Пикобирнавирус - Picobirnavirus


Пикобирнавирус
Journal.ppat.1005523.g006.A.WT.png
Электронная микрофотография частиц пикобирнавируса человека
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Писувирикота
Учебный класс:Duplopiviricetes
Заказ:Дурнавиралес
Семья:Picobirnaviridae
Род:Пикобирнавирус
Типовой вид
Пикобирнавирус человека

Пикобирнавирус это род двухцепочечные РНК-вирусы. Это единственный род в семье Picobirnaviridae.[1] Несмотря на то что амниот Считалось, что эти вирусы, особенно млекопитающие, служат хозяевами, недавно было высказано предположение, что эти вирусы могут инфицировать бактерии и, возможно, некоторых других беспозвоночных.[2][3] В настоящее время в этом роду три вида, включая типовой вид пикобирнавирус человека. Сопутствующие симптомы включают: гастроэнтерит у животных и людей, хотя связь с заболеванием неясна.[4][5]

Этимология

Пикобирнавирус - небольшой (пико, испанский за маленький), пополам (би, латинский за два), двухцепочечной РНК вируса. Первоначально пикобирнавирусы считались бирна-подобными вирусами, а название было получено от бирнавируса (двусегментированная РНК), но вирионы намного меньше (диаметр 35 нм против 65 нм). [6] Пикобирнавирусы были впервые обнаружены у людей и черноногих рисовых крыс-пигмеев в 1988 году.[7]

Структура

Вирусы рода picobirnavirus не имеют оболочки, имеют форму икосаэдра и симметрию T = 3. Диаметр около 35-40 нм.[5][4]

Геном

Расположение генома дцРНК1 и дцРНК2 пикобирнавируса человека

В геном является линейным, двудольным и состоит из двухцепочечных РНК. Он включает сегмент 1 что составляет 2,2–2,7 килобазы (kb) в длину и сегмент 2 длина которого составляет 1,2–1,9 kb. Геном кодирует от трех до четырех белков.[4] Ген капсидного белка кодируется второй открытой рамкой считывания более крупного геномного сегмента 1.[4]

Пикобирнавирусы делятся на две геногруппы на основе последовательности сегмент 2. В РНК-зависимая РНК-полимераза (RdRp) кодируется сегмент 2. Вирусы этой группы были изолированы от людей и других млекопитающих, а также птиц и животных. чешуйчатые.[8]

Жизненный цикл

Пикобирнавирус RdRp репликация (L) и транскрипция (R) в вирусный капсид.

Пикобирнавирусы поражают ткань кишечника. Попадание в хозяйскую клетку достигается за счет проникновения в хозяйскую клетку. Попав в хозяйскую клетку, вирусная репликация происходит в цитоплазме. Репликация следует модели репликации вируса с двухцепочечной РНК. Транскрипция двухцепочечной РНК вируса - это метод транскрипции. Вирусы высвобождаются из клетки путем отпочкования. Млекопитающие служат естественным хозяином. Пути передачи фекально-оральные.[5][4]

Таксономия

Первоначально считалось, что пикобирнавирусы принадлежат к семейству Birnaviridae, но позже были подтверждены различия в отношении хозяина, размера вириона, капсида, РНК-зависимой РНК-полимеразы, размера генома и организации.[9] Семья Picobirnaviridae теперь четко классифицируется и состоит из одного рода Пикобирнавирус, который имеет три вида:[10]

  • Бейхай пикобирнавирус
  • Пикобирнавирус лошадей
  • Пикобирнавирус человека

Рекомендации

  1. ^ Дельмас, В; Attoui, H; Ghosh, S; Малик Ю.С. Mundt, E; Вахария, ВН; Отчет Ictv, Консорциум (февраль 2019 г.). "Профиль таксономии вируса ICTV: Picobirnaviridae". Журнал общей вирусологии. 100 (2): 133–134. Дои:10.1099 / jgv.0.001186. PMID  30484763.
  2. ^ Кришнамурти, Siddharth R .; Ван, Дэвид (1 марта 2018 г.). «Обширная консервация прокариотических сайтов связывания рибосом в известных и новых пикобирнавирусах». Вирусология. 516: 108–114. Дои:10.1016 / j.virol.2018.01.006. ISSN  0042-6822. PMID  29346073.
  3. ^ Йинда, Клод Кве; Гхогому, Стивен Мбига; Консейсао-Нето, Надия; Беллер, Лин; Дебут, Уорд; Ванхулле, Эмиэль; Маес, Пит; Ван Ранст, Марк; Matthijnssens, Jelle (январь 2018 г.). «Камерунские плодовые летучие мыши являются носителями различных вирусов, включая ротавирус H, бастровирусы и пикобирнавирусы, использующие альтернативный генетический код». Эволюция вирусов. 4 (1): vey008. Дои:10.1093 / ve / vey008. ISSN  2057-1577. ЧВК  5888411. PMID  29644096.
  4. ^ а б c d е «Вирусная зона». ExPASy. Получено 15 июн 2015.
  5. ^ а б c "Отчет ICTV: Picobirnaviridae".
  6. ^ Малик, Яшпал С .; Гош, Сувик (январь 2020 г.). «Этимология: пикобирнавирус». Возникающие инфекционные заболевания. 26 (1). Дои:10.3201 / eid2601.et2601.
  7. ^ Pereira, HG; Flewett, TH; Candeias, JAN; Барт, О.М. (1988). «Вирус с двусегментным геномом двухцепочечной РНК в кишечнике крысы (Oryzomys nigripes)». Дж. Ген Вирол. 69 (11): 2749–2754. Дои:10.1099/0022-1317-69-11-2749. PMID  3053986.
  8. ^ Smits, SL; ван Леувен, М; Шапендонк, СМ; Schürch, AC; Bodewes, R; Haagmans, BL; Остерхаус, AD (2012). «Пикобирнавирусы в дыхательных путях человека». Возникающие инфекционные заболевания. 18 (9): 1539–40. Дои:10.3201 / eid1809.120507. ЧВК  3437736. PMID  22932227.
  9. ^ Малик Ю.С. Кумар, Н; Шарма, К; Дхама, К. Шабир, МЗ; Ганеш, Б; Кобаяши, N; Баньяи, К. (2014). «Эпидемиология, филогения и эволюция возникающих кишечных пикобирнавирусов животного происхождения и их связь с человеческими штаммами». Biomed Res. Int. 2014: 1–13. Дои:10.1155/2014/780752. ЧВК  4124650. PMID  25136620.
  10. ^ «Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV)». talk.ictvonline.org. Получено 8 октября 2020.

внешняя ссылка