Аналог субстрата - Substrate analog

Для использования в других целях см. Аналог (значения).

Аналоги субстрата (аналоги состояния субстрата), находятся химические соединения с химическая структура которые напоминают молекула субстрата в катализируемый ферментами химическая реакция. Аналоги субстрата могут действовать как конкурентные ингибиторы ферментативной реакции. Примером является фосфорамидат Тетрахимена рибозим I группы[1]

В качестве конкурентного ингибитора аналоги субстрата занимают тот же сайт связывания, что и его аналог, и снижают эффективность предполагаемого субстрата.[2] Vmax остается прежним[3] в то время как сродство предполагаемого субстрата снижается.[4] Это означает, что меньшее количество предполагаемого субстрата будет связываться с ферментом, в результате чего образуется меньше продукта. Кроме того, в аналоге субстрата также могут отсутствовать химические компоненты, которые позволяют ферменту проводить реакцию. Это также приводит к уменьшению количества создаваемого продукта.

Аналоги субстрата обратимо связываются с сайтом связывания. Это означает, что связывание аналога субстрата с сайтом связывания фермента непостоянно. Эффект аналога субстрата можно свести к нулю, увеличив концентрацию первоначально предполагаемого субстрата.[5]

Другие примеры аналогов субстрата включают: 5’-аденилимидодифосфат: субстратный аналог ATP3-ацетилпиридинадениндинуклеотида: субстратный аналог NADH [6]

Некоторые аналоги субстрата могут по-прежнему позволять ферменту синтезировать продукт, несмотря на неспособность фермента метаболизировать аналог субстрата. Эти аналоги субстрата известны как безвозмездные индукторы.[7]

Пример аналога субстрата, который также является безвозмездным индуктором: IPTG (изопропил-β-тиогалактозид: аналог субстрата и бесплатный индуктор активности β-галактозидазы. [8]

Существуют даже аналоги субстратов, которые необратимо связываются с сайтом связывания фермента. В этом случае аналог субстрата называют аналогом ингибирующего субстрата, субстратом самоубийства или даже субстратом троянского коня.[9]

Пример аналога субстрата, который также является субстратом самоубийства / субстратом троянского коня: пенициллин: аналог субстрата и субстрат самоубийства / субстрат троянского коня пептидогликана [10]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Hanna, Raven L .; Грязнов, Сергей М .; Дудна, Дженнифер А. (2000-11-01). «Аналог фосфорамидатного субстрата является конкурентным ингибитором рибозима группы I Tetrahymena». Химия и биология. 7 (11): 845–854. Дои:10.1016 / S1074-5521 (00) 00033-8. ISSN  1074-5521. PMID  11094338.
  2. ^ Гаррет, Реджинальд Х .; Гришэм, Чарльз М. (2013). Биохимия (5-е изд.). Бельмонт, Калифорния: Брукс / Коул, Cengage Learning. п. 108. ISBN  9781133106296
  3. ^ Гаррет, Реджинальд Х .; Гришэм, Чарльз М. (2013). Биохимия (5-е изд.). Бельмонт, Калифорния: Брукс / Коул, Cengage Learning. п. 108. ISBN  9781133106296
  4. ^ Кэннон, Джозеф Г. Фармакология для химиков. Оксфорд: Oxford UP, 2007. Печать. стр70.ISBN  9780841239272
  5. ^ Кэннон, Джозеф Г. Фармакология для химиков. Оксфорд: Oxford UP, 2007. Печать. стр70.ISBN  9780841239272
  6. ^ Штайн, Росс Л. Кинетика действия ферментов: основные принципы для охотников за наркотиками. Хобокен, Нью-Джерси: Джон Вили, 2011. Печать. p185. ISBN  9780470414118
  7. ^ Гаррет, Реджинальд Х .; Гришэм, Чарльз М. (2013). Биохимия (5-е изд.). Бельмонт, Калифорния: Брукс / Коул, Cengage Learning. п. 108. ISBN  9781133106296
  8. ^ Гаррет, Реджинальд Х .; Гришэм, Чарльз М. (2013). Биохимия (5-е изд.). Бельмонт, Калифорния: Брукс / Коул, Cengage Learning. п. 108. ISBN  9781133106296
  9. ^ Гаррет, Реджинальд Х .; Гришэм, Чарльз М. (2013). Биохимия (5-е изд.). Бельмонт, Калифорния: Брукс / Коул, Cengage Learning. п. 108. ISBN  9781133106296
  10. ^ Гаррет, Реджинальд Х .; Гришэм, Чарльз М. (2013). Биохимия (5-е изд.). Бельмонт, Калифорния: Брукс / Коул, Cengage Learning. п. 108. ISBN  9781133106296