SMIM11A - Википедия - SMIM11A

СМИМ11А, или небольшой интегральный мембранный белок 11А, представляет собой белок который у человека кодируется C21orf51 ген.[1][2][3]

Ген

Locus

SMIM11A расположен в 21q22.11 на плюсовой цепи хромосомы 21 и имеет 4 экзоны.[3] SMIM11A находится на чувственная нить и простирается от базовых 34 375 450 до 34 402 777.

Экспрессия SMIM11A в образцах тканей человека

Выражение

Выражение СМИМ11А самый высокий в мозг, щитовидная железа, и желудок, хотя он также экспрессируется во многих других тканях.[3]

мРНК

Нет известных вариантов транскриптов или изоформ SMIM11A.[4]

Протеин

Белок SMIM11A состоит из 58 аминокислот. Теоретическая молекулярный вес этого белка составляет 6 кДа, а теоретическая число Пи это 9.[5] Белок локализован в цитоплазме и митохондриях, а также в точках сцепления между клетками.[6][7]

Домены, мотивы и Посттрансляционные модификации

SMIM11A содержит трансмембранный домен.[8]. Белок также содержит мотив дилейцина. Посттрансляционные модификации включают убиквитилирование сайт, а также два фосфорилированный сайты, один на треонине и один на серине[9][10]

Вторичная структура и Третичная структура

Белок состоит в основном из альфа-спиралей.[11] N-конец SMIM11A торчит во внеклеточный матрикс, в то время как C-конец расположен в цитоплазме клетки.[12]

Третичная структура SMIM11A

Четвертичная структура и белковые взаимодействия

Экспериментально определенные белковые взаимодействия для SMIM11A еще не идентифицированы. .[13]

Концептуальный перевод SMIM11A

Гомология и эволюция

Паралоги

Для SMIM11A не существует паралогов или паралогичных доменов.

Ортологи

SMIM11A имеет большое количество ортологов. Эти ортологи варьируются от других млекопитающих до птиц, рептилий, амфибий и костистых рыб.[14]

Таблица ортологов SMIM11A

Рекомендации

  1. ^ "SMIM11A - малый интегральный мембранный белок 11A - Homo sapiens (человек) - ген и белок SMIM11A". www.uniprot.org. UniProt. Получено 2019-05-20.
  2. ^ «RCSB PDB - Gene View - SMIM11A - малый интегральный мембранный белок 11A». www.rcsb.org. Банк данных белков. Получено 2019-05-20.
  3. ^ а б c "SMIM11A малый интегральный мембранный белок 11A [Homo sapiens (человек)]". ncbi.nlm.nih.gov. Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Кодирование белка SMIM11A». genecards.org.
  5. ^ "Compute pI / Mw Tool Expasy". expasy.org.
  6. ^ «Сервер PSORT II». psort.hgc.jp.
  7. ^ «Иммуногистохимия SMIM11A: Атлас белков человека». proteinatlas.org.
  8. ^ «Малый интегральный мембранный белок 11A (SMIM11A) человека (Homo sapiens), мРНК». ncbi.nlm.nih.gov. NCBI (Национальный центр биотехнологической информации).
  9. ^ «Отчет iPTMnet для P58511 (SMIM11A)». research.bioinformatics.udel.edu.
  10. ^ "Сервер NetPhos 3.1". cbs.dtu.dk.
  11. ^ "Результаты Phyre2". sbg.bio.ic.ac.uk.
  12. ^ «Сервер ТМХХМ». cbs.dtu.dk.
  13. ^ "STRING FAM165B". string-db.org.
  14. ^ "NCBI Protein Blast". blast.ncbi.nlm.nih.gov.