RhoBTB - RhoBTB

Связанный с Rho домен BTB, содержащий 1
Идентификаторы
СимволRHOBTB1
Ген NCBI9886
HGNC18738
OMIM607351
RefSeqNM_014836
UniProtO94844
Прочие данные
LocusChr. 10 q22.1
Rho-связанный домен BTB, содержащий 2
Идентификаторы
СимволRHOBTB2
Ген NCBI23221
HGNC18756
OMIM607352
RefSeqNM_001160036
UniProtQ9BYZ6
Прочие данные
LocusChr. 8 p21.2
Rho-связанный домен BTB, содержащий 3
Идентификаторы
СимволRHOBTB3
Ген NCBI22836
HGNC18757
OMIM607353
RefSeqNM_014899
UniProtO94955
Прочие данные
LocusChr. 5 q15

В RhoBTB семья является подгруппой Семья Ро малых GTPases. Это очень разные классы, и все они N-концевой Rho-связанный домен за которым следует по крайней мере один C-терминал BTB домен.

Открытие

Семейство RhoBTB молекулы был неосознанно обнаружен в 1993 году при анализе генома Dictyostelium в поисках членов суперсемейства Ras GTPases. Авторы начали с того, что Саузерн-блоты находясь в поиске кДНК которые перекрестно гибридизуются с очень консервативным зондом из hRas.[1] Выявлено 19 новых гены что принадлежало Рас надсемейством и секвенировали примерно 600 нуклеотидов от начала транскрипта.[1] Если бы они искали нормальную Ras-подобную GTPase, этого было бы достаточно. Один из их клонов, который они назвали RacA, был более дивергентным, чем большинство других, и транскрипт не заканчивался стоп-кодоном, как остальные.[1] Однако авторы не комментировали это, и RhoBTB оставался незамеченным еще восемь лет.

В результате очень тщательного анализа, проведенного Франсиско Риверо и его коллегами, были обнаружены все ГТФазы Rho в Dictyostelium. В ходе своих исследований они обнаружили, что открытая рамка считывания RacA на самом деле на 400 аминокислот длиннее, чем то, что Буш опубликовал 8 годами ранее.[2] Вместо белка из 168 аминокислот RacA кодирует белок из 598 остатков с доменом Rho GTPase на N-конце и двумя доменами BTB на C-конце. Известно, что домены BTB (Broad-Complex, Tramtrack и Bric-a-Brac) включают гетеро и гомо ассоциации с другими белками, содержащими домен BTB.[3][4] Поскольку этот новый белок RhoBTB был в Dictostelium, авторам было любопытно, существуют ли какие-либо гомологичные белки у людей. Они нашли троих и позвонили им RhoBTB1, RhoBTB2, и RhoBTB3.[2]

Локализация и выражение

RhoBTB1 и RhoBTB2 намного более гомологичны, чем RhoBTB3.[2] Дальнейший анализ показал, что интрон-экзонная структура RhoBTB1 и 2 также весьма схожа и имеет только один общий интрон с RhoBTB3.[5]

RhoBTB1 и 2 не были обнаружены во время развития мышей, но RhoBTB3 сильно выявлялся между 11,5 и 17,5 днями эмбриона.[5] Кроме того, RhoBTB1 и 2 локализуются в везикулярных структурах,[6] в то время как RhoBTB3 локализован в сети транс-Гольджи.[7]

использованная литература

  1. ^ а б c Буш Дж., Франек К., Карделли Дж. (Декабрь 1993 г.). «Клонирование и характеристика семи новых rac-генов Dictyostelium discoideum, принадлежащих к семейству Rho GTPases». Ген. 136 (1–2): 61–8. Дои:10.1016 / 0378-1119 (93) 90448-C. PMID  8294042.
  2. ^ а б c Риверо Ф., Дислич Х., Глёкнер Г., Ноегель А.А. (март 2001 г.). «Семейство Rho-родственных белков Dictyostelium discoideum». Нуклеиновые кислоты Res. 29 (5): 1068–79. Дои:10.1093 / nar / 29.5.1068. ЧВК  29714. PMID  11222756.
  3. ^ Zollman S, Godt D, Privé GG, Couderc JL, Laski FA (октябрь 1994 г.). «Домен BTB, обнаруженный в основном в белках цинковых пальцев, определяет эволюционно консервативное семейство, которое включает несколько генов, регулируемых развитием у дрозофилы». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 91 (22): 10717–21. Дои:10.1073 / пнас.91.22.10717. ЧВК  45093. PMID  7938017.
  4. ^ Ахмад К.Ф., Энгель К.К., Privé GG (октябрь 1998 г.). «Кристаллическая структура домена BTB из PLZF». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (21): 12123–8. Дои:10.1073 / pnas.95.21.12123. ЧВК  22795. PMID  9770450.
  5. ^ а б Рамос С., Хадеми Ф., Сомеш Б.П., Риверо Ф. (октябрь 2002 г.). «Геномная организация и профиль экспрессии малых GTPases семейства RhoBTB у человека и мыши». Ген. 298 (2): 147–57. Дои:10.1016 / S0378-1119 (02) 00980-0. PMID  12426103.
  6. ^ Аспенстрём П., Франссон А., Сарас Дж. (Январь 2004 г.). «Rho GTPases оказывают разнообразное влияние на организацию системы актиновых филаментов». Biochem. J. 377 (Pt 2): 327–37. Дои:10.1042 / BJ20031041. ЧВК  1223866. PMID  14521508.
  7. ^ Эспиноза Э.Дж., Калеро М., Шридеви К., Пфеффер С.Р. (май 2009 г.). «RhoBTB3: АТФаза семейства Rho GTPase, необходимая для транспортировки эндосомы к Гольджи». Ячейка. 137 (5): 938–48. Дои:10.1016 / j.cell.2009.03.043. ЧВК  2801561. PMID  19490898.