Семейство RhoBTB молекулы был неосознанно обнаружен в 1993 году при анализе генома Dictyostelium в поисках членов суперсемейства Ras GTPases. Авторы начали с того, что Саузерн-блоты находясь в поиске кДНК которые перекрестно гибридизуются с очень консервативным зондом из hRas.[1] Выявлено 19 новых гены что принадлежало Рас надсемейством и секвенировали примерно 600 нуклеотидов от начала транскрипта.[1] Если бы они искали нормальную Ras-подобную GTPase, этого было бы достаточно. Один из их клонов, который они назвали RacA, был более дивергентным, чем большинство других, и транскрипт не заканчивался стоп-кодоном, как остальные.[1] Однако авторы не комментировали это, и RhoBTB оставался незамеченным еще восемь лет.
В результате очень тщательного анализа, проведенного Франсиско Риверо и его коллегами, были обнаружены все ГТФазы Rho в Dictyostelium. В ходе своих исследований они обнаружили, что открытая рамка считывания RacA на самом деле на 400 аминокислот длиннее, чем то, что Буш опубликовал 8 годами ранее.[2] Вместо белка из 168 аминокислот RacA кодирует белок из 598 остатков с доменом Rho GTPase на N-конце и двумя доменами BTB на C-конце. Известно, что домены BTB (Broad-Complex, Tramtrack и Bric-a-Brac) включают гетеро и гомо ассоциации с другими белками, содержащими домен BTB.[3][4] Поскольку этот новый белок RhoBTB был в Dictostelium, авторам было любопытно, существуют ли какие-либо гомологичные белки у людей. Они нашли троих и позвонили им RhoBTB1, RhoBTB2, и RhoBTB3.[2]
Локализация и выражение
RhoBTB1 и RhoBTB2 намного более гомологичны, чем RhoBTB3.[2] Дальнейший анализ показал, что интрон-экзонная структура RhoBTB1 и 2 также весьма схожа и имеет только один общий интрон с RhoBTB3.[5]
RhoBTB1 и 2 не были обнаружены во время развития мышей, но RhoBTB3 сильно выявлялся между 11,5 и 17,5 днями эмбриона.[5] Кроме того, RhoBTB1 и 2 локализуются в везикулярных структурах,[6] в то время как RhoBTB3 локализован в сети транс-Гольджи.[7]
использованная литература
^ абcБуш Дж., Франек К., Карделли Дж. (Декабрь 1993 г.). «Клонирование и характеристика семи новых rac-генов Dictyostelium discoideum, принадлежащих к семейству Rho GTPases». Ген. 136 (1–2): 61–8. Дои:10.1016 / 0378-1119 (93) 90448-C. PMID8294042.
^ абРамос С., Хадеми Ф., Сомеш Б.П., Риверо Ф. (октябрь 2002 г.). «Геномная организация и профиль экспрессии малых GTPases семейства RhoBTB у человека и мыши». Ген. 298 (2): 147–57. Дои:10.1016 / S0378-1119 (02) 00980-0. PMID12426103.