Primer Premier - Википедия - Primer Premier
 | Эта статья содержит контент, который написан как Реклама. (Февраль 2011 г.) (Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения) |
| Разработчики) | Премьер Биософт |
|---|---|
| Стабильный выпуск | 6.24 |
| Операционная система | Windows, Mac OS X |
| Тип | Биоинформатика |
| Лицензия | коммерческий |
| Интернет сайт | http://www.premierbiosoft.com |
Праймер Премьер программное обеспечение объединяет дизайн праймеров для различных Приложения ПЦР под одной общей площадкой. Программное обеспечение поддерживает создание вырожденных праймеров при выравнивании для амплификации связанного набора нуклеотидных последовательностей для выявления общих черт среди организмов и определения наследственности.[1]
Программа также разрабатывает тегированные и вложенные праймеры для мультиплексная ПЦР реакции. [2]
Программное обеспечение Primer Premier поддерживает анализ мотивов и поиск по ORF наряду с поиском сайтов рестрикции в нуклеотидной последовательности.
Программное обеспечение имеет встроенный транслятор нуклеотид-белков и белок-нуклеотидных последовательностей, который можно использовать для создания вырожденных праймеров для кодонов, которые кодируют несколько аминокислотных последовательностей. Также понятно, что праймеры, разработанные Primer Premier, эффективны и подтверждают руководящие принципы разработки, изложенные для разработки праймеров для генов домашнего хозяйства с высоким G + C%.[3]
Программа также разрабатывает праймеры для фланкирования экзонов и интронов в гене, хотя на официальной странице Primer Premier на сайте Premier Biosoft об этом не упоминается.
Программа рассчитывала стабильность структуры шпильки и использовалась для изучения ее влияния на амплификацию ПЦР.[4]
Конкуренты
Есть много других программ, которые разрабатывают праймеры для реакции ПЦР. Некоторые из них перечислены ниже:
- Гениальный
- Primer3[5]
- ДНАСТАР такие продукты, как SeqBuilder и PrimerSelect
- AlleleID (выпускается той же компанией, что и Primer Premier)
- PrimerX (для сайт-направленный мутагенез )
- GenomePride[6]
- ОЛИГО
Рекомендации
- ^ Zhaohui S, Wenling Z, Bao Z, Rong S, Wenli M. Микроматрицы для обнаружения HBV и HDV PMID 15479617
- ^ Чувствительность, специфичность и стабильность вложенной / мультиплексной ПЦР Tag-primer для диагностики малярии: Guo CK, Li XM, Li JH, Mao W, Lin Z, Du JF, Huang TY. PMID 18038781
- ^ Гуо Ю.П., Хуанг Ю. Разработка и проверка праймеров для генов домашнего хозяйства стрептомицетов PMID 18271268
- ^ http://www.horizonpress.com/mbt/v/v1/11.pdf
- ^ «Праймер 3». primer3.sourceforge.net.
- ^ Хаас, Стефан А. «GenomePRIDE - программа для конструирования праймеров для ПЦР / разработки олиго». pride.molgen.mpg.de.