STAMBP - STAMBP

STAMBP
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2XZE, 3РЗУ, 3RZV
Идентификаторы
Псевдонимы	STAMBP, AMSH, MICCAP, связывающий белок STAM
Внешние идентификаторы	OMIM: 606247 MGI: 1917777 ГомолоГен: 4719 Генные карты: STAMBP
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 6 (мышь)
Конец	83,572,729 бп
Генная онтология
Молекулярная функция	• специфическое связывание белкового домена; • связывание ионов металлов; • пептидазная активность; • GO: 0001948 связывание с белками; • тиол-зависимая убиквитин-специфическая протеазная активность; • гидролазная активность; • металлопептидазная активность; • Lys63-специфическая активность деубиквитиназы;
Сотовый компонент	• эндосома; • мембрана; • клеточная мембрана; • нуклеоплазма; • ранняя эндосома; • борозда декольте; • внеклеточная экзосома; • ядро клетки; • цитоплазма; • цитозоль;
Биологический процесс	• отрицательная регуляция апоптотического процесса нейронов; • Каскад JAK-STAT; • митотический цитокинез; • протеолиз; • отрицательная регуляция передачи сигнала белка Ras; • отрицательная регуляция передачи сигналов фосфатидилинозитол-3-киназы; • положительное регулирование пролиферации клеток; • деубиквитинирование белков; • деубиквитинирование, связанное с белком K63;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	10617
	70527
	ENSG00000124356
	ENSMUSG00000006906
	O95630
	Q9CQ26
	NM_006463; NM_201647; NM_213622
	NM_024239; NM_001362078; NM_001362079; NM_001362080
NP_006454; NP_964010; NP_998787; NP_001340896; NP_001340897;
	NP_001340898; NP_001340899; NP_001340900; NP_001340901; NP_001340902; NP_001340903; NP_001340904; NP_001340905
	NP_077201; NP_001349007; NP_001349008; NP_001349009
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

STAM-связывающий белок это белок что у людей кодируется STAMBP ген.^[4]^[5]

Функция

Цитокин-опосредованная передача сигнала в каскаде JAK-STAT требует участия адаптерных молекул. Одна такая передающая сигнал адаптерная молекула содержит домен SH3, который необходим для индукции MYC и роста клеток. Белок, кодируемый этим геном, связывается с SH3-доменом адапторной молекулы, передающей сигнал, и играет критическую роль в опосредованной цитокинами передаче сигналов для индукции MYC и прогрессирования клеточного цикла. Для этого гена было обнаружено множество альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, кодирующих одну и ту же изоформу белка.^[5]

Мутации в этом гене были связаны со случаями микроцефалия (DOI: 10.1038 / нг.2602)

Взаимодействия

STAMBP был показан взаимодействовать с участием RNF11,^[6] Адаптерная молекула, передающая сигнал^[4]^[7] и GRAP2.^[8]^[9]

использованная литература

^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000006906 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ ^а ^б Танака Н., Канеко К., Асао Х., Касаи Х., Эндо Й., Фудзита Т., Такешита Т., Сугамура К. (июль 1999 г.). «Возможное участие новой STAM-ассоциированной молекулы« AMSH »во внутриклеточной передаче сигнала, опосредованной цитокинами». Журнал биологической химии. 274 (27): 19129–35. Дои:10.1074 / jbc.274.27.19129. PMID 10383417.
^ ^а ^б «Ген Entrez: STAMBP STAM-связывающий белок».
^ Ли Х., Сет А. (март 2004 г.). «Комплекс RNF11: Smurf2 опосредует убиквитинирование белка AMSH». Онкоген. 23 (10): 1801–8. Дои:10.1038 / sj.onc.1207319. PMID 14755250.
^ Като М., Миядзава К., Китамура Н. (декабрь 2000 г.). «Деубиквитинирующий фермент UBPY взаимодействует с доменом 3 гомологии Src Hrs-связывающего белка через новый связывающий мотив PX (V / I) (D / N) RXXKP». Журнал биологической химии. 275 (48): 37481–7. Дои:10.1074 / jbc.M007251200. PMID 10982817.
^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламозас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж. Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ Асада Х., Исии Н., Сасаки Й., Эндо К., Касаи Х., Танака Н., Такешита Т., Цучия С., Конно Т., Сугамура К. (май 1999 г.). «Grf40, новый член семейства Grb2, участвует в передаче сигналов Т-клеток посредством взаимодействия с SLP-76 и LAT». Журнал экспериментальной медицины. 189 (9): 1383–90. Дои:10.1084 / jem.189.9.1383. ЧВК 2193052. PMID 10224278.

дальнейшее чтение

Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Ю.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (апрель 1996 г.). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Аналитическая биохимия. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. К., Музни Д. М., Дин Й., Лю В., Рикафренте Д. Ю., Вентланд М. А., Леннон Г., Гиббс Р. А. (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Геномные исследования. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК 139146. PMID 9110174.
Асада Х., Исии Н., Сасаки Й., Эндо К., Касаи Х., Танака Н., Такешита Т., Цучия С., Конно Т., Сугамура К. (май 1999 г.). «Grf40, новый член семейства Grb2, участвует в передаче сигналов Т-клеток посредством взаимодействия с SLP-76 и LAT». Журнал экспериментальной медицины. 189 (9): 1383–90. Дои:10.1084 / jem.189.9.1383. ЧВК 2193052. PMID 10224278.
Эндо К., Такешита Т., Касаи Х., Сасаки Ю., Танака Н., Асао Х, Кикучи К., Ямада М., Ченб М., О'Ши Дж. Дж., Сугамура К. (июль 2000 г.). «STAM2, новый член семейства STAM, связывающийся с киназами Janus». Письма FEBS. 477 (1–2): 55–61. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 01760-9. PMID 10899310. S2CID 31811757.
Ито Ф, Асао Х, Сугамура К., Хелдин Ч., тен Диджке П., Ито С. (август 2001 г.). «Содействие передаче сигналов костного морфогенетического белка посредством отрицательной регуляции ингибирующих Smads». Журнал EMBO. 20 (15): 4132–42. Дои:10.1093 / emboj / 20.15.4132. ЧВК 149146. PMID 11483516.
Исии Н., Овада Й, Ямада М., Миура С., Мурата К., Асао Х., Кондо Х., Сугамура К. (декабрь 2001 г.). «Потеря нейронов в гиппокампе и коре головного мозга мышей с дефицитом AMSH». Молекулярная и клеточная биология. 21 (24): 8626–37. Дои:10.1128 / MCB.21.24.8626-8637.2001. ЧВК 100023. PMID 11713295.
Майтал-Кививис В., Рейс Н., Хофманн К., Гликман М.Х. (2006). «MPN +, предполагаемый каталитический мотив, обнаруженный в подмножестве белков домена MPN от эукариот и прокариот, имеет решающее значение для функции Rpn11». BMC Биохимия. 3: 28. Дои:10.1186/1471-2091-3-28. ЧВК 129983. PMID 12370088.
Ибаррола Н., Кратчмарова И., Накадзима Д., Шиманн В.П., Мустакас А., Панди А., Манн М. (январь 2004 г.). «Клонирование новой сигнальной молекулы, AMSH-2, которая усиливает передачу сигналов трансформирующего фактора роста бета». BMC Cell Biology. 5: 2. Дои:10.1186/1471-2121-5-2. ЧВК 385422. PMID 14728725.
Амброджио XI, Рис, округ Колумбия, Деше Р.Дж. (январь 2004 г.). «JAMM: сайт цинка, подобный металлопротеазе, в протеасоме и сигнальосоме». PLOS Биология. 2 (1): E2. Дои:10.1371 / journal.pbio.0020002. ЧВК 300881. PMID 14737182.
Ли Х., Сет А. (март 2004 г.). «Комплекс RNF11: Smurf2 опосредует убиквитинирование белка AMSH». Онкоген. 23 (10): 1801–8. Дои:10.1038 / sj.onc.1207319. PMID 14755250.
McCullough J, Clague MJ, Urbé S (август 2004 г.). «AMSH - это убиквитинизопептидаза, ассоциированная с эндосомами». Журнал клеточной биологии. 166 (4): 487–92. Дои:10.1083 / jcb.200401141. ЧВК 2172215. PMID 15314065.
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Row PE, Prior IA, McCullough J, Clague MJ, Urbé S (май 2006 г.). «Убиквитинизопептидаза UBPY регулирует эндосомальную динамику убиквитина и имеет важное значение для подавления рецепторов». Журнал биологической химии. 281 (18): 12618–24. Дои:10.1074 / jbc.M512615200. PMID 16520378.
Накамура М., Танака Н., Китамура Н., Комада М. (июнь 2006 г.). «Клатрин закрепляет деубиквитинирующие ферменты, AMSH и AMSH-подобный белок, на ранних эндосомах». Гены в клетки. 11 (6): 593–606. Дои:10.1111 / j.1365-2443.2006.00963.x. PMID 16716190.
Цанг Х. Т., Коннелл Дж. У., Браун С. Е., Томпсон А., Рид Е., Сандерсон С. М. (сентябрь 2006 г.). «Систематический анализ человеческих взаимодействий с белками CHMP: дополнительные белки, содержащие домен MIT, связываются с множеством компонентов человеческого комплекса ESCRT III». Геномика. 88 (3): 333–46. Дои:10.1016 / j.ygeno.2006.04.003. PMID 16730941.

Эта статья о ген на хромосома 2 человека это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCm38Ensembl-1] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000006906 - Ансамбль, Май 2017

[2] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[3] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid10383417-4] а ^б Танака Н., Канеко К., Асао Х., Касаи Х., Эндо Й., Фудзита Т., Такешита Т., Сугамура К. (июль 1999 г.). «Возможное участие новой STAM-ассоциированной молекулы« AMSH »во внутриклеточной передаче сигнала, опосредованной цитокинами». Журнал биологической химии. 274 (27): 19129–35. Дои:10.1074 / jbc.274.27.19129. PMID 10383417.

[entrez-5] а ^б «Ген Entrez: STAMBP STAM-связывающий белок».

[pmid14755250-6] Ли Х., Сет А. (март 2004 г.). «Комплекс RNF11: Smurf2 опосредует убиквитинирование белка AMSH». Онкоген. 23 (10): 1801–8. Дои:10.1038 / sj.onc.1207319. PMID 14755250.

[pmid10982817-7] Като М., Миядзава К., Китамура Н. (декабрь 2000 г.). «Деубиквитинирующий фермент UBPY взаимодействует с доменом 3 гомологии Src Hrs-связывающего белка через новый связывающий мотив PX (V / I) (D / N) RXXKP». Журнал биологической химии. 275 (48): 37481–7. Дои:10.1074 / jbc.M007251200. PMID 10982817.

[pmid16189514-8] Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламозас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж. Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid10224278-9] Асада Х., Исии Н., Сасаки Й., Эндо К., Касаи Х., Танака Н., Такешита Т., Цучия С., Конно Т., Сугамура К. (май 1999 г.). «Grf40, новый член семейства Grb2, участвует в передаче сигналов Т-клеток посредством взаимодействия с SLP-76 и LAT». Журнал экспериментальной медицины. 189 (9): 1383–90. Дои:10.1084 / jem.189.9.1383. ЧВК 2193052. PMID 10224278.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]