RNPS1 - RNPS1

RNPS1
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыRNPS1, E5.1, РНК-связывающий белок с богатым серином доменом 1
Внешние идентификаторыOMIM: 606447 MGI: 97960 ГомолоГен: 40648 Генные карты: RNPS1
Расположение гена (человек)
Хромосома 16 (человек)
Chr.Хромосома 16 (человек)[1]
Хромосома 16 (человек)
Геномное расположение RNPS1
Геномное расположение RNPS1
Группа16p13.3Начните2,253,116 бп[1]
Конец2,268,397 бп[1]
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001286625
NM_001286626
NM_001286627
NM_006711
NM_080594

NM_001080127
NM_001080128
NM_009070
NM_001357626

RefSeq (белок)

NP_001273554
NP_001273555
NP_001273556
NP_006702
NP_542161

NP_001073596
NP_001073597
NP_033096
NP_001344555

Расположение (UCSC)Chr 16: 2.25 - 2.27 МбChr 17: 24.41 - 24.43 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

РНК-связывающий белок с богатым серином доменом 1 это белок что у людей кодируется RNPS1 ген.[5][6][7]

Функция

Этот ген кодирует белок, который является частью мультипротеинового комплекса после сплайсинга, комплекс экзонов, участвующие как в ядерном экспорте мРНК, так и в надзоре за мРНК. Наблюдение за мРНК обнаруживает экспортированные мРНК с усеченными открытыми рамками считывания и инициирует нонсенс-опосредованный распад мРНК (NMD). Когда трансляция заканчивается выше последнего соединения экзон-экзон, это запускает NMD для разрушения мРНК, содержащей преждевременные стоп-кодоны. Этот белок связывается с мРНК и остается связанным после ядерного экспорта, действуя как ядерно-цитоплазматический челночный белок. Этот белок содержит много остатков серина. Для этого гена были обнаружены два варианта сплайсинга; оба варианта кодируют один и тот же белок.[7]

Взаимодействия

RNPS1 был показан взаимодействовать с участием SART3[8] и Пинин.[9][10]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000205937 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034681 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Loyer P, Trembley JH, Lahti JM, Kidd VJ (июнь 1998 г.). «Белок RNP, RNPS1, ассоциируется со специфическими изоформами p34cdc2-родственной протеинкиназы PITSLRE in vivo». Журнал клеточной науки. 111 (Pt 11) (11): 1495–506. PMID  9580558.
  6. ^ Бадолато Дж., Гардинер Э., Моррисон Н., Эйсман Дж. (Декабрь 1995 г.). «Идентификация и характеристика нового человеческого РНК-связывающего белка». Ген. 166 (2): 323–7. Дои:10.1016/0378-1119(95)00571-4. PMID  8543184.
  7. ^ а б «Ген Entrez: РНК-связывающий белок S1 RNPS1, богатый серином домен».
  8. ^ Харада К., Ямада А., Ян Д., Ито К., Шичиджо С. (сентябрь 2001 г.). «Связывание антигена отторжения опухоли SART3 с пре-мРНК фактором сплайсинга RNPS1: возможное регулирование сплайсинга путем образования комплекса». Международный журнал рака. 93 (5): 623–8. Дои:10.1002 / ijc.1391. PMID  11477570. S2CID  24724555.
  9. ^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
  10. ^ Ли К., Линь Р., Лай М.К., Оуян П., Тарн, Вайоминг (октябрь 2003 г.). «Ядерный белок Pnn / DRS связывается со сплайсированными мРНП и участвует в процессинге и экспорте мРНК посредством взаимодействия с RNPS1». Молекулярная и клеточная биология. 23 (20): 7363–76. Дои:10.1128 / MCB.23.20.7363-7376.2003. ЧВК  230327. PMID  14517304.

дальнейшее чтение

внешние ссылки

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q15287 (РНК-связывающий белок с богатым серином доменом 1) на PDBe-KB.