SS18L1 - SS18L1

SS18L1
Идентификаторы
ПсевдонимыSS18L1, CREST, LP2261, субъединица комплекса ремоделирования хроматина nBAF, субъединица SS18L1 комплекса ремоделирования хроматина BAF
Внешние идентификаторыOMIM: 606472 MGI: 2444061 ГомолоГен: 9191 Генные карты: SS18L1
Расположение гена (человек)
Хромосома 20 (человек)
Chr.Хромосома 20 (человек)[1]
Хромосома 20 (человек)
Геномное расположение SS18L1
Геномное расположение SS18L1
Группа20q13.33Начинать62,143,769 бп[1]
Конец62,182,514 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE SS18L1 213140 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001301778
NM_015558
NM_198935

NM_178750

RefSeq (белок)

NP_001288707
NP_945173

NP_848865

Расположение (UCSC)Chr 20: 62.14 - 62.18 МбChr 2: 180.04 - 180.07 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

SS18-подобный белок 1 это белок что у людей кодируется SS18L1 ген.[5]

Функция

Синовиальные саркомы чаще всего возникают в конечностях вокруг крупных суставов. Более чем в 90% случаев наблюдается повторяющаяся и специфическая хромосомная транслокация t (X; 18) (p11.2; q11.2), в которой 5-первичный конец SS18 ген слит в рамке с 3-простым концом SSX1, SSX2, или же SSX4 ген. Ген SS18L1 гомологичен SS18.[5]

Взаимодействия

SS18L1 был показан взаимодействовать с CREB-связывающий белок.[6] Биохимические исследования показывают, что SS18L1 взаимодействует с несколькими компонентами комплекса ремоделирования хроматина SWI / SNF человека.[7]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000184402 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039086 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Ген Entrez: ген транслокации синовиальной саркомы SS18L1 на хромосоме 1, подобной 18».
  6. ^ Айзава Х., Ху С.К., Бобб К., Балакришнан К., Инс Г., Гуревич И., Коуэн М., Гош А. (январь 2004 г.). «Развитие дендритов регулируется CREST, активатором транскрипции, регулируемым кальцием». Наука. 303 (5655): 197–202. Bibcode:2004Наука ... 303..197А. Дои:10.1126 / science.1089845. PMID  14716005. S2CID  20879721.
  7. ^ Мидделянс Э., Ван Х, Янсен П.В., Шарма В., Стунненберг Х.Г., Логи С. (2012). «SS18 вместе с факторами, специфичными для животных, определяет комплексы SWI / SNF человека BAF-типа». PLOS ONE. 7 (3): e33834. Bibcode:2012PLoSO ... 733834M. Дои:10.1371 / journal.pone.0033834. ЧВК  3307773. PMID  22442726.

дальнейшее чтение