SFRS2 - Википедия - SFRS2

SRSF2
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2КН4, 2LEA, 2LEB, 2LEC
Идентификаторы
Псевдонимы	SRSF2, PR264, SC-35, SC35, SFRS2, SFRS2A, SRp30b, фактор сплайсинга 2, богатый серином / аргинином, фактор сплайсинга 2, богатый серином и аргинином
Внешние идентификаторы	OMIM: 600813 MGI: 98284 ГомолоГен: 37721 Генные карты: SRSF2
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 17 (человек)
Конец	76,737,374 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 11 (мышь)
Конец	116,853,094 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание нуклеиновой кислоты; • Связывание РНК; • связывание протеинкиназы C; • связывание пре-мРНК;
Сотовый компонент	• Тело PML; • ядерное пятнышко; • нуклеоплазма; • внеклеточная экзосома; • ядро клетки; • цитозоль; • сплайсосомальный комплекс; • межхроматиновая гранула; • цитоплазма;
Биологический процесс	• Сплайсинг мРНК через сплайсосомы; • прекращение транскрипции РНК-полимеразы II; • обработка мРНК; • экспорт мРНК из ядра; • Сплайсинг РНК; • Обработка 3'-конца мРНК; • Экспорт РНК из ядра; • отрицательная регуляция транскрипции с использованием шаблона нуклеиновой кислоты; • GO: 0007067 митотический клеточный цикл; • регуляция альтернативного сплайсинга мРНК через сплайсосомы; • ответ на витамин Е; • регуляция сплайсинга РНК; • цис-сплайсинг мРНК через сплайсосомы;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6427
	20382
	ENSG00000161547
	ENSMUSG00000034120
	Q01130
	Q62093
	NM_001195427; NM_003016
	NM_011358
	NP_001182356; NP_003007
	NP_035488
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Фактор сплайсинга, богатый аргинином / серином 2 это белок что у людей кодируется SFRS2 ген.^[5]^[6]^[7]

Взаимодействия

SFRS2 был показан взаимодействовать с CDC5L^[8] и ASF / SF2.^[9]

дальнейшее чтение

Sureau A, Soret J, Vellard M, Crochet J, Perbal B (декабрь 1992 г.). «Связь PR264 / c-myb: экспрессия фактора сплайсинга, модулируемого ядерным протоонкогеном». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 89 (24): 11683–7. Дои:10.1073 / пнас.89.24.11683. ЧВК 50620. PMID 1465383.
Веллард М., Бюро А, Сорет Дж, Мартинери С., Пербал Б. (апрель 1992 г.). «Потенциальный фактор сплайсинга кодируется противоположной цепью транс-сплайсированного экзона c-myb». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 89 (7): 2511–5. Дои:10.1073 / pnas.89.7.2511. ЧВК 48691. PMID 1557353.
Захлер AM, Lane WS, Stolk JA, Roth MB (май 1992 г.). «Белки SR: консервативное семейство факторов сплайсинга пре-мРНК». Гены и развитие. 6 (5): 837–47. Дои:10.1101 / gad.6.5.837. PMID 1577277.
DuBridge RB, Tang P, Hsia HC, Leong PM, Miller JH, Calos MP (январь 1987 г.). «Анализ мутации в клетках человека с использованием системы челнока вируса Эпштейна-Барра». Молекулярная и клеточная биология. 7 (1): 379–87. Дои:10.1128 / mcb.7.1.379. ЧВК 365079. PMID 3031469.
Tacke R, Manley JL (июль 1995 г.). «Факторы сплайсинга человека ASF / SF2 и SC35 обладают различными, функционально значимыми специфичностями связывания РНК». Журнал EMBO. 14 (14): 3540–51. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07360.x. ЧВК 394422. PMID 7543047.
Лузник Л., Мартоне М.Э., Краус Г., Чжан Ю., Сюй Ю., Эллисман М. Х., Вонг-Стаал Ф. (июль 1995 г.). «Локализация вируса иммунодефицита человека Rev в трансфицированных и инфицированных вирусом клетках». Исследования СПИДа и ретровирусы человека. 11 (7): 795–804. Дои:10.1089 / помощь.1995.11.795. PMID 7546906.
Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Кохц Дж. Д., Джеймисон С. Ф., Уилл С. Л., Цзо П., Люрманн Р., Гарсия-Бланко М. А., Мэнли Дж. Л. (март 1994 г.). «Белковые взаимодействия и распознавание 5'-сайтов сплайсинга в предшественниках мРНК млекопитающих». Природа. 368 (6467): 119–24. Дои:10.1038 / 368119a0. PMID 8139654. S2CID 4283089.
Wu JY, Maniatis T (декабрь 1993 г.). «Специфические взаимодействия между белками, участвующими в выборе сайта сплайсинга, и регулируемым альтернативным сплайсингом». Клетка. 75 (6): 1061–70. Дои:10.1016 / 0092-8674 (93) 90316-И. PMID 8261509. S2CID 22951690.
Бюро А, Пербал Б. (февраль 1994 г.). «Несколько мРНК с вариабельными 3'-нетранслируемыми областями и разной стабильностью кодируют человеческий фактор сплайсинга PR264 / SC35». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 91 (3): 932–6. Дои:10.1073 / пнас.91.3.932. ЧВК 521427. PMID 8302870.
Fu XD (сентябрь 1993 г.). «Специфическая приверженность различных пре-мРНК к сплайсингу одиночными белками SR». Природа. 365 (6441): 82–5. Дои:10.1038 / 365082a0. PMID 8361546. S2CID 4332012.
Чжан WJ, Wu JY (октябрь 1996 г.). «Функциональные свойства p54, нового белка SR, активного в конститутивном и альтернативном сплайсинге». Молекулярная и клеточная биология. 16 (10): 5400–8. Дои:10.1128 / MCB.16.10.5400. ЧВК 231539. PMID 8816452.
Tronchère H, Wang J, Fu XD (июль 1997 г.). «Белок, связанный с фактором сплайсинга U2AF35, который взаимодействует с белками U2AF65 и SR при сплайсинге пре-мРНК». Природа. 388 (6640): 397–400. Дои:10.1038/41137. PMID 9237760. S2CID 4386808.
Sureau A, Soret J, Guyon C, Gaillard C, Dumon S, Keller M, Crisanti P, Perbal B (ноябрь 1997 г.). «Характеристика множества альтернативных РНК, возникающих в результате антисмысловой транскрипции гена фактора сплайсинга PR264 / SC35». Исследования нуклеиновых кислот. 25 (22): 4513–22. Дои:10.1093 / nar / 25.22.4513. ЧВК 147067. PMID 9358160.
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Чжан WJ, Wu JY (февраль 1998 г.). «Sip1, новый белок, содержащий домен RS, необходимый для сплайсинга пре-мРНК». Молекулярная и клеточная биология. 18 (2): 676–84. Дои:10.1128 / mcb.18.2.676. ЧВК 108778. PMID 9447963.
Имаи Ю., Мацуо Н., Огава С., Тохьяма М., Такаги Т. (январь 1998 г.). «Клонирование гена YT521 для нового белка, связанного со сплайсингом РНК, индуцированного гипоксией / реоксигенацией». Исследование мозга. Молекулярные исследования мозга. 53 (1–2): 33–40. Дои:10.1016 / S0169-328X (97) 00262-3. PMID 9473574.
Парфенов В.Н., Дэвис Д.С., Почукалина Г.Н., Костючек Д., Мурти К.Г. (апрель 1998 г.). «Динамика распределения компонентов сплайсинга относительно транскрипционного состояния ооцитов человека из антральных фолликулов». Журнал клеточной биохимии. 69 (1): 72–80. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19980401) 69: 1 <72 :: AID-JCB8> 3.0.CO; 2-S. PMID 9513048.

внешняя ссылка

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q01130 (Фактор сплайсинга, богатый серином / аргинином 2) на PDBe-KB.

Эта статья о ген на хромосома человека 17 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000161547 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034120 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid8530103-5] Бермингем-младший, Арден К.С., Наумова А.К., Сапиенца С., Виарс С.С., Фу XD, Хотц Дж., Мэнли Дж. Л., Розенфельд М.Г. (сентябрь 1995 г.). «Хромосомная локализация генов мыши и человека, кодирующих факторы сплайсинга ASF / SF2 (SFRS1) и SC-35 (SFRS2)». Геномика. 29 (1): 70–9. Дои:10.1006 / geno.1995.1216. PMID 8530103.

[pmid1373910-6] Fu XD, Maniatis T (апрель 1992 г.). «Выделение комплементарной ДНК, кодирующей фактор сплайсинга SC35 млекопитающих». Наука. 256 (5056): 535–8. Дои:10.1126 / science.1373910. PMID 1373910.

[entrez-7] «Ген Entrez: фактор сплайсинга SFRS2, аргинин / серин-богатый 2».

[pmid11101529-8] Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ человеческого комплекса CDC5L и идентификация его компонентов с помощью масс-спектрометрии». Журнал EMBO. 19 (23): 6569–81. Дои:10.1093 / emboj / 19.23.6569. ЧВК 305846. PMID 11101529.

[pmid8816452-9] Чжан WJ, Wu JY (октябрь 1996 г.). «Функциональные свойства p54, нового белка SR, активного в конститутивном и альтернативном сплайсинге». Молекулярная и клеточная биология. 16 (10): 5400–8. Дои:10.1128 / MCB.16.10.5400. ЧВК 231539. PMID 8816452.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

SFRS2 - Википедия - SFRS2

Содержание

Взаимодействия

Рекомендации

дальнейшее чтение

внешняя ссылка