudomonas KTN4
- Вирус псевдомонады PA7
- Вирус псевдомонады SL2
- Неклассифицированный
- Вирус псевдомонады phiKZ
Структура
Фикзвирусы без оболочки, с головой и хвостом. Голова имеет икосаэдрическую симметрию (T = 27) с относительно большим диаметром около 140 нм. Хвост составляет около 160 нм в длину и 35 нм в ширину.[1]
| Род | Структура | Симметрия | Капсид | Геномное расположение | Геномная сегментация |
|---|---|---|---|---|---|
| Phikzvirus | Хвост-Хвост | Т = 27 | Без оболочки | Круговой | Одночастный |
Геном
Геномы круглые, около 280 килобайт в длину.[1] Два из трех видов полностью секвенированы и доступны в ICTV; исключение Фаг Pseudomonas Lin68. Они варьируются от 211 тыс. До 280 тыс. Нуклеотидов, от 201 до 306 белков. Доступны полные геномы, а также еще один похожий, но неклассифицированный геном. здесь.[3]
Жизненный цикл
Репликация вируса происходит в цитоплазме. Вирус прикрепляется к клетке-хозяину с помощью своих концевых волокон и выбрасывает вирусную ДНК в цитоплазму хозяина за счет сокращения оболочки хвоста. Транскрипция с использованием ДНК-шаблона - это метод транскрипции. После репликации вирусных генов прокапсид собирается и упаковывается. Затем собирается хвост, и зрелые вирионы высвобождаются посредством лизиса. Бактерии служат естественным хозяином. Пути передачи - пассивное распространение.[1]
| Род | Детали хоста | Тканевый тропизм | Детали входа | Детали выпуска | Сайт репликации | Сайт сборки | Передача инфекции |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Phikzvirus | Бактерии | Никто | Инъекция | Лизис | Цитоплазма | Цитоплазма | Пассивная диффузия |
История
Согласно ICTV отчет 2009 г., род PhiKZ-подобные вирусы был впервые принят как новый род одновременно со всеми тремя содержащимися в нем видами. Это предложение доступно здесь. В 2012 году название было изменено на Phikzlikevirus. Это предложение доступно здесь.[5] Позже род был переименован Phikzvirus.
Рекомендации
- ^ а б c d «Вирусная зона». ExPASy. Получено 1 июля 2015.
- ^ а б ICTV. «Таксономия вирусов: выпуск 2014 г.». Получено 1 июля 2015.
- ^ а б NCBI. «Полные геномы фикзликевируса». Получено 17 февраля 2015.
- ^ Чайкеератисак, В; Nguyen, K; Иган, Мэн; Erb, ML; Вавилина, А; Pogliano, J (15 августа 2017 г.). «Ядро фага и веретено тубулина сохраняются среди крупных фагов Pseudomonas». Отчеты по ячейкам. 20 (7): 1563–1571. Дои:10.1016 / j.celrep.2017.07.064. ЧВК 6028189. PMID 28813669.
- ^ ICTV. «Таксономия вирусов: выпуск 2013 г.». Получено 17 февраля 2015.