DNASTAR - Википедия - DNASTAR

DNASTAR, Inc.
Частная компания
ПромышленностьБиоинформатика Программного обеспечения
Учредители
  • Доктор Фредрик Блаттнер
  • Джон Шредер
Штаб-квартира
Мэдисон, Висконсин
,
Соединенные Штаты
Обслуживаемая площадь
Мировой
ТоварыПрограммного обеспечения
Интернет сайтДНАСТАР

ДНАСТАР глобальный биоинформатика компания по разработке программного обеспечения, основанная в 1984 году, со штаб-квартирой в Мэдисон, Висконсин. DNASTAR разрабатывает и продает программное обеспечение для анализ последовательности в областях геномика, молекулярная биология, и структурная биология.

Программного обеспечения

Программное обеспечение DNASTAR (Lasergene) впервые приобрело популярность в 1980-х и 1990-х годах благодаря сборка последовательности и возможности анализа Секвенирование по Сэнгеру данные. Lasergene 15.2 был выпущен в июне 2018 года.[1] Программное обеспечение DNASTAR доступно для настольных компьютеров, работающих под управлением Mac OS X, Windows, и Linux а также для использования на Веб-сервисы Amazon.

В 2007 году DNASTAR расширила свои предложения, включив программное обеспечение для секвенирование следующего поколения и структурная биология.[2] Программное обеспечение следующего поколения DNASTAR поддерживает данные из Иллюмина, Ион Торрент, и Тихоокеанские биологические науки и позволяет пользователю собирать, согласовывать, анализировать и визуализировать геномные данные. Использование Lasergene в сборке и анализе последовательностей нового поколения было внесено в книгу 2008 года в виде главы, написанной учеными компании. Секвенирование генома нового поколения под редакцией Майкла Яница.[3]

Программное обеспечение DNASTAR используется фармацевтическими, биотехнологическими, академическими и клинические исследователи в более чем 90 странах мира.[4]

Отзывы

Писать в Ученый Дэвид Р. Смит дал положительные отзывы о нескольких пакетах программного обеспечения для биоинформатики, включая DNAstar, но сказал, что его навыки в области биоинформатики упали, а затраты на лицензирование и модернизацию составляют значительную часть операционного бюджета его лаборатории.[5]

Похвалы

В 2007 году DNASTAR был удостоен золотой награды Reader's Choice Gold Award от Журнал научных вычислений для программы анализа последовательности Lasergene.[6]

Книга 2008 года Изобретая предпринимателей: новаторы в области технологий и их предпринимательское путешествие Джерарда Джорджа и Адама Дж. Бока включает DNASTAR как пример инновационной и предпринимательской истории успеха.[7]

Исследование, проведенное BMC Genomics в 2010 году было установлено, что сборки SeqMan (приложение DNASTAR для сборки последовательностей следующего поколения) работают лучше всего, с большим количеством новых последовательностей и лучшим повторением транскриптов.[8]

Другой BMC Genomics Исследование, проведенное в 2011 году, показало, что наилучшие общие характеристики контигов были получены при сборке SeqMan NGen.[9]

Клиенты

Смотрите также

Рекомендации[11]

  1. ^ "Информация о версии Lasergene 15.2 | DNASTAR". ДНАСТАР. 2018-06-26. Получено 2018-10-08.
  2. ^ "Профиль компании". ДНАСТАР. Получено 25 октября 2014.[самостоятельно опубликованный источник ]
  3. ^ Яниц, Майкл (ноябрь 2008 г.). Секвенирование генома следующего поколения: к персонализированной медицине. Вайли-ВЧ. ISBN  978-3-527-32090-5.
  4. ^ "Карьера DNASTAR". ДНАСТАР. Получено 25 октября 2014.[самостоятельно опубликованный источник ]
  5. ^ Ученый, 2 сентября 2014 г. http://www.the-scientist.com/?articles.view/articleNo/40916/title/Opinion--Bioinformatics-Software--A-Buyer-s-Guide/
  6. ^ Персонал (30 июня 2007 г.). «Выбор читателей по биоинформатике - Золотая награда: Lasergene». Релизы продукта. Научные вычисления. Advantage Business Media.
  7. ^ Джерри, Джордж; Бок, Адам (январь 2008 г.). Изобретая предпринимателей: новаторы в области технологий и их предпринимательское путешествие. Prentice Hall. ISBN  978-0-13-157470-0.[страница нужна ]
  8. ^ Кумар, Суджай; Блэкстер, Марк Л. (16 октября 2010 г.). "Сравнение de novo ассемблеры для 454 данных транскриптома ». BMC Genomics. 11: 571. Дои:10.1186/1471-2164-11-571. ЧВК  3091720. PMID  20950480. 571.открытый доступ
  9. ^ Фельдмейер, Барбара; Пшеница, Кристофер У .; и другие. (16 июня 2011 г.). "Кратко прочтите данные Illumina для de novo сборка транскриптома немодельных видов улиток (Radix balthica, Basommatophora, Pulmonata) и сравнение производительности ассемблера ». BMC Genomics. 12: 317. Дои:10.1186/1471-2164-12-317. ЧВК  3128070. PMID  21679424. 317.открытый доступ
  10. ^ Персонал (1 января 2014 г.). "Товары и услуги". Gen. Eng. Biotechnol. Новости (бумага) | формат = требует | url = (помощь). 34 (1). п. 11. ... заключила многолетнее лицензионное соглашение на программное обеспечение с DNAStar на использование программного обеспечения Lasergene в качестве основной программной платформы для сборки и анализа последовательностей для исследователей в своей организации.
  11. ^ Швай, Том (2 марта 2017 г.). «DNASTAR выпускает программное обеспечение Lasergene 14.1 с основными улучшениями» (Пресс-релиз). ДНАСТАР.[самостоятельно опубликованный источник ]

внешняя ссылка