Псевдокиназа - Pseudokinase

Псевдокиназы каталитически дефицитные псевдофермент[1] варианты протеинкиназы которые представлены во всех киномы через царства жизни. Псевдокиназы обладают как физиологическими (преобразование сигнала ) и патофизиологический функции.[2][3][4][5][6][7][8]

История

Термин псевдокиназа впервые был введен в употребление в 2002 году.[9] Впоследствии они были разделены на разные «классы».[10][8][11][12][13] Несколько семейств, содержащих псевдокиназу, обнаружены у человека. киноме, включая псевдокиназы Tribbles, которые находятся на границе раздела киназы и убиквитин E3 лигаза сигнализация.[14][15][16] Псевдокиназы человека (и их псевдофосфатаза кузены) причастны к широкому спектру заболеваний,[17][18] что сделало их потенциальными мишени для наркотиков и противодействие ).[19][20][21][22] Псевдокиназы состоят из эволюционной смеси эукариотической протеинкиназы (ePK) и не связанных с ePK псевдофермент белки (например, FAM20A, который связывает АТФ[23] и является псевдокиназой из-за консервативного глутамат к глутамин поменять местами спираль альфа-С.[24] FAM20A участвует в парадантоз, и служит для контроля каталитической активности FAM20C, важная физиологическая казеинкиназа, которая контролирует фосфорилирование белков в аппарат Гольджи которые предназначены для секреции,[25] например, молочный белок казеин. Комплексный эволюционный анализ подтверждает, что псевдокиназы группируются в несколько подсемейств, и они обнаружены в аннотированных киноме организмов из царств жизни, включая прокариот, архей и все эукариотические линии с аннотированными протеом; эти данные доступны для поиска в ProKino (http://vulcan.cs.uga.edu/prokino/about/browser ). [26]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Мерфи Дж. М., Фархан Х., Айерс ПА (апрель 2017 г.). «Биозомби: рост псевдоферментов в биологии». Сделки Биохимического Общества. 45 (2): 537–544. Дои:10.1042 / BST20160400. PMID  28408493.
  2. ^ Якобсен А.В., Мерфи Дж. М. (июнь 2017 г.). «Тайная жизнь киназ: понимание некаталитических сигнальных функций псевдокиназ». Сделки Биохимического Общества. 45 (3): 665–681. Дои:10.1042 / BST20160331. PMID  28620028.
  3. ^ Мерфи Дж. М., Чжан К., Янг С. Н., Риз М. Л., Бейли Ф. П., Айерс ПА, Унгуряну Д., Хаммарен Х., Сильвеннойнен О, Варгезе Л. Н., Чен К., Трипайдонис А., Джура Н., Фукуда К., Цинь Дж., Нимчук З., Маджетт МБ , Elowe S, Gee CL, Liu L, Daly RJ, Manning G, Babon JJ, Lucet IS (январь 2014 г.). «Надежная методология подкласса псевдокиназ на основе их свойств связывания нуклеотидов». Биохимический журнал. 457 (2): 323–34. Дои:10.1042 / BJ20131174. ЧВК  5679212. PMID  24107129.
  4. ^ Каннан Н., Тейлор С.С. (апрель 2008 г.). «Переосмысление псевдокиназ». Клетка. 133 (2): 204–5. Дои:10.1016 / j.cell.2008.04.005. ЧВК  6226312. PMID  18423189.
  5. ^ Мукерджи К., Шарма М., Урлауб Х., Буренков Г.П., Ян Р., Зюдхоф ТК, Валь М.К. (апрель 2008 г.). «CASK действует как Mg2 + -независимая нейрексинкиназа». Клетка. 133 (2): 328–39. Дои:10.1016 / j.cell.2008.02.036. ЧВК  3640377. PMID  18423203.
  6. ^ Бейли Ф.П., Бирн Д.П., Оруганты К., Эйерс К.Э., Новотны С.Дж., Шокат К.М., Каннан Н., Эйерс ПА (апрель 2015 г.). «Псевдокиназа Tribbles 2 (TRB2) связывается с АТФ и аутофосфорилирует металл-независимым образом». Биохимический журнал. 467 (1): 47–62. Дои:10.1042 / BJ20141441. ЧВК  4844368. PMID  25583260.
  7. ^ Ши Ф., Telesco SE, Лю Й., Радхакришнан Р., Леммон М.А. (апрель 2010 г.). «Внутриклеточный домен ErbB3 / HER3 компетентен связывать АТФ и катализировать аутофосфорилирование». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 107 (17): 7692–7. Bibcode:2010PNAS..107.7692S. Дои:10.1073 / pnas.1002753107. ЧВК  2867849. PMID  20351256.
  8. ^ а б Zeqiraj E, Filippi BM, Deak M, Alessi DR, van Aalten DM (декабрь 2009 г.). «Структура комплекса LKB1-STRAD-MO25 раскрывает аллостерический механизм активации киназы». Наука. 326 (5960): 1707–11. Bibcode:2009Sci ... 326.1707Z. Дои:10.1126 / science.1178377. ЧВК  3518268. PMID  19892943.
  9. ^ Мэннинг Дж., Уайт Д. Б., Мартинес Р., Хантер Т., Сударсанам С. (декабрь 2002 г.). «Комплемент протеинкиназы генома человека». Наука. 298 (5600): 1912–34. Bibcode:2002Наука ... 298.1912М. Дои:10.1126 / science.1075762. PMID  12471243.
  10. ^ Boudeau J, Miranda-Saavedra D, Barton GJ, Alessi DR (сентябрь 2006 г.). «Новые роли псевдокиназ». Тенденции в клеточной биологии. 16 (9): 443–52. Дои:10.1016 / j.tcb.2006.07.003. PMID  16879967.
  11. ^ Zeqiraj E, van Aalten DM (декабрь 2010 г.). «Псевдокиназы-остатки эволюции или ключевые аллостерические регуляторы?». Текущее мнение в структурной биологии. 20 (6): 772–81. Дои:10.1016 / j.sbi.2010.10.001. ЧВК  3014569. PMID  21074407.
  12. ^ Scheeff ED, Eswaran J, Bunkoczi G, Knapp S, Manning G (январь 2009 г.). «Структура псевдокиназы VRK3 выявляет деградированный каталитический сайт, высококонсервативную киназную складку и предполагаемый регуляторный сайт связывания». Структура. 17 (1): 128–38. Дои:10.1016 / j.str.2008.10.018. ЧВК  2639636. PMID  19141289.
  13. ^ Айерс ПА, Мерфи Дж. М. (август 2013 г.). «Рассвет мертвецов: протеиновые псевдокиназы - сигнал о новых приключениях в клеточной биологии». Сделки Биохимического Общества. 41 (4): 969–74. Дои:10.1042 / BST20130115. PMID  23863165.
  14. ^ Eyers PA, Keeshan K, Kannan N (апрель 2017 г.). "Tribbles в 21 веке: эволюционирующая роль псевдокиназных трибблов в биологии и болезнях". Тенденции в клеточной биологии. 27 (4): 284–298. Дои:10.1016 / j.tcb.2016.11.002. ЧВК  5382568. PMID  27908682.
  15. ^ Фоулкс Д.М., Бирн Д.П., Йунг В., Шреста С., Бейли Ф.П., Ферри С., Эйерс К.Э., Кишан К., Уэллс С., Дрюри Д.Х., Цуэрчер В.Дж., Каннан Н., Эйерс ПА (сентябрь 2018 г.). «Ковалентные ингибиторы протеинкиназ семейства EGFR вызывают деградацию человеческой псевдокиназы Tribbles 2 (TRIB2) в раковых клетках». Научная сигнализация. 11 (549). Дои:10.1126 / scisignal.aat7951. ЧВК  6553640. PMID  30254057.
  16. ^ Джеймисон С.А., Руан З., Берджесс А.Е., Карри Дж. Р., Макмиллан HD, Брюстер Дж. Л., Данбьер А. К., Акстман А. Д., Каннан Н., Мейс П. Д. (сентябрь 2018 г.). «Связывание субстрата аллостерически снимает аутоингибирование псевдокиназы TRIB1». Научная сигнализация. 11 (549). Дои:10.1126 / scisignal.aau0597. ЧВК  6553639. PMID  30254053.
  17. ^ Reiterer V, Eyers PA, Farhan H (сентябрь 2014 г.). «День мертвых: псевдокиназы и псевдофосфатазы в физиологии и болезнях». Тенденции в клеточной биологии. 24 (9): 489–505. Дои:10.1016 / j.tcb.2014.03.008. PMID  24818526.
  18. ^ Чен MJ, Диксон Дж., Мэннинг Дж. (Апрель 2017 г.). «Геномика и эволюция протеинфосфатаз». Научная сигнализация. 10 (474): eaag1796. Дои:10.1126 / scisignal.aag1796. PMID  28400531.
  19. ^ Бирн Д.П., Фоулкс Д.М., Эйерс, Пенсильвания (январь 2017 г.). «Псевдокиназы: обновленная информация об их функциях и оценке в качестве новых мишеней для лекарств». Медицинская химия будущего. 9 (2): 245–265. Дои:10.4155 / fmc-2016-0207. PMID  28097887.
  20. ^ Бейли Ф.П., Бирн Д.П., МакСкимминг Д., Каннан Н., Эйерс ПА (январь 2015 г.). «Идем ва-банк: нацелены на псевдокином человека рака». Биохимический журнал. 465 (2): 195–211. Дои:10.1042 / BJ20141060. PMID  25559089.
  21. ^ Cowan-Jacob SW, Jahnke W, Knapp S (апрель 2014 г.). «Новые подходы к нацеливанию киназ: аллостерическое ингибирование, аллостерическая активация и псевдокиназы». Медицинская химия будущего. 6 (5): 541–61. Дои:10.4155 / fmc.13.216. PMID  24649957.
  22. ^ Фоулкс Д.М., Бирн Д.П., Бейли П.П., Эйерс ПА (октябрь 2015 г.). «Псевдокиназы Tribbles: новые мишени для химической биологии и открытия лекарств?». Сделки Биохимического Общества. 43 (5): 1095–103. Дои:10.1042 / BST20150109. PMID  26517930.
  23. ^ Цуй Дж., Чжу К., Чжан Х., Чианфрокко М. А., Лешцинер А. Э., Диксон Дж., Сяо Дж. (Апрель 2017 г.). «Структура Fam20A выявляет псевдокиназу с уникальным дисульфидным паттерном и инвертированным связыванием АТФ». eLife. 6. Дои:10.7554 / eLife.23990. ЧВК  5413348. PMID  28432788.
  24. ^ Цуй Дж., Сяо Дж., Тальабраччи В.С., Вен Дж., Рахдар М., Диксон Дж. Э. (март 2015 г.). «Комплекс секреторной киназы регулирует фосфорилирование внеклеточного белка». eLife. 4: e06120. Дои:10.7554 / eLife.06120. ЧВК  4421793. PMID  25789606.
  25. ^ Тальабраччи VS, Wiley SE, Guo X, Kinch LN, Durrant E, Wen J, Xiao J, Cui J, Nguyen KB, Engel JL, Coon JJ, Grishin N, Pinna LA, Pagliarini DJ, Dixon JE (июнь 2015 г.). «Одна киназа генерирует большую часть секретируемого фосфопротеома». Клетка. 161 (7): 1619–32. Дои:10.1016 / j.cell.2015.05.028. ЧВК  4963185. PMID  26091039.
  26. ^ Квон А., Скотт С., Тауджале Р., Йунг В., Кочут К.Дж., Эйерс ПА, Каннан Н. (апрель 2019 г.). «Отслеживание происхождения и эволюции псевдокиназ по древу жизни». Научная сигнализация. 12 (578). Дои:10.1126 / scisignal.aav3810. ЧВК  6997932. PMID  31015289.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка