STX10 - STX10

STX10
Pdb4dnd.png
Доступные конструкции
PDBПоиск Human UniProt: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSTX10, SYN10, hsyn10, синтаксин 10
Внешние идентификаторыOMIM: 603765 ГомолоГен: 84379 Генные карты: STX10
Расположение гена (человек)
Хромосома 19 (человек)
Chr.Хромосома 19 (человек)[1]
Хромосома 19 (человек)
Геномное расположение STX10
Геномное расположение STX10
Группа19п13.13Начинать13,144,058 бп[1]
Конец13,150,383 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001271609
NM_001271610
NM_001271611
NM_003765

н / д

RefSeq (белок)

NP_001258538
NP_001258539
NP_001258540
NP_003756

н / д

Расположение (UCSC)Chr 19: 13.14 - 13.15 Мбн / д
PubMed поиск[2]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Синтаксин-10 (STX10) - это SNARE белок, который кодируется STX10 ген.[3] Этот белок обнаружен у большинства позвоночных (включая человека), но заметно отсутствует у мышей.[4][5] Как и другие белки SNARE, STX10 способствует слияние пузырьков и поэтому важен для внутриклеточного торговля людьми белков и других клеточных компонентов. Более конкретно, STX10 был вовлечен в эндосома Гольджи незаконный оборот маннозо-6-фосфатный рецептор[4] и транспортер глюкозы тип 4.[5]

STX10 был обнаружен в транс-Гольджи сеть (TGN) по иммунофлуоресценция.[3]

Структура и функции

Человеческий STX10 - это 249 аминокислота белок, который имеет три N-концевой α-спирали и один SNARE домен с последующим однопроходным трансмембранный домен. STX10 человека на 60% идентичен человеческому STX6.[3]

STX10 структурно классифицируется как Qc-SNARE (способствует глутамин (Q) остаток в образовании собранного основного комплекса SNARE) и функционально классифицируется как t-SNARE (или мишень-SNARE, которая часто находится в мембранах целевых компартментов).[6]

Взаимодействия

STX10, как известно, взаимодействует с t-SNARE. VTI1A и STX16[7] и с v-SNARE VAMP3[4] и VAMP4.[7] Комплекс SNARE STX10, STX16, VTI1A и VAMP3 необходимы для позднего переноса эндосомы в Гольджи. маннозо-6-фосфатный рецептор.[4] Ранняя эндосома для переноса токсина шига через Гольджи требует комплекса SNARE из STX6, STX16, VTI1A и VAMP3 или VAMP4.[8]

Т.о., STX10 отличает раннюю эндосому для передачи Гольджи от поздней эндосомы для передачи Гольджи.[4]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000104915 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ а б c Тан BL, Low DY, Tan AE, Hong W. (январь 1998 г.). «Синтаксин 10: член семейства синтаксинов, локализованный в сети транс-Гольджи». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 242 (2): 345–50. Дои:10.1006 / bbrc.1997.7966. PMID  9446797.
  4. ^ а б c d е Ганли И.Г., Эспиноза Э., Пфеффер С.Р. (январь 2008 г.). «Комплекс синтаксин 10-SNARE различает два различных транспортных пути от эндосом до транс-Гольджи в клетках человека» (PDF). Журнал клеточной биологии. 180 (1): 159–72. Дои:10.1083 / jcb.200707136. ЧВК  2213607. PMID  18195106.
  5. ^ а б Esk C, Chen CY, Johannes L, Brodsky FM (январь 2010 г.). «Изоформа тяжелой цепи клатрина CHC22 функционирует на новом этапе эндосомной сортировки». Журнал клеточной биологии. 188 (1): 131–44. Дои:10.1083 / jcb.200908057. ЧВК  2812854. PMID  20065094.
  6. ^ Хонг В (июль 2005 г.). «Ловушки и трафик». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Исследование молекулярных клеток. 1744 (3): 493–517. Дои:10.1016 / j.bbamcr.2005.03.014. PMID  16038056.
  7. ^ а б Ван И, Тай Джи, Лу Л., Йоханнес Л., Хун В., Тан Б.Л. (июль – август 2005 г.). «Синтаксин 10 сети Транс-Гольджи функционирует отдельно от синтаксинов 6 и 16». Молекулярная мембранная биология. 22 (4): 313–25. Дои:10.1080/09687860500143829. PMID  16154903. S2CID  25014829.
  8. ^ Кряква Ф., Тан Б.Л., Галли Т., Тэнза Д., Сен-Поль А., Юэ Х, Энтони С., Хонг В., Гоуд Б., Йоханнес Л. (февраль 2002 г.). «Ранний / рециркулирующий транспорт эндосом в TGN включает два комплекса SNARE и изоформу Rab6». Журнал клеточной биологии. 156 (4): 653–64. Дои:10.1083 / jcb.200110081. ЧВК  2174079. PMID  11839770.

внешняя ссылка

  • PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Human Syntaxin-10 (STX10)