SNAI2 - SNAI2

SNAI2
Идентификаторы
ПсевдонимыSNAI2, SLUG, SLUGH1, SNAIL2, WS2D, репрессор транскрипции 2 семейства улиток, SLUGH
Внешние идентификаторыOMIM: 602150 MGI: 1096393 ГомолоГен: 31127 Генные карты: SNAI2
Расположение гена (человек)
Хромосома 8 (человек)
Chr.Хромосома 8 (человек)[1]
Хромосома 8 (человек)
Геномное расположение для SNAI2
Геномное расположение для SNAI2
Группа8q11.21Начните48,917,598 бп[1]
Конец48,921,740 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE SNAI2 213139 at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_003068

NM_011415

RefSeq (белок)

NP_003059

NP_035545

Расположение (UCSC)Chr 8: 48.92 - 48.92 МбChr 16: 14.71 - 14.71 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белок цинковых пальцев SNAI2 это фактор транскрипции что у людей кодируется SNAI2 ген. Он способствует дифференцировке и миграции определенных клеток и играет роль в инициировании гаструляция.[5][6][7]

Функция

Этот ген кодирует члена суперсемейства Snail типа C2H2. цинковый палец факторы транскрипции. Кодируемый белок действует как транскрипционный репрессор, который привязан к Электронная коробка мотивы, а также могут подавлять E-кадгерин транскрипция при раке груди. Этот белок участвует в эпителиально-мезенхимальные переходы и имеет антиапоптотический Мероприятия. Он регулирует дифференциацию и миграцию нервный гребень клетки вместе с другими генами (например, FOXD3, SOX9 и SOX10, БМП ) в эмбриональной жизни. Мутации в этом гене могут быть связаны со спорадическими случаями нервная трубка дефекты.[7][8]

SNAI2 подавляет экспрессию E-кадгерина в премиграторных клетках нервного гребня; таким образом, SNAI2 заставляет плотно связанные эпителиальные клетки превращаться в рыхлый мезенхимальный фенотип, позволяя гаструлировать мезодерма в развивающемся эмбрионе.[9][10] Структурно похож на антиапоптотический ЦЕС-1 в C. elegans, SLUG является негативным регулятором гибели продуктивных клеток у развивающегося эмбриона и взрослых.[9][11]

Клиническое значение

SLUG, широко экспрессирующийся в тканях человека, наиболее заметно отсутствует в лейкоцитах периферической крови, печени взрослых и тканях мозга как плода, так и взрослого.[11] SLUG играет роль в карциноме молочной железы, а также в лейкемии, подавляя E-кадгерин, который поддерживает мезенхимальный фенотип, сдвигая экспрессию с профиля кадгерина типа I на тип II.[11][12] Поддержание мезенхимального фенотипа делает возможным метастазирование опухолевых клеток, хотя SLUG экспрессируется в карциномах независимо от инвазивности.[9][10][11] Модель нокаута с использованием куриных эмбрионов также показала ингибирование расслоения мезодермы и нервного гребня; Куриный эмбрион Усиление функции слизняков, по-видимому, увеличивает продукцию нервного гребня.[9] Мутации в Slug связаны с потерей беременности во время гаструляции у некоторых животных.[9]

Взаимодействия

BMP предшествуют экспрессии SLUG и считаются непосредственными индукторами экспрессии генов.[10][13]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000019549 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022676 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Рим Х., Савагнер П., Тибодо Г., Тиери Дж. П., Паван В. Дж. (Январь 1998 г.). «Локализация фактора транскрипции нервного гребня, Slug, в хромосоме 16 мыши и хромосоме 8 человека». Геном млекопитающих. 8 (11): 872–3. Дои:10.1007 / s003359900601. PMID  9337409. S2CID  2177885.
  6. ^ Коэн М.Э., Инь М., Пазнекас В.А., Шерцер М., Вуд С., Джабс Е.В. (август 1998 г.). «Человеческая организация гена SLUG, экспрессия и расположение хромосомной карты на 8q». Геномика. 51 (3): 468–71. Дои:10.1006 / geno.1998.5367. PMID  9721220.
  7. ^ а б "Ген Entrez: SNAI2 гомолог 2 улитки (Drosophila)".
  8. ^ Stegmann, K .; Boecker, J .; Kosan, C .; Ermert, A .; Kunz, J .; Кох, М.С. (август 1999 г.). «Человеческий фактор транскрипции SLUG: анализ мутаций у пациентов с дефектами нервной трубки и идентификация миссенс-мутации (D119E) в области, определяющей подсемейство Slug». Мутационные исследования. 406 (2–4): 63–69. Дои:10.1016 / с 1383-5726 (99) 00002-3. ISSN  0027-5107. PMID  10479723.
  9. ^ а б c d е Nieto MA (март 2002 г.). "Суперсемейство улиток факторов транскрипции цинкового пальца". Обзоры природы Молекулярная клеточная биология. 3 (3): 155–66. Дои:10.1038 / nrm757. PMID  11994736. S2CID  8330951.
  10. ^ а б c Карлсон Б.М. (2013). Эмбриология человека и биология развития (5-е изд.). Филадельфия, Пенсильвания: Elsevier Health Sciences. С. 101–102, 106, 313, 362, 382. ISBN  978-1-4557-2794-0.
  11. ^ а б c d Инукай Т., Иноуэ А., Куросава Х., Гой К., Синдзё Т., Одзава К., Мао М., Инаба Т., Look AT (сентябрь 1999 г.). «SLUG, ген фактора транскрипции цинкового пальца, родственный ces-1, с антиапоптотической активностью, является нижестоящей мишенью онкопротеина E2A-HLF». Молекулярная клетка. 4 (3): 343–52. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80336-6. PMID  10518215.
  12. ^ Каллури Р., Вайнберг Р.А. (июнь 2009 г.). «Основы эпителиально-мезенхимального перехода». Журнал клинических исследований. 119 (6): 1420–8. Дои:10.1172 / jci39104. ЧВК  2689101. PMID  19487818.
  13. ^ Сакаи Д., Вакамацу Ю. (2005). «Регуляторные механизмы формирования нервного гребня». Клетки Ткани Органы. 179 (1–2): 24–35. Дои:10.1159/000084506. PMID  15942190. S2CID  1886380.

дальнейшее чтение