Протопарвовирус - Protoparvovirus

Протопарвовирус
Электронная микрофотография парвовируса собак
Электронная микрофотография из собачий парвовирус
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Моноднавирия
Королевство:Shotokuvirae
Тип:Cossaviricota
Учебный класс:Quintoviricetes
Заказ:Piccovirales
Семья:Parvoviridae
Подсемейство:Parvovirinae
Род:Протопарвовирус
Типовой вид
Протопарвовирус грызунов 1
Разновидность[1]

см текст

Протопарвовирус это название рода вирусы в Parvovirinae подсемейство семейства вирусов Parvoviridae.[2][3] Позвоночные служат естественными хозяевами. В настоящее время в роду 13 видов.[4] включая типовые виды Протопарвовирус грызунов 1 для которого вирус-образец минутный вирус мышей (МВМ). Этот род также включает собачий парвовирус (CPV), который вызывает повреждение желудочно-кишечного тракта у щенков, что приводит примерно к 80% летальному исходу,[5] и парвовирус свиней (PPV), который является основной причиной гибели плода и бесплодия у свиней.[6] Род делится филогенетически на две ветви, одна из которых содержит множество членов-основателей семейства, таких как MVM, CPV и PPV, которые были изучены достаточно подробно, а вторая ветвь занята исключительно предсказанными вирусами, кодирующие последовательности которых были недавно идентифицированы в дикой природе, использующей подходы к обнаружению вирусов, но чья биология остается малоизученной. Эта вторая ветвь в настоящее время содержит два вида, члены которых заражают людей, называемые Протопарвовирус приматов 1 и Протопарвовирус приматов 3. До 2014 года род назывался Парвовирус, но его переименовали, чтобы исключить путаницу между представителями этого рода и членами всего семейства Parvoviridae.[7][8]

Таксономия

В настоящее время известно 13 видов, многие из которых содержат несколько названных вирусов, штаммов вирусов, генотипов или серотипов. Применительно к вирусы, определение вида немного необычно.[9] Это просто абстрактная таксономическая концепция, которая объединяет выбранный диапазон генетических вариантов, помогая различать ветви в филогенетической линии, но это не физическая сущность, такая как вирус, которая может заразить животное или быть изолированной.[10] Если уровень разнообразия, используемый для определения вида, установлен очень низким, многие из них будут фактически содержать один вирус, а вирусу и виду может быть даже дано одно и то же имя, что приведет к путанице между двумя концепциями в литературе и маргинализации филогенетического роль таксона вида. Чтобы противостоять этой проблеме, уровень разнообразия, признанный в настоящее время для видов в Parvoviridae является относительно широким: виды определяются как кластер подобных вирусов, которые кодируют определенный белок репликации, обычно называемый NS1, который по меньшей мере на 85% идентичен белку, кодируемому другими членами этого вида.[7][8]

Признанные виды в роде Протопарвовирус включают:[4]

Протопарвовирусы, поражающие людей, были впервые обнаружены в 2012 году в фекалиях детей из Буркина-Фасо и названы с использованием сиглумбуфавируса.[11] К настоящему времени обнаружены три генотипа буфавирусов, циркулирующих в Тунисе, Финляндия.[12] и Бутан[13]

Второй вирус этого рода, поражающий людей - кутавирус - первоначально был выделен из фекалий детей, страдающих диареей.[14]

О третьем потенциальном протопарвовирусе человека - тусавирусе 1 - сообщалось в фекалиях одного человека, но вопрос о том, способен ли он инфицировать людей или просто проглотил, еще предстоит выяснить.[15]

Структура

Вирусы в роду Протопарвовирус имеют белковые капсиды без оболочки диаметром около 18–26 нм, которые демонстрируют икосаэдрическую симметрию T = 1. Геномы представляют собой одноцепочечную линейную ДНК длиной от 4 до 6 т.п.н., с небольшими (100-500 нуклеотидов) несовершенными палиндромными последовательностями на каждом конце, которые складываются, чтобы сформировать отличительные дуплексные теломеры шпильки.[5]

РодСтруктураСимметрияКапсидГеномное расположениеГеномная сегментация
ПротопарвовирусИкосаэдрТ = 1Без оболочкиЛинейная оцДНКНет

Жизненный цикл

Репликация вируса является ядерной. Проникновение в клетку-хозяин достигается за счет прикрепления к рецепторам хозяина, которые опосредуют опосредованный клатрином эндоцитоз. Репликация повторяет модель шпильки. В некоторых комбинациях вирус / клетка-хозяин дочерние вирионы могут перемещаться через цитоплазму в везикулах и высвобождаться из родительской клетки-хозяина до гибели клетки, в то время как оставшиеся вирионы высвобождаются после лизиса клеток. естественные хозяева. Пути передачи обычно фекально-оральный и / или респираторный.[5]

РодДетали хостаТканевый тропизмДетали входаДетали выпускаСайт репликацииСайт сборкиПередача инфекции
ПротопарвовирусПозвоночныеПеременнаяэндоцитозранний везикулярный экспорт / лизис клетокЯдроЯдрофекально-оральный или респираторный

История

Вирус крыс Килхэм, выделенный в 1959 г.,[16] был первым идентифицированным представителем этого семейства небольших линейных одноцепочечных ДНК-вирусов.

В последующие годы ряд физически похожих вирусов, в том числе H1, LuIII, вирус мышей и опухолевый вирус X, были извлечены из клеток или тканей и стали использоваться в исследовательских лабораториях.[17] и парвовирус свиней, PPV, одна из основных причин репродуктивной недостаточности свиней, был изолирован от инфицированных свиней.[18] В 1971 году все эти вирусы были признаны частью таксономического рода, названного Парвовирус в Первом отчете недавно созданного Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV)[19]

Второй отчет ICTV, опубликованный в 1976 году, установил семью Parvoviridae, который на тот момент включал три рода, один из которых сохранил название Парвовирус и содержал все вышеупомянутые вирусы плюс вирус панлейкопении кошек (теперь называемый парвовирус кошек, сокращенно FPV), которые, как было показано, вызывают эпидемии энтерита, панлейкопении и врожденной мозжечковой атаксии у домашних кошек. В 1978 году появился вирус того же вида, что и FPV, способный заражать собак (так называемый собачий парвовирус или CPV), которые быстро распространились по всему миру, вызывая пандемии тяжелых кишечных и коронарных заболеваний.[20]

Род Парвовирус продолжал накапливать новые вирусы до 2014 года, когда его название было изменено на Протопарвовирус.[7][8]

Рекомендации

  1. ^ "Род: Протопарвовирус" (HTML). Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Получено 8 января 2019.
  2. ^ Котмор, Сан-Франциско; Agbandje-McKenna, M; Канути, М; Chiorini, JA; Эйс-Хубингер, А; Хьюз, Дж; Mietzsch, M; Modha, S; Ольястро, М; Пензес, JJ; Пинтель, диджей; Цю, Дж; Содерлунд-Венермо, М; Tattersall, P; Tijssen, P; и Консорциум отчетов ICTV (2019). "Профиль таксономии вирусов ICTV: Parvoviridae". Журнал общей вирусологии. 100 (3): 367–368. Дои:10.1099 / jgv.0.001212. ЧВК  6537627. PMID  30672729.
  3. ^ "10-й отчет ICTV (2018 г.) Parvoviridae".
  4. ^ а б «Таксономия вирусов: выпуск 2019 г.». talk.ictvonline.org. Международный комитет по таксономии вирусов. Получено 5 мая 2020.
  5. ^ а б c «Вирусная зона». ExPASy. Получено 15 июн 2015.
  6. ^ "10-й отчет ICTV (2018 г.) Протопарвовирус".
  7. ^ а б c "Официальная таксономия ICTV: обновления после 8-го отчета". Официальная таксономия ICTV. Официальная таксономия ICTV. Получено 11 июн 2014.
  8. ^ а б c Котмор С.Ф., Агбандже-МакКенна М., Чиорини Д.А., Муха Д.В., Пинтель Д.В., Цю Дж., Содерлунд-Венермо М., Таттерсалл П., Тейссен П., Гатерер Д., Дэвисон А.Дж. 2014. Семейство Parvoviridae. Arch. Virol. 159: 1239–47.
  9. ^ Van Regenmortel MHV (2000) Введение в понятие вида в таксономии вирусов. В: Van Regenmortel MHV, Fauquet CM, Bishop DHL, Carstens EB, Estes MK, Lemon SM, McGeogh DJ, Maniloff J, Mayo MA, Pringle CR, Wickner RB. (eds) Таксономия вирусов - седьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов. Elsevier Academic Press, Лондон.
  10. ^ Van Regenmortel MHV (2003) Вирусы реальны, виды вирусов - это искусственные таксономические конструкции. Arch. Virol. 148: 2481–2488.
  11. ^ Фан Т.Г., Во Н.П., Бонкунгу И.Дж., Капур А., Барро Н., О’Райан М., Капусинский Б., Ван С., Делварт Э. 2012. Острая диарея у детей Западной Африки: различные кишечные вирусы и новый род парвовирусов. J Virol. 86: 11024–30
  12. ^ Вяйсянен Э., Куисма И., Фан Т.Г., Делварт Э., Лаппалайнен М., Таркка Э., Хедман К., Сёдерлунд-Венермо М. 2014. Буфавирус в кале пациентов с гастроэнтеритом, Финляндия. Emerg Infect Dis. 20 (6): 1078–80.
  13. ^ Яхиро Т., Вангчук С., Тшеринг К., Бандхари П., Зангмо С., Доржи Т., Церинг К., Мацумото Т., Нишизоно А., Сёдерлунд-Венермо М., Ахмед К. 2014. Новый генотип 3 буфавируса человека у детей с тяжелой диареей, Бутан. Emerg Infect Dis. 20 (6): 1037–9.
  14. ^ Phan TG, Dreno B, da Costa AC, Li L, Orlandi P, Deng X, Kapusinszky B, Siqueira J, Knol AC, Halary F, Dantal J, Alexander KA, Pesavento PA, Delwart EA новый протопарвовирус в образцах кала человека и кожных покровах Т-клеточные лимфомы (грибовидный микоз). Вирусология 496: 299–305. DOI: 10.1016 / j.virol.2016.06.013
  15. ^ Phan TG, Sdiri-Loulizi K, Aouni M, Ambert-Balay K, Pothier P, Deng X, Delwart E (2014) Новый парвовирус у ребенка с необъяснимой диареей, Тунис. Emerg Infect Dis 20 (11): 1911–1913. DOI: 10.3201 / eid2011.140428
  16. ^ Килхэм, Л. и Olivier, L.J., 1959. Скрытый вирус крыс, выделенный в культуре ткани. Вирусология 7: 428–37
  17. ^ Таттерсолл, П. 2006. Эволюция таксономии парвовирусов. В: «Парвовирусы». Дж. Керр, С. Ф. Котмор, М. Э. Блум, Р. М. Линден и К. Р. Пэрриш (ред.), Гл. 1. С. 5–4. Ходдер Арнольд, Лондон.
  18. ^ Ren X, Tao Y, Cui J, Suo S, Cong Y, Tijssen P. 2013. Филогения и эволюция парвовируса свиней. Исследование вирусов. 178: 392–397.
  19. ^ «Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV)».
  20. ^ Hoelzer K, Parrish CR. 2010. Появление парвовирусов хищников. Вет. Res. 41:39.

внешняя ссылка