RNF213 - RNF213

RNF213
Идентификаторы
ПсевдонимыRNF213, ALO17, C17orf27, KIAA1618, MYMY2, MYSTR, NET57, белок безымянного пальца 213
Внешние идентификаторыOMIM: 613768 MGI: 1289196 ГомолоГен: 45439 Генные карты: RNF213
Расположение гена (человек)
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человек)[1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение RNF213
Геномное расположение RNF213
Группа17q25.3Начинать80,260,866 бп[1]
Конец80,398,786 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001256071
NM_020914
NM_020954

NM_001040005

RefSeq (белок)

NP_001243000
NP_066005

н / д

Расположение (UCSC)Chr 17: 80.26 - 80.4 МбChr 11: 119.39 - 119.49 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Протеин безымянного пальца 213 это белок что у людей кодируется RNF213 ген.[5] RNF213 представляет собой цитозольный E3 с массой 591 кДа. Убиквитин -лигаза с RING finger и AAA + ATPase доменами.

Клиническая значимость

Анализ сцепления по всей хромосоме показал, что локус болезни моямойя находится в хромосоме 17q25.[6] Полногеномный анализ сцепления 15 японских семейств аутосомно-доминантной болезни моямоя сузил локус до 17q25.3.[7] Прямое секвенирование области и секвенирование всего экзома выявили мутацию p.Arg4810Lys в RNF213 ген как основатель мутации болезнь моямоя.[8] Полногеномное ассоциативное исследование также выявило RNF213 как ген, вызывающий болезнь Болезнь Моямоя.[9] Сравнительный анализ эволюционного секвенирования генома у людей и обезьян показал, что самым убедительным доказательством ускорения по ветви, ведущей к гомининам, был RNF213.[10] Было показано, что RNF213 связан с кровотоком и потреблением кислорода.[11][12][13] Учитывая, что потребление кислорода и глюкозы зависит от общего числа нейронов, RNF213, возможно, сыграл роль в облегчении эволюции более крупного мозга у приматов.[10]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000173821 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000070327 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ "Entrez Gene: белок безымянного пальца 213".
  6. ^ Ямаути Т., Тада М., Хоукин К., Танака Т., Накамура Ю., Курода С. и др. (Апрель 2000 г.). «Связь семейной болезни моямоя (спонтанная окклюзия виллизиева круга) с хромосомой 17q25». Гладить. 31 (4): 930–5. Дои:10.1161 / 01.str.31.4.930. PMID  10754001.
  7. ^ Минехару Ю., Лю В., Иноуэ К., Мацуура Н., Иноуэ С., Такенака К. и др. (Июнь 2008 г.). «Аутосомно-доминантная болезнь моямоя отображается на хромосоме 17q25.3». Неврология. 70 (24, часть 2): 2357–63. Дои:10.1212 / 01.wnl.0000291012.49986.f9. HDL:2433/135797. PMID  18463369. S2CID  1766812.
  8. ^ Лю В., Морито Д., Такашима С., Минехару Ю., Кобаяши Н., Хитоми Т. и др. (Июль 2011 г.). «Идентификация RNF213 как гена восприимчивости к болезни моямоя и его возможная роль в развитии сосудов». PLOS ONE. 6 (7): e22542. Дои:10.1371 / journal.pone.0022542. ЧВК  3140517. PMID  21799892.
  9. ^ Камада Ф., Аоки Ю., Нарисава А., Абэ Ю., Комацузаки С., Кикучи А. и др. (Январь 2011 г.). «Полногеномное ассоциативное исследование идентифицирует RNF213 как первый ген болезни Моямоя». Журнал генетики человека. 56 (1): 34–40. Дои:10.1038 / jhg.2010.132. PMID  21048783.
  10. ^ а б Scally A, Dutheil JY, Hillier LW, Jordan GE, Goodhead I, Herrero J и др. (Март 2012 г.). «Понимание эволюции гоминидов из последовательности генома гориллы». Природа. 483 (7388): 169–75. Дои:10.1038 / природа10842. ЧВК  3303130. PMID  22398555.
  11. ^ Banh RS, Iorio C, Marcotte R, Xu Y, Cojocari D., Rahman AA, et al. (Июль 2016 г.). «PTP1B контролирует немитохондриальное потребление кислорода, регулируя RNF213, чтобы способствовать выживанию опухоли во время гипоксии». Природа клеточной биологии. 18 (7): 803–813. Дои:10.1038 / ncb3376. ЧВК  4936519. PMID  27323329.
  12. ^ Кобаяси Х., Кабата Р., Киношита Х., Моримото Т., Оно К., Такеда М. и др. (Май 2018). «Редкие варианты RNF213, гена восприимчивости к болезни моямоя, обнаружены у пациентов с легочной гипертензией и усугубляют вызванную гипоксией легочную гипертензию у мышей». Легочное кровообращение. 8 (3): 2045894018778155. Дои:10.1177/2045894018778155. ЧВК  5991195. PMID  29718794.
  13. ^ Моримото Т., Энми Джи, Хаттори Ю., Игучи С., Сайто С., Харада К. Х. и др. (Февраль 2018). «Нарушение регуляции RNF213 способствует гипоперфузии головного мозга». Научные отчеты. 8 (1): 3607. Дои:10.1038 / s41598-018-22064-8. ЧВК  5827518. PMID  29483617.

дальнейшее чтение