RAPGEF1 - RAPGEF1

RAPGEF1
Идентификаторы
Псевдонимы	RAPGEF1, C3G, GRF2, фактор обмена рап-гуаниновых нуклеотидов 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 600303 MGI: 104580 ГомолоГен: 50501 Генные карты: RAPGEF1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 9 (человек)
Конец	131,740,074 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	29,740,978 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• Привязка домена SH3; • GO: 0001948 связывание с белками; • Активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов Rap; • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов;
Сотовый компонент	• цитозоль; • эндосома; • ранняя эндосома; • мембрана фагоцитарных везикул; • перинуклеарная область цитоплазмы; • цитоплазма; • макромолекулярный комплекс;
Биологический процесс	• установление эндотелиального барьера; • отрицательная регуляция передачи сигналов протеинкиназы B; • клеточный ответ на стимул фактора роста нервов; • регулировка сборки узловых соединений; • активация активности MAPKK; • сигнальный путь трансмембранного рецептора протеина тирозинкиназы; • передача сигнала, опосредованная малой GTPase; • Передача сигнала Rap-белка; • отрицательная регуляция пролиферации нервных клеток-предшественников; • сигнальный путь фактора роста нервов; • развитие нервной системы; • отрицательная регуляция передачи сигнала белка Ras; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase; • развитие кровеносных сосудов; • отрицательная регуляция каскада ERK1 и ERK2; • сигнальный путь рецептора фактора роста тромбоцитов; • отрицательная регуляция канонического сигнального пути Wnt; • клеточный ответ на цАМФ; • преобразование сигнала; • положительная регуляция развития проекции нейронов; • регулирование каскада JNK; • положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2; • положительная регуляция сигнального пути рецептора Fc-гамма, участвующего в фагоцитозе; • межклеточная адгезия; • цитокин-опосредованный сигнальный путь; • положительная регуляция передачи сигнала белка Ras; • GO: 0032861, GO: 0032862, GO: 0032856 активация активности GTPase;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	2889
	107746
	ENSG00000107263
	ENSMUSG00000039844
	Q13905
	н / д
NM_001304275; NM_005312; NM_198679; NM_001377935; NM_001377936;
	NM_001377937; NM_001377938
	NM_001039086; NM_001039087; NM_054050; NM_001362702
NP_001291204; NP_005303; NP_941372; NP_001364864; NP_001364865;
	NP_001364866; NP_001364867
	н / д
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Фактор обмена рап-гуаниновых нуклеотидов 1 это белок что у людей кодируется RAPGEF1 ген.^[5]^[6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой белок, высвобождающий гуанин-нуклеотид человека для белка Ras. Он принадлежит к молекулам, содержащим гомологию Src (SH) 2 адаптерного типа. Домены Src homology 2 представляют собой глобулярные белковые модули, присутствующие в большом количестве функционально различных белков. Они опосредуют события связывания, которые контролируют активность и локализацию многих белков, участвующих в передаче сигналов от поверхности клетки к ядру. МРНК этих белков повсеместно экспрессируются в тканях взрослого человека и плода. Было описано несколько альтернативно сплайсированных вариантов транскрипта этого гена, но полноразмерная природа некоторых вариантов не была определена.^[7]

Взаимодействия

RAPGEF1 был показан взаимодействовать с:

BCAR1,^[8]
CRK,^[6]
CRKL^[9]^[10]^[11]^[12]^[13]^[14]^[15]
Grb2,^[6]^[9] и
HCK.^[16]

дальнейшее чтение

Пессин Дж. Э., Окада С. (март 1999 г.). «Рецепторы инсулина и EGF объединяют сигнальные пути Ras и Rap». Эндокринный журнал. 46 Дополнение: S11-6. Дои:10.1507 / endocrj.46.suppl_s11. PMID 12054111.
Эрхардт А., Эрхардт Г.Р., Гуо Х, Шредер Дж.В. (октябрь 2002 г.). «Рас и родственники - совместная работа и нетворкинг поддерживают старую семью». Экспериментальная гематология. 30 (10): 1089–106. Дои:10.1016 / S0301-472X (02) 00904-9. PMID 12384139.
Кнудсен Б.С., Феллер С.М., Ханафуса Х. (декабрь 1994 г.). «Четыре богатые пролином последовательности фактора обмена гуанин-нуклеотид C3G связываются с уникальной специфичностью с первым доменом 3 гомологии Src Crk». Журнал биологической химии. 269 (52): 32781–7. PMID 7806500.
Гото Т., Хаттори С., Накамура С., Китайма Х., Нода М., Такай Й., Кайбути К., Мацуи Х., Хатасе О, Такахаши Х. (декабрь 1995 г.). «Идентификация Rap1 в качестве мишени для связывающего домен Crk SH3 гуанин-нуклеотид-рилизинг-фактора C3G». Молекулярная и клеточная биология. 15 (12): 6746–53. Дои:10.1128 / mcb.15.12.6746. ЧВК 230928. PMID 8524240.
Смит Л., ван дер Хорст Г., Борст Дж. (Апрель 1996 г.). «Sos, Vav и C3G участвуют в сигнальных путях, индуцированных В-клеточными рецепторами, и по-разному связываются с адаптерами Shc-Grb2, Crk и Crk-L». Журнал биологической химии. 271 (15): 8564–9. Дои:10.1074 / jbc.271.15.8564. PMID 8621483.
Мацуда М., Ота С., Танимура Р., Накамура Х., Матуока К., Такенава Т., Нагашима К., Курата Т. (июнь 1996 г.). «Взаимодействие между аминоконцевым SH3-доменом CRK и его естественными белками-мишенями». Журнал биологической химии. 271 (24): 14468–72. Дои:10.1074 / jbc.271.24.14468. PMID 8662907.
Уэмура Н., Салгия Р., Ли Дж. Л., Писик Е., Саттлер М., Гриффин Дж. Д. (март 1997 г.). «Онкоген BCR / ABL изменяет взаимодействие адаптерных белков CRKL и CRK с клеточными белками». Лейкемия. 11 (3): 376–85. Дои:10.1038 / sj.leu.2400590. PMID 9067577.
Хассон Х., Мограби Б., Шмид-Антомарчи Х., Фишер С., Росси Б. (май 1997 г.). «Стимуляция CSF-1 вызывает образование мультибелкового комплекса, включающего рецептор CSF-1, c-Cbl, PI 3-киназу, Crk-II и Grb2». Онкоген. 14 (19): 2331–8. Дои:10.1038 / sj.onc.1201074. PMID 9178909.
Чин Х., Сайто Т., Араи А., Ямамото К., Камияма Р., Миясака Н., Миура О. (октябрь 1997 г.). «Эритропоэтин и ИЛ-3 индуцируют фосфорилирование тирозина CrkL и его ассоциацию с Shc, SHP-2 и Cbl в гемопоэтических клетках». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 239 (2): 412–7. Дои:10.1006 / bbrc.1997.7480. PMID 9344843.
Ахмад С., Алсайед Ю.М., Друкер Б.Дж., Platanias LC (ноябрь 1997 г.). «Рецептор интерферона типа I опосредует фосфорилирование тирозина адапторного белка CrkL». Журнал биологической химии. 272 (48): 29991–4. Дои:10.1074 / jbc.272.48.29991. PMID 9374471.
Герреро С., Фернандес-Медарде А., Рохас Дж. М., Фонт де Мора Дж., Эстебан Л. М., Сантос Е. (февраль 1998 г.). «Активность C3G по подавлению трансформации не зависит от его домена гомологии CDC25». Онкоген. 16 (5): 613–24. Дои:10.1038 / sj.onc.1201569. PMID 9482107.
Охаши Ю., Татибана К., Камигучи К., Фудзита Х., Моримото С. (март 1998 г.). «Опосредованное Т-клеточным рецептором фосфорилирование тирозина Cas-L, 105-кДа Crk-ассоциированного субстратного белка, и его ассоциация с Crk и C3G». Журнал биологической химии. 273 (11): 6446–51. Дои:10.1074 / jbc.273.11.6446. PMID 9497377.
Астье А., Маниэ С.Н., Ло С.Ф., Кэнти Т., Хагайги Н., Друкер Б.Дж., Салгия Р., Големис Е.А., Фридман А.С. (декабрь 1997 г.). «Ассоциация Cas-подобной молекулы HEF1 с CrkL после передачи сигналов интегрина и антигенного рецептора в человеческих В-клетках: потенциальное значение для неопластических лимфогематопоэтических клеток». Лейкемия и лимфома. 28 (1–2): 65–72. Дои:10.3109/10428199709058332. PMID 9498705.
Йокоте К., Хеллман Ю., Экман С., Сайто Ю., Рённстранд Л., Сайто Ю., Хелдин С. К., Мори С. (март 1998 г.). «Идентификация Tyr-762 в альфа-рецепторе тромбоцитарного фактора роста в качестве сайта связывания для белков Crk». Онкоген. 16 (10): 1229–39. Дои:10.1038 / sj.onc.1201641. PMID 9546424.
Кирш К. Х., Георгеску М. М., Ханафуса Х. (октябрь 1998 г.). «Прямое связывание p130 (Cas) с фактором обмена гуаниновых нуклеотидов C3G». Журнал биологической химии. 273 (40): 25673–9. Дои:10.1074 / jbc.273.40.25673. PMID 9748234.
Ичиба Т., Хашимото Ю., Накая М., Кураиси Ю., Танака С., Курата Т., Мочизуки Н., Мацуда М. (май 1999 г.). «Активация фактора обмена гуаниновых нуклеотидов C3G на Rap1 путем фосфорилирования тирозина 504». Журнал биологической химии. 274 (20): 14376–81. Дои:10.1074 / jbc.274.20.14376. PMID 10318861.
Носака И., Араи А., Миясака Н., Миура О. (октябрь 1999 г.). «CrkL опосредует Ras-зависимую активацию пути Raf / ERK через фактор обмена гуаниновых нуклеотидов C3G в гемопоэтических клетках, стимулированных эритропоэтином или интерлейкином-3». Журнал биологической химии. 274 (42): 30154–62. Дои:10.1074 / jbc.274.42.30154. PMID 10514505.
Уэмура Н., Гриффин Дж. Д. (декабрь 1999 г.). «Адаптерный белок Crkl связывает Cbl с C3G после лигирования интегрина и усиливает миграцию клеток». Журнал биологической химии. 274 (53): 37525–32. Дои:10.1074 / jbc.274.53.37525. PMID 10608804.

внешняя ссылка

RAPGEF1 Информация со ссылками в Шлюз миграции ячеек

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000107263 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039844 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid7959692-5] Такай С., Танака М., Сугимура Х., Ямада К., Наито Ю., Кино И., Мацуда М. (ноябрь 1994 г.). «Картирование человеческого гена C3G, кодирующего гуанин-нуклеотид-высвобождающий белок для семейства Ras, на 9q34.3 путем флуоресцентной гибридизации in situ». Генетика человека. 94 (5): 549–50. Дои:10.1007 / bf00211024. PMID 7959692. S2CID 34197232.

[pmid7512734-6] а ^б ^c Танака С., Моришита Т., Хашимото Ю., Хаттори С., Накамура С., Сибуя М., Матуока К., Такенава Т., Курата Т., Нагашима К. (апрель 1994 г.). «C3G, белок, высвобождающий гуанин-нуклеотид, экспрессируемый повсеместно, связывается с доменами 3 гомологии Src белков CRK и GRB2 / ASH». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 91 (8): 3443–7. Дои:10.1073 / пнас.91.8.3443. ЧВК 43593. PMID 7512734.

[entrez-7] «Ген Entrez: RAPGEF1 Фактор обмена рап-гуаниновых нуклеотидов (GEF) 1».

[pmid9748234-8] Кирш К. Х., Георгеску М. М., Ханафуса Х. (октябрь 1998 г.). «Прямое связывание p130 (Cas) с фактором обмена гуаниновых нуклеотидов C3G». Журнал биологической химии. 273 (40): 25673–9. Дои:10.1074 / jbc.273.40.25673. PMID 9748234.

[pmid8621483-9] а ^б Смит Л., ван дер Хорст Дж., Борст Дж. (Апрель 1996 г.). «Sos, Vav и C3G участвуют в сигнальных путях, индуцированных В-клеточными рецепторами, и по-разному связываются с адаптерами Shc-Grb2, Crk и Crk-L». Журнал биологической химии. 271 (15): 8564–9. Дои:10.1074 / jbc.271.15.8564. PMID 8621483.

[pmid9820532-10] Кионо В.Т., де Йонг Р., Пак Р.К., Лю Й., Хейстеркамп Н., Гроффен Дж., Дерден Д.Л. (ноябрь 1998 г.). «Дифференциальное взаимодействие Crkl с Cbl или C3G, Hef-1 и мотивом активации на основе тирозина иммунорецептора гамма-субъединицы в передаче сигналов миелоидного высокоаффинного рецептора Fc для IgG (Fc gamma RI)». Журнал иммунологии. 161 (10): 5555–63. PMID 9820532.

[pmid11167825-11] Грумбах И.М., Майер И.А., Уддин С., Лекмин Ф., Майчжак Б., Ямаути Х., Фуджита С., Друкер Б., Fish EN, Platanias LC (февраль 2001 г.). «Участие адаптера CrkL в передаче сигналов интерферона альфа в BCR-ABL-экспрессирующих клетках». Британский журнал гематологии. 112 (2): 327–36. Дои:10.1046 / j.1365-2141.2001.02556.x. PMID 11167825. S2CID 85033851.

[pmid9374471-12] Ахмад С., Алсайед Ю.М., Друкер Б.Дж., Platanias LC (ноябрь 1997 г.). «Рецептор интерферона типа I опосредует фосфорилирование тирозина адапторного белка CrkL». Журнал биологической химии. 272 (48): 29991–4. Дои:10.1074 / jbc.272.48.29991. PMID 9374471.

[pmid9344843-13] Чин Х., Сайто Т., Араи А., Ямамото К., Камияма Р., Миясака Н., Миура О. (октябрь 1997 г.). «Эритропоэтин и IL-3 вызывают фосфорилирование тирозина CrkL и его ассоциацию с Shc, SHP-2 и Cbl в гемопоэтических клетках». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 239 (2): 412–7. Дои:10.1006 / bbrc.1997.7480. PMID 9344843.

[pmid11466412-14] Wu C, Lai CF, Mobley WC (август 2001 г.). «Фактор роста нервов активирует постоянную передачу сигналов Rap1 в эндосомах». Журнал неврологии. 21 (15): 5406–16. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.21-15-05406.2001. PMID 11466412.

[pmid10753869-15] Sakkab D, Lewitzky M, Posern G, Schaeper U, Sachs M, Birchmeier W, Feller SM (апрель 2000 г.). «Передача сигналов фактора роста гепатоцитов / фактора рассеяния (HGF) малой GTPase Rap1 через большой стыковочный белок Gab1 и адаптерный белок CRKL». Журнал биологической химии. 275 (15): 10772–8. Дои:10.1074 / jbc.275.15.10772. PMID 10753869.

[pmid14551197-16] Шивакрупа Р., Радха В., Судхакар Ч., Сваруп Г. (декабрь 2003 г.). «Физическое и функциональное взаимодействие между тирозинкиназой Hck и фактором обмена гуаниновых нуклеотидов C3G приводит к апоптозу, который не зависит от каталитического домена C3G». Журнал биологической химии. 278 (52): 52188–94. Дои:10.1074 / jbc.M310656200. PMID 14551197.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

RAPGEF1 - RAPGEF1

Содержание

Функция

Взаимодействия

Рекомендации

дальнейшее чтение

внешняя ссылка