QFAB Bioinformatics - Википедия - QFAB Bioinformatics

Квинслендский центр продвинутой биоинформатики
СокращениеQFAB Биоинформатика
Формирование2007 (2007)
Типакадемический некоммерческий
Штаб-квартираИнститут молекулярной биологии
Университет Квинсленда
Брисбен
Область, край
Австралия
Директор
Доктор Доминик Горс
Интернет сайтqfab.org

QFAB Биоинформатика это Квинсленд -основанная организация, занимающаяся предоставлением ресурсов в биоинформатика, биостатистика и специализированные вычисление платформы. QFAB работает Австралия -широко и является ключевым участником EMBL Australia Ресурс по биоинформатике.[1]

История

QFAB была основана в 2007 году.[2]при финансовой поддержке Программы национальных и международных исследовательских альянсов правительства Квинсленда,[3] как совместное предприятие Университет Квинсленда, Квинслендский технологический университет, Университет Гриффита, CSIRO Австралийский исследовательский центр электронного здравоохранения и Правительство Квинсленда Министерство сельского хозяйства, рыболовства и лесного хозяйства.

Профессор Марк Рэган от Институт молекулярной биологии (IMB) и доктор Энтони Мейдер из Австралийский исследовательский центр электронного здравоохранения возглавил создание QFAB и назначил г-на Джереми Баркера генеральным директором (2007–2014 гг.) для решения трех критических проблем, с которыми тогда сталкивалась биоинформатика в Квинсленд:[4]

  1. интегрированные данные и высокопроизводительные вычисления в безопасной среде
  2. доступная пропускная способность сети
  3. доступ к квалифицированному персоналу

В 2015 году д-р Доминик Горс стал генеральным директором QFAB и возглавил стратегический альянс с QCIF, Queensland Cyber ​​Infrastructure Foundation, который привел к слиянию двух организаций в апреле 2016 года. QCIF осуществляет значительную деятельность. высокопроизводительные вычисления, облачные вычисления и ресурсы хранения данных, является частью национальная инфраструктура электронных исследований.

Фонд кибер-инфраструктуры Квинсленда

QFAB Bioinformatics - это подразделение Фонд кибер-инфраструктуры Квинсленда (QCIF), а некоммерческий членская организация.

Члены

Аффилированный член

Галактика Австралия

QFAB и QCIF вместе с Мельбурнский университет с Мельбурн Биоинформатикс, а Университет Квинсленда с Исследовательский вычислительный центр совместно построены и работают Галактика Австралия, что является важной особенностью Виртуальной лаборатории геномики[5]на основе Галактика (вычислительная биология) система научного документооборота.

Рекомендации

  1. ^ Шнайдер, Мария Виктория; Гриффин, Филиппа С; Тяги, Соника; Фланнери, Мэдисон; Даялан, Сараванан; Глэдман, Саймон; Уотсон-Хей, Натан; Байер, Филипп Э; Чарльстон, Майкл; Кук, Ира; Повар, Роб; Эдвардс, Ричард Дж; Эдвардс, Дэвид; Горс, Доминик; МакКонвилл, Малькольм; Пауэлл, Дэвид; Wilkins, Marc R; Лони, Эндрю (2008). «Создание распределенной национальной исследовательской инфраструктуры, обеспечивающей биоинформатическую поддержку исследователям наук о жизни в Австралии». Брифинги по биоинформатике. 20 (2): 384–389. Дои:10.1093 / bib / bbx071. ЧВК  6433737. PMID  29106479.
  2. ^ Ragan, M. A .; Littlejohn, T .; Росс, Брюс (2008). «Вычислительная биология и биоинформатика в масштабе генома в Австралии». PLoS вычислительная биология. 4 (8): e1000068. Дои:10.1371 / journal.pcbi.1000068. ЧВК  2440818. PMID  18769502.
  3. ^ «Правительство Qld предоставило ММБ более 2,5 миллионов долларов финансирования». Новости UQ. 2006. Получено 30 мая 2019.
  4. ^ "Квинслендский фонд передовой биоинформатики (QFAB) (2006–2010)". Исследователи UQ. 2006. Получено 30 мая 2019.
  5. ^ Афган, Энис; Слоггетт, Клэр; Гунасекера, Нуван; Макунин, Игорь; Бенсон, Дерек; Кроу, Марк; Глэдман, Саймон; Ковсар, Юсеф; Фазан, Майкл; Хорст, Рон; Лони, Эндрю (2015). «Виртуальная лаборатория геномики: практическое средство биоинформатики для облака». PLOS ONE. 10 (10): e0140829. Дои:10.1371 / journal.pone.0140829. ЧВК  4621043. PMID  26501966.