RAE1 - RAE1

RAE1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	3ММГ, 4OWR
Идентификаторы
Псевдонимы	RAE1, MIG14, MRNP41, Mnrp41, dJ481F12.3, dJ800J21.1, экспорт рибонуклеиновой кислоты 1, Gle2
Внешние идентификаторы	OMIM: 603343 MGI: 1913929 ГомолоГен: 2676 Генные карты: RAE1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 20 (человек)
Конец	57,379,211 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	173,015,739 бп
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание микротрубочек; • Связывание РНК; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание убиквитина;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • ядерная пора; • ядро клетки; • ядерная оболочка; • фибриллярный центр; • полюс митотического веретена; • полюс шпинделя; • цитоскелет; • клетка-хозяин;
Биологический процесс	• клеточный ответ на органическое циклическое соединение; • GO: 0022415 вирусный процесс; • регуляция организации митотического веретена; • транскрипционно-зависимое связывание ДНК гена РНК-полимеразы II на периферии ядра; • Экспорт РНК из ядра; • импорт белка в ядро; • клеточный цикл; • деление клеток; • экспорт мРНК из ядра; • регулирование гликолитического процесса; • экспорт тРНК из ядра; • белковое сумоилирование; • вирусная транскрипция; • регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA; • GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса; • регуляция клеточного ответа на тепло;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	8480
	66679
	ENSG00000101146
	ENSMUSG00000027509
	P78406
	Q8C570
	NM_001015885; NM_003610
	NM_175112
	NP_001015885; NP_003601
	NP_780321
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

фактор экспорта мРНК это белок что у людей кодируется RAE1 ген.^[5]^[6]^[7]

Было показано, что мутации в генах Schizosaccharomyces pombe Rae1 и Saccharomyces cerevisiae Gle2 приводят к накоплению поли (A) -содержащей мРНК в ядре, что позволяет предположить, что кодируемые белки участвуют в экспорте РНК. Белок, кодируемый этим геном, является гомологом дрожжевого Rae1. Он содержит четыре мотива WD40 и, как было показано, локализуется в различных фокусах в нуклеоплазме, на ядерном крае и в сетчатых структурах по всей цитоплазме. Считается, что этот ген участвует в ядерно-цитоплазматическом транспорте и в прямом или косвенном присоединении цитоплазматических мРНП к цитоскелету. Для этого гена были обнаружены альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие тот же белок.^[7]

Взаимодействия

RAE1 был показан взаимодействовать с участием NUP98.^[8]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101146 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000027509 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Бхарати А., Гош А., Уэлен В.А., Юн Дж. Х., Пу Р., Дассо М., Дхар Р. (декабрь 1997 г.). «Ген RAE1 человека является функциональным гомологом гена rae1 Schizosaccharomyces pombe, участвующего в ядерном экспорте Poly (A) + РНК». Ген. 198 (1–2): 251–8. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00322-3. PMID 9370289.
^ Kraemer D, Blobel G (сентябрь 1997 г.). «мРНК-связывающий белок mrnp 41 локализуется как в ядре, так и в цитоплазме». Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (17): 9119–24. Bibcode:1997PNAS ... 94.9119K. Дои:10.1073 / пнас.94.17.9119. ЧВК 23064. PMID 9256445.
^ ^а ^б «Ген Entrez: RAE1, гомолог экспорта 1 РНК RAE1 (S. pombe)».
^ Причард, С. Э .; Fornerod M; Каспер Л. Х; ван Дерсен Дж. М. (апрель 1999 г.). «RAE1 представляет собой фактор экспорта мРНК, который связывается с GLEBS-подобным мотивом NUP98 в комплексе ядерной поры через несколько доменов». J. Cell Biol. 145 (2): 237–54. Дои:10.1083 / jcb.145.2.237. ISSN 0021-9525. ЧВК 2133102. PMID 10209021.

дальнейшее чтение

Nomura M, Zou Z, Joh T и др. (1997). «Геномные структуры и характеристика членов семейства Rae1, кодирующих GPI-заякоренные поверхностные белки клеток и экспрессируемых преимущественно в эмбриональном мозге мыши». J. Biochem. 120 (5): 987–95. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a021517. PMID 8982867.
Юн Дж. Х., Уэлен В. А., Бхарати А. и др. (1997). «Npp106p, нуклеопорин Schizosaccharomyces pombe, подобный Saccharomyces cerevisiae Nic96p, функционально взаимодействует с Rae1p при экспорте мРНК». Мол. Cell. Биол. 17 (12): 7047–60. Дои:10.1128 / MCB.17.12.7047. ЧВК 232561. PMID 9372936.
Мацуока Ю., Такаги М., Бан Т. и др. (1999). «Идентификация и характеристика субкомплексов ядерных пор в митотическом экстракте соматических клеток человека». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 254 (2): 417–23. Дои:10.1006 / bbrc.1998.9953. PMID 9918853.
Притчард К.Э., Форнерод М., Каспер Л.Х., ван Дерсен Дж. М. (1999). «RAE1 представляет собой фактор экспорта мРНК, который связывается с GLEBS-подобным мотивом NUP98 в комплексе ядерной поры через несколько доменов».. J. Cell Biol. 145 (2): 237–54. Дои:10.1083 / jcb.145.2.237. ЧВК 2133102. PMID 10209021.
Бачи А., Браун И.С., Родригес Дж. П. и др. (2000). «C-концевой домен TAP взаимодействует с комплексом ядерных пор и способствует экспорту специфических CTE-несущих РНК-субстратов». РНК. 6 (1): 136–58. Дои:10.1017 / S1355838200991994. ЧВК 1369901. PMID 10668806.
Юн Дж. Х., Лав Д. К., Гухатакурта А. и др. (2000). «Mex67p Schizosaccharomyces pombe взаимодействует с Rae1p, опосредуя экспорт мРНК». Мол. Cell. Биол. 20 (23): 8767–82. Дои:10.1128 / MCB.20.23.8767-8782.2000. ЧВК 86506. PMID 11073978.
Сабри N, Visa N (2000 г.). «Белок Ct-RAE1 взаимодействует с частицами РНП кольца Бальбиани в ядерной поре». РНК. 6 (11): 1597–609. Дои:10.1017 / S1355838200001138. ЧВК 1370029. PMID 11105759.
Ван Х, Бабу Дж. Р., Харден Дж. М. и др. (2001). «Белок митотической контрольной точки hBUB3 и фактор экспорта мРНК hRAE1 взаимодействуют с белками, содержащими GLE2p-связывающую последовательность (GLEBS)». J. Biol. Chem. 276 (28): 26559–67. Дои:10.1074 / jbc.M101083200. PMID 11352911.
O'Callaghan CA, Cerwenka A, Willcox BE и др. (2001). «Молекулярная конкуренция за NKG2D: H60 и RAE1 неравно конкурируют за NKG2D с доминированием H60». Иммунитет. 15 (2): 201–11. Дои:10.1016 / S1074-7613 (01) 00187-X. PMID 11520456.
Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека». Природа. 414 (6866): 865–71. Bibcode:2001Натура.414..865D. Дои:10.1038 / 414865a. PMID 11780052.
Kraemer D, Dresbach T, Drenckhahn D (2002). «Mrnp41 (Rae 1p) связывается с микротрубочками в клетках HeLa и в нейронах». Евро. J. Cell Biol. 80 (12): 733–40. Дои:10.1078/0171-9335-00216. PMID 11831386.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Фариа П.А., Чакраборти П., Левай А. и др. (2005). «VSV нарушает путь ядерного экспорта мРНК Rae1 / mrnp41». Мол. Ячейка. 17 (1): 93–102. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.11.023. PMID 15629720.
Бензингер А., Мустер Н., Кох HB и др. (2005). «Целевой протеомный анализ 14-3-3 сигма, эффектора р53, обычно подавляемого при раке». Мол. Cell. Протеомика. 4 (6): 785–95. Дои:10.1074 / mcp.M500021-MCP200. PMID 15778465.
Blower MD, Nachury M, Heald R, Weis K (2005). «Рибонуклеопротеиновый комплекс, содержащий Rae1, необходим для сборки митотического веретена». Ячейка. 121 (2): 223–34. Дои:10.1016 / j.cell.2005.02.016. PMID 15851029. S2CID 242561.
Вонг RW, Блобель G, Coutavas E (2007). «Взаимодействие Rae1 с NuMA необходимо для формирования биполярного веретена». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103 (52): 19783–7. Bibcode:2006PNAS..10319783W. Дои:10.1073 / pnas.0609582104. ЧВК 1750899. PMID 17172455.

Эта статья о ген на хромосома человека 20 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101146 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000027509 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid9370289-5] Бхарати А., Гош А., Уэлен В.А., Юн Дж. Х., Пу Р., Дассо М., Дхар Р. (декабрь 1997 г.). «Ген RAE1 человека является функциональным гомологом гена rae1 Schizosaccharomyces pombe, участвующего в ядерном экспорте Poly (A) + РНК». Ген. 198 (1–2): 251–8. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00322-3. PMID 9370289.

[pmid9256445-6] Kraemer D, Blobel G (сентябрь 1997 г.). «мРНК-связывающий белок mrnp 41 локализуется как в ядре, так и в цитоплазме». Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (17): 9119–24. Bibcode:1997PNAS ... 94.9119K. Дои:10.1073 / пнас.94.17.9119. ЧВК 23064. PMID 9256445.

[entrez-7] а ^б «Ген Entrez: RAE1, гомолог экспорта 1 РНК RAE1 (S. pombe)».

[pmid10209021-8] Причард, С. Э .; Fornerod M; Каспер Л. Х; ван Дерсен Дж. М. (апрель 1999 г.). «RAE1 представляет собой фактор экспорта мРНК, который связывается с GLEBS-подобным мотивом NUP98 в комплексе ядерной поры через несколько доменов». J. Cell Biol. 145 (2): 237–54. Дои:10.1083 / jcb.145.2.237. ISSN 0021-9525. ЧВК 2133102. PMID 10209021.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]