RGPD5 - RGPD5

RGPD5
Белок RGPD5 PDB 1xke.png
Идентификаторы
ПсевдонимыRGPD5, BS-63, BS63, HEL161, RGP5, RANBP2-подобный и GRIP-домен, содержащий 5, RANBP2-подобный и GRIP-домен, содержащий 5
Внешние идентификаторыOMIM: 612708 MGI: 894323 ГомолоГен: 87808 Генные карты: RGPD5
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человек)[1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение RGPD5
Геномное расположение RGPD5
Группа2к13Начинать109,792,758 бп[1]
Конец109,857,705 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_005054
NM_032260

NM_011240

RefSeq (белок)

NP_005045
NP_115636

NP_035370

Расположение (UCSC)Chr 2: 109,79 - 109,86 МбChr 10: 58.45 - 58.49 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

RANBP2-подобный белок 5, содержащий домен GRIP это белок что у людей кодируется RGPD5 ген.[5][6][7]

RAN - это небольшой GTP-связывающий белок суперсемейства RAS, который связан с ядерной мембраной и, как полагают, контролирует множество клеточных функций посредством взаимодействия с другими белками. Этот ген имеет высокую степень идентичности последовательности с RANBP2, большим RAN-связывающим белком, локализованным на цитоплазматической стороне комплекса ядерных пор. Полагают, что этот член семейства гена RANBP2 возник в результате события дупликации на 3 мб дистальнее RANBP2. Для этого локуса наблюдался альтернативный сплайсинг, и описаны два варианта. Предлагается дополнительный сплайсинг, но полная последовательность для дальнейших транскриптов не определена.[7]

Взаимодействия

RGPD5 был показан взаимодействовать с Транспорт в 1.[8]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000015568 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000003226 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Ciccarelli FD, фон Меринг C, Suyama M, Harrington ED, Izaurralde E, Bork P (март 2005 г.). «Сложные геномные перестройки приводят к новой функции генов приматов». Геномные исследования. 15 (3): 343–51. Дои:10.1101 / гр.3266405. ЧВК  551560. PMID  15710750.
  6. ^ Хиллер Л.В., Грейвс Т.А., Фултон Р.С., Фултон Л.А., Пепин К.Х., Минкс П. и др. (Апрель 2005 г.). «Создание и аннотирование последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека». Природа. 434 (7034): 724–31. Bibcode:2005Натура.434..724H. Дои:10.1038 / природа03466. PMID  15815621.
  7. ^ а б «Ген Entrez: RGPD5 RANBP2-подобный и домен GRIP, содержащий 5».
  8. ^ Цай И, Мяо С.Ю., Ван Л.Ф. (октябрь 2001 г.). «[Определение сайта связывания семенников-специфического нуклеопорина BS-63 с транспортином (кароферин бета 2) и доказательство их комбинации in vitro]». Чжунго И Сюэ Кэ Сюэ Юань Сюэ Бао. Acta Academiae Medicinae Sinicae. 23 (5): 462–6. PMID  12905863.

дальнейшее чтение