Pseudomonas sRNA P16 - Википедия - Pseudomonas sRNA P16

МРНК Pseudomonas P16
RF00628.jpg
Идентификаторы
СимволP16
РфамRF00628
Прочие данные
РНК типГен
Домен (ы)Бактерии
ТАКТАК: 0000655
PDB структурыPDBe

Псевдомонады мРНК P16 это нкРНК это было предсказано с использованием биоинформатический инструменты в геноме условно-патогенного микроорганизма Синегнойная палочка и это выражение проверено северное пятно анализ.[1] МРНК P16, по-видимому, сохраняется в нескольких Псевдомонады видов и последовательно расположен ниже предсказанного гена дезоксирибонуклеазы TatD. P16 имеет предсказанный Ро независимый терминатор на 3 'конце, но функция P16 неизвестна.[1]

Было показано, что эта мРНК транскрибируется с RpoS-зависимого промотора под положительным, вероятно непрямым контролем GacA в двух Псевдомонады разновидность. Он был переименован RgsA (для регуляции GacA и стресса).[2] Экспрессия мРНК RpoS подавляется RgsA во время экспоненциальной фазы. Шаперон РНК Hfq необходим для репрессии.[3]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б Ливни Дж., Бренчич А., Лори С., Уолдор М.К. (2006). «Идентификация 17 мРНК Pseudomonas aeruginosa и прогнозирование генов, кодирующих мРНК у 10 различных патогенов, с использованием биоинформатического инструмента sRNAPredict2». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (12): 3484–3493. Дои:10.1093 / нар / gkl453. ЧВК  1524904. PMID  16870723.
  2. ^ Гонсалес, Николас; Хиб, Стефан; Вальверде, Клаудио; Кей, Элизабет; Реймманн, Корнелия; Джунье, Томас; Хаас, Дитер (13 апреля 2008 г.). «Полногеномный поиск обнаруживает новую регулируемую GacA малую РНК у видов Pseudomonas». BMC Genomics. 9: 167. Дои:10.1186/1471-2164-9-167. ISSN  1471-2164. ЧВК  2375449. PMID  18405392.
  3. ^ Лу, Пей; Ван, Ифэй; Ху, Янбо; Чен, Шиюнь (апрель 2018 г.). «RgsA, RpoS-зависимая мРНК, отрицательно регулирует экспрессию rpoS у Pseudomonas aeruginosa». Микробиология. 164 (4): 716–724. Дои:10.1099 / микрофон. 0.000632. ISSN  1465-2080. PMID  29473822.

внешняя ссылка